Apinarokkoepidemian leviämisdynamiikka Yhdistyneessä kuningaskunnassa

Apinarokkoepidemian leviämisdynamiikka Yhdistyneessä kuningaskunnassa

Äskettäin julkaistussa tutkimuksessa vuonna BMJ, tutkijat analysoivat apinapox (MPX) viruksen (MPXV) leviämisdynamiikkaa Yhdistyneen kuningaskunnan asukkaiden keskuudessa.

Lernen: Übertragungsdynamik von Affenpocken im Vereinigten Königreich: Kontaktverfolgungsstudie. Bildnachweis: Dotted Yeti/Shutterstock

tausta

Vuonna 2022 meneillään oleva MPX-epidemia on vaikuttanut useisiin kansoihin, kuten Isoon-Britanniaan, joissa virus ei ole endeeminen, ja tartunnan saaneet ihmiset, joilla ei ole lähihistoriaa endeemisille alueille, kuten Keski- ja Länsi-Afrikkaan. Heinäkuussa 2022 Maailman terveysjärjestö (WHO) julisti MPX:n maailmanlaajuiseksi kansanterveyden hätätilanteeksi.

Opiskelusta

Tässä tutkimuksessa tutkijat analysoivat MPXV-lähetysdynamiikkaa Isossa-Britanniassa.

Tiedot tapauskontakti-pareista (CC) ja mahdollisista altistumispäivistä (ED) linkitetyistä kontaktien jäljittämisestä ja UKHSA:n (UK Health Security Agency) tapauskyselyistä analysoitiin. CC-parien oireiden alkamispäivät (SOD) tunnistettiin PIN-koodien (pseudotunnistenumeroiden) ja LL:iden (linjaluetteloiden) täsmäämisen perusteella, ja tutkimukseen otettiin mukaan 2 746 polymeraasiketjureaktiolla (PCR) vahvistettua MPX-potilasta 6. toukokuuta ja 1. elokuuta 2022 välisenä aikana.

Ensisijaisena tutkimuksen tuloksena oli määrittää MPX:n SI (sarjaväli) ja IP (inkubaatiojakso) käyttämällä intervallinsensorointikorjattuja (ICC) ja IC right truncation corrected (ICRTC) aikajakaumamalleja. MPX-tapausten kasvun arvioinnissa käytettiin yleistettyä additiivista mallintamista raportointipäiviin saakka (päivämäärä, jolloin vahvistetut tapaukset ilmoitettiin UKHSA:lle).

Jokaisen CC-parin kohdalla yksilö, jolla oli primaarinen MPX-infektio, nimettiin ensisijaiseksi tapaukseksi (PC) ja PC:n tartunnan saanut yksilö nimettiin toissijaiseksi kontaktiksi (SC). Näin ollen CC-pareihin kuului henkilöitä, jotka tapaukset tunnistivat kontakteiksi, joista myöhemmin tuli tapauksia tai jotka olivat jo tapauksia. Viimeinen PC-kontaktipäivä, jonka henkilö ilmoitti kolmen viikon sisällä ennen SOD:ta, katsottiin ED:ksi ja päivämäärä, jolloin oireet ilmenivät, katsottiin SOD:ksi.

PC-SOD-tiedot linkitettiin SC-ED:iin, jotta voidaan tutkia todennäköisiä ED:itä, jotka tapahtuivat ennen SOD:itä PC:issä, mikä osoitti MPXV-lähetyksen ennen oireiden alkamista. CC-parit linkitettiin kunkin SC:n kyselylomakkeen tietueisiin, mikä mahdollisti PC:iden ja ED:iden tunnistamisen SC:ille. PIN-koodeja käytettiin sitten tietokoneiden yhdistämiseen LL:ään SOD-koodien saamiseksi.

Tulokset

Omics e-kirja

Kokoelma viime vuoden huippuhaastatteluista, artikkeleista ja uutisista. Lataa ilmainen kopio

Tutkimukseen osallistuneiden keski-ikä oli 38 vuotta, ja suurin osa (95 %) heistä raportoitiin biseksuaaleina, homoina ja muina MSM-miehinä (miesten kanssa seksiä harrastavina miehinä). 1.8.2022 mennessä on saatu 92 tietuetta (650 kyselylomakkeesta), joissa on täydelliset ED- ja PIN-tiedot, joita tiedon yhdistämiseen tarvitaan. Näistä dokumentoituja CC-linkkejä oli saatavilla 30 tietojoukolle, mikä mahdollisti PC:n tunnistamisen.

LL:ssä 30 tietokoneesta SOD:t dokumentoitiin 19 PC:lle. Yhteensä ilmoitettiin 220 CC-paria, joista 79:llä oli SOD:t molemmilla CC-parin yksilöillä, mikä muodosti SI-kohortin. Kyselylomakkeen täyttäneistä 650 henkilöstä 54 toimitti SOD-tiedot ja viimeisimmän PC-kontaktin päivämäärän, mikä muodosti IP-kohortin.

19 PC-tietojoukosta negatiivinen IP ilmoitettiin kolmessa tietojoukossa, joten ne jätettiin analyysin ulkopuolelle. Jäljelle jäävistä PC-tietueista seitsemän PC:tä toimitti henkilökohtaisia ​​tunnistetietoja (henkilökohtaisia ​​tunnistetietoja) LL:ssä ja kyselylomakkeessa, mikä mahdollisti PC:n varmentamisen. Neljässä (seitsemästä) tapauksesta oli yhtenevä PII, ja kolmen ristiriitaisen parin jättämisen jälkeen jäljelle jäi 13 CC-paria, jotka muodostivat presymptomaattisen MPXV-siirron tutkimuskohortin.

Keskimääräisen IP:n arvioitiin olevan kahdeksan päivää molempia aikaviivemalleja käyttäen, ja keskimääräiseksi SI:ksi arvioitiin kahdeksan päivää ja kymmenen päivää käyttämällä ICC- ja ICRTC-malleja, vastaavasti. Vaikka keskimääräinen SI kesti pidempään kuin IP, lyhyitä SI-arvoja havaittiin useammin kuin lyhyitä IP-jaksoja, ja SI:n mediaani- ja 25. prosenttipisteen arvojen arvioitiin olevan lyhyempiä kuin IP-ajan.

ICRTC- ja ICC-aikajakauman mallinnetut mediaani- ja 25. prosenttipistearvot olivat yhdestä kahteen päivää ja kaksi päivää lyhyempiä. 13:sta linkitetystä MPX-potilaasta kymmenen oli ilmoittanut oireista edeltävästä MPX-tartunnasta. MPX-tapausten kaksinkertaistumisaika lyheni yhdeksästä päivästä 6. toukokuuta 2022, jolloin MPXV havaittiin ensimmäisen kerran Yhdistyneen kuningaskunnan asukkailla, puolittumiseen 29 päivään 1. elokuuta 2022.

Diplomi

Yhteenvetona voidaan todeta, että tutkimustulosten perusteella MPX-epidemian huippu havaittiin Isossa-Britanniassa 9.7.2022, minkä jälkeen tapaukset vähenivät. Lyhyet SI:t havaittiin useammin kuin lyhyitä IP:itä, mikä viittaa merkittävään oireiden edeltävään MPXV:n leviämiseen, joka vahvistettiin linkitetyillä potilaskertomuksilla.

MPXV-infektoituneilla ja PII:hen liittyvillä potilailla maksimikesto, jonka MPXV-tartunta tunnistettiin ennen SO:ta, oli 4,0 päivää. Yksilöt on eristettävä 16-23 päivän ajaksi, jotta 95 % todennäköisestä MPX-potilaista voidaan tunnistaa. SI:n 95. prosenttipisteen havaittiin olevan päivien 23 ja 41 välillä, mikä osoittaa pitkiä MPXV-infektioiden jaksoja.

Viite:

• Ward, T. et al. (2022) „Übertragungsdynamik von Affenpocken im Vereinigten Königreich: Kontaktverfolgungsstudie“, BMJ, p. e073153. doi: 10.1136/bmj-2022-073153. https://www.bmj.com/content/379/bmj-2022-073153

.