Studija pokazuje da su šišmiši podcijenjen rezervoar arenavirusa

Studija pokazuje da su šišmiši podcijenjen rezervoar arenavirusa

U nedavnoj studiji objavljenoj u časopisu američkih centara za kontrolu i prevenciju bolesti (CDC). Pojavljujuće zarazne bolesti tim istraživača izvijestio je o otkrivanju ribonukleinske kiseline (RNA) arenavirusa iz različitih vrsta šišmiša uzorkovanih u Brazilu između 2007. i 2011. godine.

Lernen: Sehr unterschiedliche Arenaviren in neotropischen Fledermäusen, Brasilien. Bildnachweis: Kateryna Kon/Shutterstock

pozadina

Od četiri roda porodice virusa Arenaviridae, Mammarenavirus je jedini rod koji inficira sisavce. Rod je podijeljen na arenaviruse Novog svijeta i serokompleks virusa koriomeningitis-Lassa, koji su rasprostranjeni diljem svijeta. Neki arenavirusi Novog svijeta, poput virusa Junin, Chapare, Guanarito, Machupo i Sabia, uzrokuju hemoragičnu groznicu kod ljudi.

Dok se patogeni arenavirusi općenito prenose na ljude putem zaraženih glodavaca, poznato je da Tacaribe mammarynavirus, koji se nalazi u šišmišima i nije zarazan za ljude, uzrokuje simptome slične gripi. Iako je poznato da šišmiši prenose zoonotske viruse, postoje ograničeni epidemiološki dokazi o povezanosti šišmiša i arenavirusa, koji se prvenstveno sastoje od jednog izoliranog virusa i eksperimentalnih infekcija šišmiša.

Međutim, budući da Tacaribe virus pripada istoj skupini kao i virusi koji uzrokuju hemoragičnu groznicu, a koji također pokazuju imunološku evaziju i stanični tropizam, ne može se isključiti mogućnost ozbiljnih infekcija uzrokovanih Tacaribe virusom.

O studiranju

U ovoj studiji istraživači su prikupili uzorke šišmiša iz jugoistočnog Brazila i analizirali tkivo slezene, pluća, crijeva, bubrega i jetre iz uzoraka. Prikupili su ukupno 1047 šišmiša iz 32 vrste i analizirali 3670 uzoraka tkiva. Kako bi otkrili RNK arenavirusa, izveli su lančanu reakciju polimeraze obrnute transkripcije (RT-PCR) s modificiranim početnicama za pojačavanje djelomičnih sekvenci gena RNK polimeraze ovisnog o RNK arenavirusa Novog svijeta.

Uz to, upotrijebili su duboko sekvenciranje temeljeno na Illumini kako bi dobili kompletne sekvence kodiranja arenavirusa od dvije prikupljene vrste šišmiša. Sekvence dobivene RT-PCR-om i kompletne kodirajuće sekvence korištene su za filogenetske analize i određivanje udaljenosti homogenih sekvenci.

Rezultati

Rezultati su pokazali RNK arenavirusa iz 1,62% (17 od 1047) ispitanih šišmiša, koji pripadaju trima vrstama - jednom Artibeus planirostris, četiri Artibeus lituratus i 12 Carollia perspicillata. Virusi iz dviju vrsta Artibeus identificirani su kao Tacaribe mammarenavirus, dok je virus otkriven u 12 uzoraka Carollia perspicillata identificiran kao nova vrsta, koju su autori nazvali Tietê mammarenavirus.

Svi uzorci prikupljeni su u šumskim i urbanim područjima unutar 60 km jedno od drugog, što ukazuje na mogući rezervoar virusa u šišmišima u regiji. Slične razine virusa pronađene su u tkivima slezene i pluća, što ukazuje na sustavnu infekciju. Najveća koncentracija arenavirusa nađena je u uzorku crijevnog tkiva, što ukazuje na crijevno izlučivanje virusa.

Filogenetska rekonstrukcija temeljena na djelomičnoj RNA-ovisnoj sekvenci gena RNA polimeraze otkrila je dvije klade arenavirusa Novog svijeta u Brazilu. Arenavirusi iz dviju vrsta Artibeus formirali su jednu klasu, dok su sekvence iz uzoraka Carollia perspicillata činile drugu klasu. Kompletne kodirajuće sekvence pokazale su identičnu organizaciju genoma drugim mammarenavirusima i formirale su monofiletsku skupinu s Tacaribe virusom koja je bila dobro podržana.

Stablo maksimalne vjerojatnosti korištenjem kompletnih gena za velike segmente oporavilo je cijelu klasu koja sadrži virus Tacaribe i sekvence iz Brazila kao sestrinske arenavirusima Junin i Machupo New World.

Međutim, filogenetska analiza korištenjem kompletnih gena malih segmenata pokazala je sestrinsku vezu između virusa Ocozocoautla de Espinosa i klade koja sadrži brazilske sekvence i sekvence virusa Tacaribe.

Vjeruje se da je virus Ocozocoautla de Espinosa uzrokovao izbijanje hemoragične groznice u Meksiku. Nadalje, analize rekombinacije i udaljenosti sekvenci nisu ukazale na događaje rekombinacije.

Taksonomska procjena nove vrste virusa iz uzoraka Carollia perspicillata temeljila se na usporedbi sekvenci u parovima s virusom Tacaribe, pokazujući identičnost nukleotidne sekvence manju od 80% i identičnost aminokiselina proteina nukleokapsida od 88,6% do 90% i prisutnost različitog domaćina. Vrsta je dobila ime po rijeci u blizini mjesta uzorkovanja.

Zaključci

Ukratko, studija je ispitivala vrste šišmiša prikupljene u jugozapadnom Brazilu na prisutnost RNK arenavirusa korištenjem metoda pojačanja sekvenci. Rezultati su pokazali prisutnost RNK arenavirusa iz tri vrste šišmiša, što čini 1,62% ukupne veličine uzorka.

Filogenetske analize otkrile su da su arenavirusi otkriveni u uzorcima šišmiša usko povezani s virusom Tacaribe, arenavirusom Novog svijeta koji se nalazi u šišmiša. Jedan od otkrivenih arenavirusa je nova vrsta i nazvan je Tietê Mammarenavirus.

Iako se arenavirusi Novog svijeta općenito nalaze u glodavcima, rezultati ove studije sugeriraju da bi šišmiši mogli biti rezervoari arenavirusa i da ih je potrebno dodatno istražiti.

Referenca:

• Góes LGB, Fischer C, Campos ACA, de Carvalho C, Moreira-Soto A, Ambar G, et al. (2022) Hochgradig vielfältige Arenaviren in neotropischen Fledermäusen, Brasilien. Neu auftretende Infektionskrankheiten. doi: https://doi.org/10.3201/eid2812.220980 https://wwwnc.cdc.gov/eid/article/28/12/22-0980_article

.