Едно проучване показва, че прилепите са подценяван резервоар за аренавируси

Едно проучване показва, че прилепите са подценяван резервоар за аренавируси

В скорошно проучване, публикувано в списанието на американските центрове за контрол и превенция на заболяванията (CDC). Възникващи инфекциозни заболявания екип от изследователи съобщи за откриването на аренавирусна рибонуклеинова киселина (РНК) от различни видове прилепи, взети проби в Бразилия между 2007 и 2011 г.

Lernen: Sehr unterschiedliche Arenaviren in neotropischen Fledermäusen, Brasilien. Bildnachweis: Kateryna Kon/Shutterstock

фон

От четирите рода на вирусното семейство Arenaviridae, Mammarenavirus е единственият род, който заразява бозайниците. Родът е разделен на аренавирусите на Новия свят и серокомплекса на вируса на хориоменингит-Ласа, които са разпространени по целия свят. Някои аренавируси от Новия свят, като вирусите Junin, Chapare, Guanarito, Machupo и Sabia, причиняват хеморагична треска при хората.

Докато патогенните аренавируси обикновено се предават на хората чрез заразени гризачи, Tacaribe mammarynavirus, който се среща в прилепите и не е заразен за хората, е анекдотично известно, че причинява грипоподобни симптоми. Въпреки че е известно, че прилепите са носители на зоонотични вируси, има ограничени епидемиологични доказателства за връзката между прилепите и аренавирусите, състоящи се основно от един изолиран вирус и експериментални инфекции на прилепи.

Въпреки това, тъй като Tacaribe вирусът принадлежи към същата група като вирусите, причиняващи хеморагична треска, които също проявяват имунна евазия и клетъчен тропизъм, не може да се изключи възможността от сериозни инфекции, причинени от Tacaribe вирус.

Относно ученето

В настоящото изследване изследователите са събрали проби от прилепи от югоизточна Бразилия и са анализирали тъканите на далака, белите дробове, червата, бъбреците и черния дроб от пробите. Те събраха общо 1047 прилепа от 32 вида и анализираха 3670 тъканни проби. За да открият аренавирусна РНК, те извършиха обратна транскрипция-полимеразна верижна реакция (RT-PCR) с модифицирани праймери за амплифициране на частични последователности на РНК-зависимия РНК полимеразен ген на аренавирусите от Новия свят.

В допълнение, те използваха базирано на Illumina дълбоко секвениране, за да получат пълни кодиращи последователности на аренавирус от два от събраните видове прилепи. Последователностите, получени от RT-PCR и пълните кодиращи последователности бяха използвани за филогенетични анализи и за определяне на разстоянията на хомогенните последователности.

Резултати

Резултатите показват РНК на аренавирус от 1,62% (17 от 1047) от изследваните прилепи, принадлежащи към три вида - един Artibeus planirostris, четири Artibeus lituratus и 12 Carollia perspicillata. Вирусите от двата вида Artibeus бяха идентифицирани като Tacaribe mammarenavirus, докато вирусът, открит в 12-те проби от Carollia perspicillata, беше идентифициран като нов вид, който авторите нарекоха Tietê mammarenavirus.

Всички проби са събрани в гористи и градски райони в рамките на 60 км една от друга, което показва възможен вирусен резервоар при прилепите в региона. Подобни нива на вирус са открити в тъкани от далака и белия дроб, което предполага системна инфекция. Най-високата концентрация на аренавирус е открита в проба от чревна тъкан, което предполага чревна вирусна екскреция.

Филогенетична реконструкция, базирана на частични РНК-зависими генни последователности на РНК полимераза, разкри две групи аренавируси от Новия свят в Бразилия. Аренавирусите от двата вида Artibeus образуват един клад, докато последователностите от пробите на Carollia perspicillata образуват друг клад. Пълните кодиращи последователности показаха идентична организация на генома с други mammarenaviruses и формираха монофилетична група с Tacaribe вирус, който беше добре поддържан.

Дървото на максималната вероятност, използващо пълните гени за големи сегменти, възстанови цялата клада, съдържаща вируса Tacaribe и последователности от Бразилия като сестра на аренавирусите от Новия свят Junin и Machupo.

Въпреки това, филогенетичният анализ, използващ пълните малки сегментни гени, показа сестринска връзка между вируса Ocozocoautla de Espinosa и кладата, съдържаща бразилските последователности и последователностите на вируса Tacaribe.

Смята се, че вирусът Ocozocoautla de Espinosa е причинил огнище на хеморагична треска в Мексико. Освен това рекомбинационните анализи и разстоянията на последователностите не показват събития на рекомбинация.

Таксономичната оценка на новите вирусни видове от пробите от Carollia perspicillata се основава на сравнения на последователности по двойки с вируса Tacaribe, показващи идентичност на нуклеотидната последователност по-малко от 80% и аминокиселинна идентичност на нуклеокапсиден протеин от 88,6% до 90% и наличието на отделен гостоприемник. Видът е кръстен на река близо до мястото за вземане на проби.

Изводи

В обобщение, проучването изследва видовете прилепи, събрани в югозападна Бразилия за наличието на аренавирусна РНК, използвайки методи за усилване на последователността. Резултатите показват наличието на аренавирусна РНК от три вида прилепи, което представлява 1,62% от общия размер на пробата.

Филогенетичните анализи разкриха, че аренавирусите, открити в пробите от прилепи, са тясно свързани с вируса Tacaribe, аренавирус от Новия свят, открит в прилепите. Един от откритите аренавируси е нов вид и е наречен Tietê Mammarenavirus.

Докато аренавирусите от Новия свят обикновено се срещат при гризачи, резултатите от това проучване показват, че прилепите може да са резервоари за аренавирус и трябва да бъдат допълнително проучени.

Справка:

• Góes LGB, Fischer C, Campos ACA, de Carvalho C, Moreira-Soto A, Ambar G, et al. (2022) Hochgradig vielfältige Arenaviren in neotropischen Fledermäusen, Brasilien. Neu auftretende Infektionskrankheiten. doi: https://doi.org/10.3201/eid2812.220980 https://wwwnc.cdc.gov/eid/article/28/12/22-0980_article

.