Tutkimus viittaa siihen, että lepakot ovat aliarvioitu arenavirusten varasto

Tutkimus viittaa siihen, että lepakot ovat aliarvioitu arenavirusten varasto

Hiljattain julkaistussa tutkimuksessa, joka julkaistiin Yhdysvaltain tautien valvonta- ja ehkäisykeskuksen (CDC) lehdessä. Esiin tulevat tartuntataudit tutkijaryhmä raportoi arenaviruksen ribonukleiinihapon (RNA) havaitsemisesta useista lepakkolajeista, jotka on otettu näytteistä Brasiliassa vuosina 2007–2011.

Lernen: Sehr unterschiedliche Arenaviren in neotropischen Fledermäusen, Brasilien. Bildnachweis: Kateryna Kon/Shutterstock

tausta

Arenaviridae-virusperheen neljästä suvusta Mammarenavirus on ainoa suvu, joka tartuttaa nisäkkäitä. Suku on jaettu maailmanlaajuisesti levinneisiin Uuden maailman arenaviruksiin ja koriomeningiitti-Lassa-viruksen serokompleksiin. Jotkut uuden maailman arenavirukset, kuten Junin-, Chapare-, Guanarito-, Machupo- ja Sabia-virukset, aiheuttavat verenvuotokuumetta ihmisissä.

Vaikka patogeeniset arenavirukset tarttuvat yleensä ihmisiin tartunnan saaneiden jyrsijöiden kautta, lepakoissa esiintyvän Tacaribe mammarynaviruksen, joka ei ole tarttuva ihmisille, tiedetään aiheuttavan flunssan kaltaisia ​​oireita. Vaikka lepakoiden tiedetään kantavan zoonoottisia viruksia, lepakoiden ja arenavirusten välisestä yhteydestä on vain vähän epidemiologisia todisteita, jotka koostuvat pääasiassa yhdestä eristetystä viruksesta ja kokeellisista lepakoiden infektioista.

Koska Tacaribe-virus kuuluu samaan ryhmään kuin verenvuotokuumetta aiheuttavat virukset, jotka myös osoittavat immuunivastetta ja solutropismia, Tacaribe-viruksen aiheuttamien vakavien infektioiden mahdollisuutta ei voida sulkea pois.

Opiskelusta

Tässä tutkimuksessa tutkijat keräsivät lepakkonäytteitä Kaakkois-Brasiliasta ja analysoivat näytteistä perna-, keuhko-, suolisto-, munuais- ja maksakudoksia. He keräsivät yhteensä 1 047 lepakkoa 32 lajista ja analysoivat 3 670 kudosnäytettä. Arenaviruksen RNA:n havaitsemiseksi he suorittivat käänteistranskriptiopolymeraasiketjureaktion (RT-PCR) modifioiduilla alukkeilla monistamaan uuden maailman arenavirusten RNA-riippuvaisen RNA-polymeraasigeenin osittaisia ​​sekvenssejä.

Lisäksi he käyttivät Illumina-pohjaista syväsekvensointia saadakseen täydelliset arenavirusta koodaavat sekvenssit kahdesta kerätystä lepakkolajista. RT-PCR:stä saatuja sekvenssejä ja täydellisiä koodaavia sekvenssejä käytettiin fylogeneettisiin analyyseihin ja homogeenisten sekvenssietäisyyksien määrittämiseen.

Tulokset

Tulokset osoittivat arenavirus-RNA:ta 1,62 prosentista (17/1047) tutkituista lepakoista, jotka kuuluivat kolmeen lajiin - yhteen Artibeus planirostris, neljä Artibeus lituratus ja 12 Carollia perspicillata. Kahden Artibeus-lajin virukset tunnistettiin Tacaribe mammarenavirukseksi, kun taas Carollia perspicillata -lajin 12 näytteessä havaittu virus tunnistettiin uudeksi lajiksi, jonka kirjoittajat nimesivät Tietê mammarenavirukseksi.

Kaikki näytteet kerättiin metsä- ja kaupunkialueilta 60 kilometrin säteellä toisistaan, mikä viittaa mahdolliseen lepakoiden virusvarastoon alueella. Samanlaisia ​​virustasoja löydettiin kudoksista pernasta ja keuhkoista, mikä viittaa systeemiseen infektioon. Korkein arenaviruspitoisuus löydettiin suolistokudosnäytteestä, mikä viittaa viruksen suolistossa erittymiseen.

Fylogeneettinen rekonstruktio, joka perustuu osittain RNA:sta riippuvaisiin RNA-polymeraasigeenisekvensseihin, paljasti kaksi uuden maailman arenavirusten kladia Brasiliassa. Kahden Artibeus-lajin arenavirukset muodostivat yhden kladin, kun taas Carollia perspicillata -näytteiden sekvenssit muodostivat toisen kladin. Täydelliset koodaavat sekvenssit osoittivat identtisen genomin organisaation muiden mammarenavirusten kanssa ja muodostivat monofyleettisen ryhmän Tacaribe-viruksen kanssa, jota tuettiin hyvin.

Suurin mahdollinen todennäköisyyspuu, jossa käytettiin täydellisiä geenejä suurille segmenteille, palautti koko kladin, joka sisälsi Tacaribe-viruksen ja sekvenssit Brasiliasta Junin- ja Machupo New World -areenavirusten sisarena.

Kuitenkin fylogeneettinen analyysi käyttäen täydellisiä pienten segmenttien geenejä osoitti sisarsuhteen Ocozocoautla de Espinosa -viruksen ja brasilialaiset sekvenssit ja Tacaribe-virussekvenssit sisältävän kladin välillä.

Ocozocoautla de Espinosa -viruksen uskotaan aiheuttaneen verenvuotokuumeen puhkeamisen Meksikossa. Lisäksi rekombinaatioanalyysit ja sekvenssietäisyydet eivät osoittaneet rekombinaatiotapahtumia.

Carollia perspicillata -näytteistä saatujen uusien viruslajien taksonominen arviointi perustui pareittain suoritettuihin sekvenssivertailuihin Tacaribe-viruksen kanssa, mikä osoitti alle 80 %:n nukleotidisekvenssi-identtisyyden ja 88,6-90 %:n nukleokapsidiproteiinin aminohappo-identtisyyden sekä erillisen isännän läsnäolon. Laji on nimetty näytteenottopaikan lähellä sijaitsevan joen mukaan.

Johtopäätökset

Yhteenvetona voidaan todeta, että tutkimuksessa tutkittiin Lounais-Brasiliassa kerättyjä lepakalajeja arenaviruksen RNA:n esiintymisen toteamiseksi sekvenssin monistusmenetelmillä. Tulokset osoittivat arenaviruksen RNA:n läsnäolon kolmesta lepakalajesta, mikä vastasi 1,62 % näytteen kokonaiskoosta.

Fylogeneettiset analyysit paljastivat, että lepakkonäytteissä havaitut arenavirukset ovat läheistä sukua Tacaribe-virukselle, lepakoissa löydetylle uuden maailman arenavirukselle. Yksi havaituista arenaviruksista on uusi laji ja nimettiin Tietê Mammarenavirus.

Vaikka uuden maailman arenaviruksia löytyy yleensä jyrsijöistä, tämän tutkimuksen tulokset viittaavat siihen, että lepakot voivat olla arenavirusvarastoja ja niitä on tutkittava lisää.

Viite:

• Góes LGB, Fischer C, Campos ACA, de Carvalho C, Moreira-Soto A, Ambar G, et al. (2022) Hochgradig vielfältige Arenaviren in neotropischen Fledermäusen, Brasilien. Neu auftretende Infektionskrankheiten. doi: https://doi.org/10.3201/eid2812.220980 https://wwwnc.cdc.gov/eid/article/28/12/22-0980_article

.