Studie naznačuje, že netopýři jsou podceňovaným rezervoárem arenavirů

Studie naznačuje, že netopýři jsou podceňovaným rezervoárem arenavirů

V nedávné studii publikované v časopise amerického Centra pro kontrolu a prevenci nemocí (CDC). Vznikající infekční onemocnění tým výzkumníků oznámil detekci arenavirové ribonukleové kyseliny (RNA) z různých druhů netopýrů odebraných v Brazílii v letech 2007 až 2011.

Lernen: Sehr unterschiedliche Arenaviren in neotropischen Fledermäusen, Brasilien. Bildnachweis: Kateryna Kon/Shutterstock

pozadí

Ze čtyř rodů virové rodiny Arenaviridae je Mammarenavirus jediným rodem, který infikuje savce. Rod se dělí na arenaviry Nového světa a sérokomplex viru choriomeningitis-Lassa, které jsou distribuovány po celém světě. Některé arenaviry Nového světa, jako jsou viry Junin, Chapare, Guanarito, Machupo a Sabia, způsobují u lidí hemoragickou horečku.

Zatímco patogenní arenaviry se obecně přenášejí na člověka prostřednictvím infikovaných hlodavců, o viru Tacaribe mammarynavirus, který se vyskytuje u netopýrů a není infekční pro člověka, je neoficiálně známo, že způsobuje příznaky podobné chřipce. Ačkoli je známo, že netopýři překrývají zoonotické viry, existují omezené epidemiologické důkazy o spojení mezi netopýry a arenaviry, které sestávají především z jediného izolovaného viru a experimentálních infekcí netopýrů.

Protože však virus Tacaribe patří do stejné skupiny jako viry způsobující hemoragickou horečku, které také vykazují imunitní únik a buněčný tropismus, nelze vyloučit možnost závažných infekcí způsobených virem Tacaribe.

O studiu

V této studii výzkumníci shromáždili vzorky netopýrů z jihovýchodní Brazílie a analyzovali ze vzorků tkáně sleziny, plic, střev, ledvin a jater. Odebrali celkem 1047 netopýrů z 32 druhů a analyzovali 3670 vzorků tkání. K detekci arenavirové RNA provedli reverzní transkripčně-polymerázovou řetězovou reakci (RT-PCR) s modifikovanými primery pro amplifikaci dílčích sekvencí genu RNA-dependentní RNA polymerázy arenavirů Nového světa.

Kromě toho použili hluboké sekvenování na bázi Illumina k získání kompletních sekvencí kódujících arenavirus ze dvou shromážděných druhů netopýrů. Sekvence získané z RT-PCR a kompletní kódující sekvence byly použity pro fylogenetické analýzy a pro stanovení vzdáleností homogenních sekvencí.

Výsledky

Výsledky ukázaly RNA arenaviru od 1,62 % (17 z 1 047) zkoumaných netopýrů, které patří ke třem druhům – jednomu Artibeus planirostris, čtyřem Artibeus lituratus a 12 Carollia perspicillata. Viry ze dvou druhů Artibeus byly identifikovány jako Tacaribe mammarenavirus, zatímco virus detekovaný ve 12 vzorcích Carollia perspicillata byl identifikován jako nový druh, který autoři pojmenovali Tietê mammarenavirus.

Všechny vzorky byly odebrány v zalesněných a městských oblastech do 60 km od sebe, což ukazuje na možnou virovou rezervoáru u netopýrů v regionu. Podobné hladiny viru byly nalezeny ve tkáních ze sleziny a plic, což naznačuje systémovou infekci. Nejvyšší koncentrace arenaviru byla nalezena ve vzorku střevní tkáně, což svědčí o enterálním vylučování viru.

Fylogenetická rekonstrukce založená na parciálních RNA-dependentních genových sekvencích RNA polymerázy odhalila dva klady arenavirů Nového světa v Brazílii. Arenaviry ze dvou druhů Artibeus tvořily jeden klad, zatímco sekvence ze vzorků Carollia perspicillata tvořily další klad. Kompletní kódující sekvence vykazovaly identickou organizaci genomu jako jiné mammarenaviry a vytvořily monofyletickou skupinu s virem Tacaribe, která byla dobře podporována.

Strom s maximální pravděpodobností využívající kompletní geny pro velké segmenty obnovil celý klad obsahující virus Tacaribe a sekvence z Brazílie jako sestry arenavirů Junin a Machupo New World.

Fylogenetická analýza s použitím kompletních genů pro malé segmenty však ukázala sesterský vztah mezi virem Ocozocoautla de Espinosa a kladem obsahujícím brazilské sekvence a sekvence viru Tacaribe.

Předpokládá se, že virus Ocozocoautla de Espinosa způsobil vypuknutí hemoragické horečky v Mexiku. Kromě toho rekombinační analýzy a vzdálenosti sekvencí neukázaly rekombinační události.

Taxonomické hodnocení nového druhu viru ze vzorků Carollia perspicillata bylo založeno na párovém srovnání sekvencí s virem Tacaribe, které vykazovalo identitu nukleotidové sekvence méně než 80 % a identitu aminokyselin nukleokapsidového proteinu 88,6 % až 90 % a přítomnost odlišného hostitele. Druh byl pojmenován po řece poblíž místa odběru vzorků.

Závěry

Stručně řečeno, studie zkoumala druhy netopýrů shromážděné v jihozápadní Brazílii na přítomnost RNA arenaviru pomocí metod sekvenční amplifikace. Výsledky ukázaly přítomnost RNA arenaviru ze tří druhů netopýrů, což představuje 1,62 % z celkové velikosti vzorku.

Fylogenetické analýzy odhalily, že arenaviry zjištěné ve vzorcích netopýrů úzce souvisí s virem Tacaribe, arenavirem z Nového světa nalezeným u netopýrů. Jeden z detekovaných arenavirů je nový druh a byl pojmenován Tietê Mammarenavirus.

Zatímco arenaviry Nového světa se obecně vyskytují u hlodavců, výsledky této studie naznačují, že netopýři mohou být rezervoáry arenavirů a je třeba je dále prozkoumat.

Odkaz:

• Góes LGB, Fischer C, Campos ACA, de Carvalho C, Moreira-Soto A, Ambar G, et al. (2022) Hochgradig vielfältige Arenaviren in neotropischen Fledermäusen, Brasilien. Neu auftretende Infektionskrankheiten. doi: https://doi.org/10.3201/eid2812.220980 https://wwwnc.cdc.gov/eid/article/28/12/22-0980_article

.