En undersøgelse tyder på, at flagermus er et undervurderet reservoir for arenavirus

En undersøgelse tyder på, at flagermus er et undervurderet reservoir for arenavirus

I en nylig undersøgelse offentliggjort i tidsskriftet for US Centers for Disease Control and Prevention (CDC). Nye infektionssygdomme et team af forskere rapporterede påvisningen af ​​arenavirus ribonukleinsyre (RNA) fra forskellige flagermusarter, der blev udtaget i Brasilien mellem 2007 og 2011.

Lernen: Sehr unterschiedliche Arenaviren in neotropischen Fledermäusen, Brasilien. Bildnachweis: Kateryna Kon/Shutterstock

baggrund

Af de fire slægter af virusfamilien Arenaviridae er Mammarenavirus den eneste slægt, der inficerer pattedyr. Slægten er opdelt i New World arenaviruses og choriomeningitis-Lassa virus serokomplekset, som er distribueret over hele verden. Nogle New World arenavirus, såsom Junin, Chapare, Guanarito, Machupo og Sabia virus, forårsager hæmoragisk feber hos mennesker.

Mens de patogene arenavirus generelt overføres til mennesker gennem inficerede gnavere, er Tacaribe mammarynavirus, som findes i flagermus og ikke er smitsomt for mennesker, anekdotisk kendt for at forårsage influenzalignende symptomer. Selvom flagermus er kendt for at huse zoonotiske vira, er der begrænset epidemiologisk evidens for sammenhængen mellem flagermus og arenavirus, primært bestående af en enkelt isoleret virus og eksperimentelle infektioner af flagermus.

Men da Tacaribe-virus tilhører samme gruppe som de hæmoragiske feber-fremkaldende vira, som også udviser immununddragelse og celletropisme, kan muligheden for alvorlige infektioner forårsaget af Tacaribe-virus ikke udelukkes.

Om at studere

I denne undersøgelse indsamlede forskere flagermusprøver fra det sydøstlige Brasilien og analyserede milt-, lunge-, tarm-, nyre- og levervæv fra prøverne. De indsamlede i alt 1.047 flagermus fra 32 arter og analyserede 3.670 vævsprøver. For at påvise arenavirus-RNA udførte de omvendt transkription-polymerase-kædereaktion (RT-PCR) med modificerede primere for at amplificere partielle sekvenser af det RNA-afhængige RNA-polymerasegen fra New World arenaviruses.

Derudover brugte de Illumina-baseret dyb sekventering til at opnå komplette arenavirus-kodende sekvenser fra to af de indsamlede flagermusarter. Sekvenserne opnået fra RT-PCR og de komplette kodende sekvenser blev brugt til fylogenetiske analyser og til at bestemme de homogene sekvensafstande.

Resultater

Resultaterne viste arenavirus-RNA fra 1,62 % (17 af 1047) af de undersøgte flagermus, tilhørende tre arter - en Artibeus planirostris, fire Artibeus lituratus og 12 Carollia perspicillata. Vira fra de to Artibeus-arter blev identificeret som Tacaribe mammarenavirus, mens virussen påvist i de 12 prøver af Carollia perspicillata blev identificeret som en ny art, som forfatterne kaldte Tietê mammarenavirus.

Alle prøver blev indsamlet i skovklædte og byområder inden for 60 km fra hinanden, hvilket indikerer et muligt viralt reservoir i flagermus i regionen. Lignende niveauer af virus blev fundet i væv fra milten og lungerne, hvilket tyder på en systemisk infektion. Den højeste koncentration af arenavirus blev fundet i en tarmvævsprøve, hvilket tyder på enterisk viral udskillelse.

Fylogenetisk rekonstruktion baseret på de delvise RNA-afhængige RNA-polymerasegensekvenser afslørede to klader af New World arenavirus i Brasilien. Arenavirusserne fra de to Artibeus-arter dannede en klade, mens sekvenserne fra Carollia perspicillata-prøverne dannede en anden klade. De komplette kodende sekvenser viste en genomorganisation identisk med andre mammarenavira og dannede en monofyletisk gruppe med Tacaribe-virus, der var godt understøttet.

Det maksimale sandsynlighedstræ, der brugte de komplette gener for store segmenter, genfandt hele kladen indeholdende Tacaribe-viruset og sekvenser fra Brasilien som søster til Junin og Machupo New World arenavirus.

Fylogenetisk analyse under anvendelse af de komplette små segmentgener viste imidlertid et søsterforhold mellem Ocozocoautla de Espinosa-viruset og kladen indeholdende de brasilianske sekvenser og Tacaribe-virussekvenserne.

Ocozocoautla de Espinosa-virussen menes at have forårsaget et udbrud af hæmoragisk feber i Mexico. Desuden indikerede rekombinationsanalyser og sekvensafstande ikke rekombinationshændelser.

Den taksonomiske vurdering af de nye virusarter fra Carollia perspicillata-prøverne var baseret på parvise sekvenssammenligninger med Tacaribe-virus, der viste en nukleotidsekvensidentitet på mindre end 80 % og en nukleocapsidproteinaminosyreidentitet på 88,6 % til 90 % og tilstedeværelsen af ​​en særskilt vært. Arten blev opkaldt efter en flod nær prøveudtagningsstedet.

Konklusioner

Sammenfattende undersøgte undersøgelsen flagermusarter indsamlet i det sydvestlige Brasilien for tilstedeværelsen af ​​arenavirus-RNA ved hjælp af sekvensamplifikationsmetoder. Resultaterne viste tilstedeværelsen af ​​arenavirus-RNA fra tre flagermusarter, der tegner sig for 1,62 % af den samlede prøvestørrelse.

De fylogenetiske analyser afslørede, at de arenavirus, der blev påvist i flagermusprøverne, er nært beslægtet med Tacaribe-virus, en New World arenavirus fundet i flagermus. En af de påviste arenavirus er en ny art og fik navnet Tietê Mammarenavirus.

Mens New World arenavirus generelt findes i gnavere, tyder resultaterne af denne undersøgelse på, at flagermus kan være arenavirus reservoirer og skal udforskes yderligere.

Reference:

• Góes LGB, Fischer C, Campos ACA, de Carvalho C, Moreira-Soto A, Ambar G, et al. (2022) Hochgradig vielfältige Arenaviren in neotropischen Fledermäusen, Brasilien. Neu auftretende Infektionskrankheiten. doi: https://doi.org/10.3201/eid2812.220980 https://wwwnc.cdc.gov/eid/article/28/12/22-0980_article

.