Egy tanulmány azt sugallja, hogy a denevérek alábecsülik az arénavírusokat

Egy tanulmány azt sugallja, hogy a denevérek alábecsülik az arénavírusokat

Az US Centers for Disease Control and Prevention (CDC) folyóiratában nemrég megjelent tanulmányban. Feltörekvő fertőző betegségek egy kutatócsoport 2007 és 2011 között Brazíliában mintavételezett különböző denevérfajokból arénavírus ribonukleinsav (RNS) kimutatásáról számolt be.

Lernen: Sehr unterschiedliche Arenaviren in neotropischen Fledermäusen, Brasilien. Bildnachweis: Kateryna Kon/Shutterstock

háttér

Az Arenaviridae víruscsalád négy nemzetsége közül a Mammarenavirus az egyetlen nemzetség, amely emlősöket fertőz meg. A nemzetség az újvilági arénavírusokra és a choriomeningitis-Lassa vírus szerokomplexre oszlik, amelyek világszerte elterjedtek. Egyes újvilági arénavírusok, mint például a Junin, Chapare, Guanarito, Machupo és Sabia vírusok vérzéses lázat okoznak az emberekben.

Míg a kórokozó arenavírusok általában fertőzött rágcsálókon keresztül terjednek az emberre, a Tacaribe mammarynavírusról, amely denevérekben található, és nem fertőz az emberre, anekdotikusan ismert, hogy influenzaszerű tüneteket okoz. Bár ismert, hogy a denevérek zoonózisos vírusokat hordoznak, korlátozott epidemiológiai bizonyíték áll rendelkezésre a denevérek és az arénavírusok közötti összefüggésre, amely elsősorban egyetlen izolált vírusból és a denevérek kísérleti fertőzéseiből áll.

Mivel azonban a Tacaribe vírus ugyanabba a csoportba tartozik, mint a hemorrhagiás lázt okozó vírusok, amelyek immunelkerülést és sejttropizmust is mutatnak, nem zárható ki a Tacaribe vírus által okozott súlyos fertőzések lehetősége.

A tanulásról

A jelen tanulmányban a kutatók denevérmintákat gyűjtöttek Brazília délkeleti részéből, és a mintákból lép-, tüdő-, bél-, vese- és májszöveteket elemeztek. Összesen 1047 denevért gyűjtöttek be 32 fajból, és 3670 szövetmintát elemeztek. Az arenavírus RNS kimutatására reverz transzkripciós-polimeráz láncreakciót (RT-PCR) hajtottak végre módosított primerekkel az újvilági arénavírusok RNS-függő RNS polimeráz génjének részleges szekvenciáinak amplifikálására.

Ezenkívül Illumina-alapú mély szekvenálást alkalmaztak, hogy teljes arénavírust kódoló szekvenciát nyerjenek az összegyűjtött denevérfajok közül kettőből. Az RT-PCR-ből nyert szekvenciákat és a teljes kódoló szekvenciákat filogenetikai elemzésekhez és a homogén szekvenciatávolságok meghatározásához használtuk.

Eredmények

Az eredmények azt mutatták, hogy a vizsgált denevérek 1,62%-ánál (1047-ből 17) arenavírus RNS-t találtak, amelyek három fajhoz tartoznak - egy Artibeus planirostris, négy Artibeus lituratus és 12 Carollia perspicillata. A két Artibeus fajból származó vírust Tacaribe mammarenavírusként azonosították, míg a Carollia perspicillata 12 mintájában kimutatott vírust új fajként azonosították, amelyet a szerzők Tietê mammarenavírusnak neveztek el.

Minden mintát erdős és városi területeken gyűjtöttek egymástól 60 km-en belül, ami arra utal, hogy a régióban a denevérek vírustárolója lehetséges. Hasonló szintű vírust találtak a lépből és a tüdőből származó szövetekben, ami szisztémás fertőzésre utal. Az arenavírus legmagasabb koncentrációját egy bélszövetmintában találták, ami enterális víruskiválasztásra utal.

A részleges RNS-függő RNS-polimeráz génszekvenciákon alapuló filogenetikai rekonstrukció az újvilági arénavírusok két kládját tárta fel Brazíliában. A két Artibeus fajból származó arenavírusok egy kládot, míg a Carollia perspicillata mintákból származó szekvenciák egy másik kládot alkottak. A teljes kódoló szekvenciák a többi mammarenavíruséval azonos genom szerveződést mutattak, és monofiletikus csoportot alkottak a Tacaribe vírussal, amely jól támogatott.

A nagy szegmensek teljes génjeit használó maximális valószínűségi fa visszanyerte a teljes kládot, amely a Tacaribe vírust és a Brazíliából származó szekvenciákat tartalmazza a Junin és Machupo New World arénavírusok testvéreként.

A teljes kisszegmens géneket használó filogenetikai elemzés azonban testvérkapcsolatot mutatott ki az Ocozocoautla de Espinosa vírus és a brazil szekvenciákat és a Tacaribe vírus szekvenciákat tartalmazó klád között.

A feltételezések szerint az Ocozocoautla de Espinosa vírus okozta a vérzéses láz kitörését Mexikóban. Ezenkívül a rekombinációs elemzések és a szekvencia távolságok nem utaltak rekombinációs eseményekre.

A Carollia perspicillata mintákból származó új vírusfajták taxonómiai értékelése a Tacaribe vírussal végzett páronkénti szekvencia-összehasonlításokon alapult, amelyek 80%-nál kisebb nukleotidszekvencia-azonosságot, 88,6-90%-os nukleokapszidfehérje aminosav-azonosságot mutattak, és különálló gazda jelenlétét mutatták ki. A faj nevét a mintavételi hely közelében folyó folyóról kapta.

Következtetések

Összefoglalva, a tanulmány Brazília délnyugati részén gyűjtött denevérfajokat vizsgált arénavírus RNS jelenlétére szekvenciaamplifikációs módszerekkel. Az eredmények három denevérfajból származó arenavírus RNS jelenlétét mutatták ki, ami a teljes mintaméret 1,62%-át teszi ki.

A filogenetikai elemzések kimutatták, hogy a denevérmintákban kimutatott arenavírusok szoros rokonságban állnak a Tacaribe vírussal, egy újvilági arénavírussal, amelyet a denevérekben találtak. Az egyik kimutatott arenavírus egy új faj, és a Tietê Mammarenavirus nevet kapta.

Míg az újvilági arénavírusok általában rágcsálókban fordulnak elő, a tanulmány eredményei arra utalnak, hogy a denevérek az arénavírus-tározók lehetnek, és további kutatásra szorulnak.

Referencia:

• Góes LGB, Fischer C, Campos ACA, de Carvalho C, Moreira-Soto A, Ambar G, et al. (2022) Hochgradig vielfältige Arenaviren in neotropischen Fledermäusen, Brasilien. Neu auftretende Infektionskrankheiten. doi: https://doi.org/10.3201/eid2812.220980 https://wwwnc.cdc.gov/eid/article/28/12/22-0980_article

.