Tyrimas rodo, kad šikšnosparniai yra nepakankamai įvertintas arenavirusų rezervuaras

Tyrimas rodo, kad šikšnosparniai yra nepakankamai įvertintas arenavirusų rezervuaras

Neseniai atliktame tyrime, paskelbtame JAV ligų kontrolės ir prevencijos centrų (CDC) žurnale. Atsirandančios infekcinės ligos tyrėjų komanda pranešė, kad 2007–2011 m. Brazilijoje buvo aptikta arenaviruso ribonukleino rūgšties (RNR) iš įvairių šikšnosparnių rūšių.

Lernen: Sehr unterschiedliche Arenaviren in neotropischen Fledermäusen, Brasilien. Bildnachweis: Kateryna Kon/Shutterstock

fone

Iš keturių Arenaviridae virusų šeimos genčių Mammarenavirus yra vienintelė gentis, užkrečianti žinduolius. Gentis skirstoma į Naujojo pasaulio arenavirusus ir choriomeningito-Lassa viruso serokompleksą, kurie paplitę visame pasaulyje. Kai kurie Naujojo pasaulio arenavirusai, tokie kaip Junin, Chapare, Guanarito, Machupo ir Sabia virusai, sukelia žmonėms hemoraginę karštligę.

Nors patogeniniai arenavirusai paprastai perduodami žmonėms per užkrėstus graužikus, Tacaribe mammarynavirus, kuris randamas šikšnosparniuose ir nėra užkrečiamas žmonėms, gali sukelti į gripą panašius simptomus. Nors žinoma, kad šikšnosparniai turi zoonozinių virusų, epidemiologinių įrodymų apie ryšį tarp šikšnosparnių ir arenavirusų yra nedaug, daugiausia dėl vieno izoliuoto viruso ir eksperimentinių šikšnosparnių infekcijų.

Tačiau kadangi Tacaribe virusas priklauso tai pačiai grupei kaip ir hemoraginę karštligę sukeliantys virusai, kuriems taip pat būdingas imuniteto vengimas ir ląstelių tropizmas, negalima atmesti rimtų infekcijų, kurias sukelia Tacaribe virusas, galimybės.

Apie studijas

Šiame tyrime mokslininkai surinko šikšnosparnių mėginius iš pietryčių Brazilijos ir iš mėginių analizavo blužnies, plaučių, žarnyno, inkstų ir kepenų audinius. Jie iš viso surinko 1047 šikšnosparnius iš 32 rūšių ir ištyrė 3670 audinių mėginių. Norėdami aptikti arenaviruso RNR, jie atliko atvirkštinės transkripcijos-polimerazės grandininę reakciją (RT-PCR) su modifikuotais pradmenimis, kad sustiprintų dalines Naujojo pasaulio arenavirusų RNR priklausomo RNR polimerazės geno sekas.

Be to, jie naudojo Illumina pagrįstą gilųjį sekos nustatymą, kad gautų visas arenavirusą koduojančias sekas iš dviejų surinktų šikšnosparnių rūšių. Sekos, gautos iš RT-PGR, ir visos koduojančios sekos buvo naudojamos filogenetinėms analizėms ir vienalyčių sekų atstumams nustatyti.

Rezultatai

Rezultatai parodė arenaviruso RNR iš 1,62 % (17 iš 1047) tirtų šikšnosparnių, priklausančių trims rūšims – vienai Artibeus planirostris, keturioms Artibeus lituratus ir 12 Carollia perspicillata. Dviejų Artibeus rūšių virusai buvo identifikuoti kaip Tacaribe mammarenavirus, o virusas, aptiktas 12 Carollia perspicillata mėginių, buvo identifikuotas kaip nauja rūšis, kurią autoriai pavadino Tietê mammarenavirus.

Visi mėginiai buvo paimti miškingose ​​ir miesto vietose 60 km atstumu vienas nuo kito, o tai rodo galimą viruso rezervuarą šikšnosparniuose regione. Panašūs viruso kiekiai buvo nustatyti blužnies ir plaučių audiniuose, o tai rodo sisteminę infekciją. Didžiausia arenaviruso koncentracija buvo nustatyta žarnyno audinio mėginyje, o tai rodo, kad virusas išsiskiria iš žarnyno.

Filogenetinė rekonstrukcija, pagrįsta dalinėmis RNR priklausomomis RNR polimerazės genų sekomis, atskleidė du Naujojo pasaulio arenavirusų kladus Brazilijoje. Dviejų Artibeus rūšių arenavirusai sudarė vieną kladą, o Carollia perspicillata mėginių sekos sudarė kitą kladą. Visos koduojančios sekos parodė identišką kitų mammarenavirusų genomo struktūrą ir sudarė monofilinę grupę su Tacaribe virusu, kuris buvo gerai palaikomas.

Didžiausios tikimybės medis, naudojant visus didelių segmentų genus, atkūrė visą kladą, kuriame buvo Tacaribe virusas ir sekos iš Brazilijos kaip Junin ir Machupo New World arenavirusų sesuo.

Tačiau filogenetinė analizė, naudojant visus mažų segmentų genus, parodė seserinį ryšį tarp Ocozocoautla de Espinosa viruso ir klado, kuriame yra Brazilijos sekos ir Tacaribe viruso sekos.

Manoma, kad Ocozocoautla de Espinosa virusas sukėlė hemoraginės karštligės protrūkį Meksikoje. Be to, rekombinacijos analizė ir sekos atstumai nerodė rekombinacijos įvykių.

Naujų virusų rūšių taksonominis įvertinimas iš Carollia perspicillata mėginių buvo pagrįstas porų sekų palyginimu su Tacaribe virusu, rodančiu mažiau nei 80% nukleotidų sekos tapatumą ir 88,6% iki 90% nukleokapsidės baltymo aminorūgščių tapatumą ir atskiro šeimininko buvimą. Rūšis buvo pavadinta netoli mėginių ėmimo vietos tekančios upės vardu.

Išvados

Apibendrinant galima pasakyti, kad tyrime buvo tiriamos pietvakarių Brazilijoje surinktos šikšnosparnių rūšys dėl arenaviruso RNR, naudojant sekos amplifikacijos metodus. Rezultatai parodė, kad arenaviruso RNR yra iš trijų šikšnosparnių rūšių, o tai sudaro 1,62% viso mėginio dydžio.

Filogenetinės analizės atskleidė, kad šikšnosparnių mėginiuose aptikti arenavirusai yra glaudžiai susiję su Tacaribe virusu – Naujojo pasaulio arenavirusu, aptinkamu šikšnosparniuose. Vienas iš aptiktų arenavirusų yra nauja rūšis ir buvo pavadintas Tietê Mammarenavirus.

Nors Naujojo pasaulio arenavirusai paprastai randami graužikams, šio tyrimo rezultatai rodo, kad šikšnosparniai gali būti arenaviruso rezervuarai ir juos reikia toliau tirti.

Nuoroda:

• Góes LGB, Fischer C, Campos ACA, de Carvalho C, Moreira-Soto A, Ambar G, et al. (2022) Hochgradig vielfältige Arenaviren in neotropischen Fledermäusen, Brasilien. Neu auftretende Infektionskrankheiten. doi: https://doi.org/10.3201/eid2812.220980 https://wwwnc.cdc.gov/eid/article/28/12/22-0980_article

.