Uno studio suggerisce che i pipistrelli sono un serbatoio sottovalutato per gli arenavirus

Uno studio suggerisce che i pipistrelli sono un serbatoio sottovalutato per gli arenavirus

In un recente studio pubblicato sulla rivista dei Centri statunitensi per il controllo e la prevenzione delle malattie (CDC). Malattie infettive emergenti un team di ricercatori ha segnalato il rilevamento dell’acido ribonucleico (RNA) dell’arenavirus in varie specie di pipistrelli campionate in Brasile tra il 2007 e il 2011.

Lernen: Sehr unterschiedliche Arenaviren in neotropischen Fledermäusen, Brasilien. Bildnachweis: Kateryna Kon/Shutterstock

sfondo

Dei quattro generi della famiglia dei virus Arenaviridae, Mammarenavirus è l'unico genere che infetta i mammiferi. Il genere è suddiviso negli arenavirus del Nuovo Mondo e nel sierocomplesso del virus della coriomeningite-Lassa, distribuiti in tutto il mondo. Alcuni arenavirus del Nuovo Mondo, come i virus Junin, Chapare, Guanarito, Machupo e Sabia, causano febbre emorragica negli esseri umani.

Mentre gli arenavirus patogeni vengono generalmente trasmessi all'uomo attraverso roditori infetti, è noto aneddoticamente che causa sintomi simil-influenzali il Tacaribe mammarynavirus, che si trova nei pipistrelli e non è infettivo per l'uomo. Sebbene sia noto che i pipistrelli ospitano virus zoonotici, esistono prove epidemiologiche limitate per l’associazione tra pipistrelli e arenavirus, costituita principalmente da un singolo virus isolato e infezioni sperimentali di pipistrelli.

Tuttavia, poiché il virus Tacaribe appartiene allo stesso gruppo dei virus che provocano la febbre emorragica, che presentano anche evasione immunitaria e tropismo cellulare, non si può escludere la possibilità di infezioni gravi causate dal virus Tacaribe.

A proposito di studiare

Nel presente studio, i ricercatori hanno raccolto campioni di pipistrelli dal sud-est del Brasile e hanno analizzato i tessuti di milza, polmone, intestino, reni e fegato dei campioni. Hanno raccolto un totale di 1.047 pipistrelli di 32 specie e hanno analizzato 3.670 campioni di tessuto. Per rilevare l'RNA dell'arenavirus, hanno eseguito la reazione a catena della polimerasi con trascrizione inversa (RT-PCR) con primer modificati per amplificare sequenze parziali del gene della RNA polimerasi RNA-dipendente degli arenavirus del Nuovo Mondo.

Inoltre, hanno utilizzato il sequenziamento profondo basato su Illumina per ottenere sequenze complete di codifica dell'arenavirus da due delle specie di pipistrelli raccolte. Le sequenze ottenute da RT-PCR e le sequenze codificanti complete sono state utilizzate per analisi filogenetiche e per determinare le distanze di sequenza omogenee.

Risultati

I risultati hanno mostrato l'RNA dell'arenavirus proveniente dall'1,62% (17 su 1047) dei pipistrelli esaminati, appartenenti a tre specie: un Artibeus planirostris, quattro Artibeus lituratus e 12 Carollia perspicillata. I virus delle due specie Artibeus sono stati identificati come Tacaribe mammarenavirus, mentre il virus rilevato nei 12 campioni di Carollia perspicillata è stato identificato come una nuova specie, che gli autori hanno denominato Tietê mammarenavirus.

Tutti i campioni sono stati raccolti in aree boschive e urbane entro 60 km l’una dall’altra, indicando un possibile serbatoio virale nei pipistrelli della regione. Livelli simili di virus sono stati trovati nei tessuti della milza e del polmone, suggerendo un’infezione sistemica. La più alta concentrazione di arenavirus è stata trovata in un campione di tessuto intestinale, suggerendo un'escrezione virale enterica.

La ricostruzione filogenetica basata sulle sequenze parziali del gene della RNA polimerasi RNA-dipendente ha rivelato due cladi di arenavirus del Nuovo Mondo in Brasile. Gli arenavirus delle due specie Artibeus formavano un clade, mentre le sequenze dei campioni di Carollia perspicillata formavano un altro clade. Le sequenze codificanti complete hanno mostrato un'organizzazione genomica identica a quella di altri mammarenavirus e hanno formato un gruppo monofiletico con il virus Tacaribe che era ben supportato.

L'albero di massima verosimiglianza che utilizza i geni completi per segmenti di grandi dimensioni ha recuperato l'intero clade contenente il virus Tacaribe e le sequenze provenienti dal Brasile come fratelli degli arenavirus Junin e Machupo del Nuovo Mondo.

Tuttavia, l'analisi filogenetica utilizzando i geni completi del piccolo segmento ha mostrato una relazione sorella tra il virus Ocozocoautla de Espinosa e il clade contenente le sequenze brasiliane e le sequenze del virus Tacaribe.

Si ritiene che il virus Ocozocoautla de Espinosa abbia causato un'epidemia di febbre emorragica in Messico. Inoltre, le analisi di ricombinazione e le distanze di sequenza non hanno indicato eventi di ricombinazione.

La valutazione tassonomica delle nuove specie virali dai campioni di Carollia perspicillata si è basata su confronti di sequenze a coppie con il virus Tacaribe, mostrando un'identità di sequenza nucleotidica inferiore all'80% e un'identità di aminoacidi proteici nucleocapside compresa tra 88,6% e 90% e la presenza di un ospite distinto. La specie prende il nome da un fiume vicino al sito di campionamento.

Conclusioni

In sintesi, lo studio ha esaminato le specie di pipistrelli raccolte nel Brasile sudoccidentale per la presenza di RNA di arenavirus utilizzando metodi di amplificazione della sequenza. I risultati hanno mostrato la presenza di RNA di arenavirus da tre specie di pipistrelli, che rappresentano l’1,62% della dimensione totale del campione.

Le analisi filogenetiche hanno rivelato che gli arenavirus rilevati nei campioni di pipistrelli sono strettamente correlati al virus Tacaribe, un arenavirus del Nuovo Mondo trovato nei pipistrelli. Uno degli arenavirus rilevati è una nuova specie ed è stato chiamato Tietê Mammarenavirus.

Sebbene gli arenavirus del Nuovo Mondo si trovino generalmente nei roditori, i risultati di questo studio suggeriscono che i pipistrelli potrebbero essere serbatoi di arenavirus e necessitano di essere ulteriormente esplorati.

Riferimento:

• Góes LGB, Fischer C, Campos ACA, de Carvalho C, Moreira-Soto A, Ambar G, et al. (2022) Hochgradig vielfältige Arenaviren in neotropischen Fledermäusen, Brasilien. Neu auftretende Infektionskrankheiten. doi: https://doi.org/10.3201/eid2812.220980 https://wwwnc.cdc.gov/eid/article/28/12/22-0980_article

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