Uit onderzoek blijkt dat vleermuizen een onderschat reservoir voor arenavirussen zijn

Uit onderzoek blijkt dat vleermuizen een onderschat reservoir voor arenavirussen zijn

Dat blijkt uit een recente studie gepubliceerd in het tijdschrift van de Amerikaanse Centers for Disease Control and Prevention (CDC). Opkomende infectieziekten een team van onderzoekers rapporteerde de detectie van arenavirus ribonucleïnezuur (RNA) van verschillende vleermuissoorten die tussen 2007 en 2011 in Brazilië waren bemonsterd.

Lernen: Sehr unterschiedliche Arenaviren in neotropischen Fledermäusen, Brasilien. Bildnachweis: Kateryna Kon/Shutterstock

achtergrond

Van de vier geslachten van de virusfamilie Arenaviridae is het Mammarenavirus het enige geslacht dat zoogdieren infecteert. Het geslacht is onderverdeeld in de Nieuwe Wereld-arenavirussen en het choriomeningitis-Lassa-virusserocomplex, die wereldwijd worden verspreid. Sommige arenavirussen uit de Nieuwe Wereld, zoals Junin-, Chapare-, Guanarito-, Machupo- en Sabia-virussen, veroorzaken hemorragische koorts bij mensen.

Hoewel de pathogene arenavirussen over het algemeen via geïnfecteerde knaagdieren op mensen worden overgedragen, is anekdotisch bekend dat het Tacaribe-mammarynavirus, dat wordt aangetroffen bij vleermuizen en niet besmettelijk is voor mensen, griepachtige symptomen veroorzaakt. Hoewel bekend is dat vleermuizen zoönotische virussen herbergen, is er beperkt epidemiologisch bewijs voor het verband tussen vleermuizen en arenavirussen, dat voornamelijk bestaat uit een enkel geïsoleerd virus en experimentele infecties van vleermuizen.

Omdat het Tacaribe-virus echter tot dezelfde groep behoort als de virussen die hemorragische koorts veroorzaken, die ook immuunontduiking en celtropisme vertonen, kan de mogelijkheid van ernstige infecties veroorzaakt door het Tacaribe-virus niet worden uitgesloten.

Over studeren

In de huidige studie verzamelden onderzoekers vleermuismonsters uit het zuidoosten van Brazilië en analyseerden milt-, long-, darm-, nier- en leverweefsels uit de monsters. Ze verzamelden in totaal 1.047 vleermuizen van 32 soorten en analyseerden 3.670 weefselmonsters. Om arenavirus-RNA te detecteren, voerden ze omgekeerde transcriptie-polymerasekettingreactie (RT-PCR) uit met gemodificeerde primers om gedeeltelijke sequenties van het RNA-afhankelijke RNA-polymerasegen van arenavirussen uit de Nieuwe Wereld te amplificeren.

Bovendien gebruikten ze op Illumina gebaseerde diepe sequencing om volledige coderende sequenties voor het arenavirus te verkrijgen van twee van de verzamelde vleermuissoorten. De sequenties verkregen uit RT-PCR en de volledige coderende sequenties werden gebruikt voor fylogenetische analyses en om de homogene sequentieafstanden te bepalen.

Resultaten

De resultaten toonden arenavirus-RNA aan van 1,62% (17 van de 1047) van de onderzochte vleermuizen, behorend tot drie soorten: één Artibeus planirostris, vier Artibeus lituratus en 12 Carollia perspicillata. De virussen van de twee Artibeus-soorten werden geïdentificeerd als Tacaribe mammarenavirus, terwijl het virus dat werd gedetecteerd in de 12 monsters van Carollia perspicillata werd geïdentificeerd als een nieuwe soort, die de auteurs Tietê mammarenavirus noemden.

Alle monsters werden verzameld in bosrijke en stedelijke gebieden binnen een straal van 60 km van elkaar, wat wijst op een mogelijk virusreservoir bij vleermuizen in de regio. Soortgelijke virusniveaus werden aangetroffen in weefsels van de milt en de longen, wat duidt op een systemische infectie. De hoogste concentratie arenavirus werd gevonden in een darmweefselmonster, wat erop wijst dat er virusuitscheiding via de maag plaatsvindt.

Fylogenetische reconstructie op basis van de gedeeltelijke RNA-afhankelijke RNA-polymerase-gensequenties onthulde twee clades van arenavirussen uit de Nieuwe Wereld in Brazilië. De arenavirussen van de twee Artibeus-soorten vormden één clade, terwijl de sequenties van de Carollia perspicillata-monsters een andere clade vormden. De volledige coderende sequenties vertoonden een identieke genoomorganisatie als andere mammarenavirussen en vormden een monofyletische groep met het Tacaribe-virus die goed werd ondersteund.

De maximale waarschijnlijkheidsboom die de volledige genen voor grote segmenten gebruikte, vond de volledige clade met het Tacaribe-virus en sequenties uit Brazilië als zuster van de Junin en Machupo New World arenavirussen.

Fylogenetische analyse met behulp van de complete genen voor het kleine segment toonde echter een zusterrelatie aan tussen het Ocozocoautla de Espinosa-virus en de clade die de Braziliaanse sequenties en de Tacaribe-virussequenties bevat.

Aangenomen wordt dat het Ocozocoautla de Espinosa-virus een uitbraak van hemorragische koorts in Mexico heeft veroorzaakt. Bovendien duidden recombinatieanalyses en sequentieafstanden niet op recombinatiegebeurtenissen.

De taxonomische beoordeling van de nieuwe virussoort uit de Carollia perspicillata-monsters was gebaseerd op paarsgewijze sequentievergelijkingen met het Tacaribe-virus, waarbij een nucleotidesequentie-identiteit van minder dan 80% en een nucleocapside-eiwitaminozuuridentiteit van 88,6% tot 90% en de aanwezigheid van een afzonderlijke gastheer werden aangetoond. De soort is vernoemd naar een rivier in de buurt van de bemonsteringslocatie.

Conclusies

Samenvattend onderzocht de studie vleermuissoorten die in het zuidwesten van Brazilië waren verzameld op de aanwezigheid van arenavirus-RNA met behulp van sequentieamplificatiemethoden. De resultaten toonden de aanwezigheid aan van arenavirus-RNA van drie vleermuissoorten, goed voor 1,62% van de totale steekproefomvang.

Uit de fylogenetische analyses bleek dat de in de vleermuismonsters gedetecteerde arenavirussen nauw verwant zijn aan het Tacaribe-virus, een arenavirus uit de Nieuwe Wereld dat bij vleermuizen wordt aangetroffen. Eén van de gedetecteerde arenavirussen is een nieuwe soort en heet Tietê Mammarenavirus.

Hoewel arenavirussen uit de Nieuwe Wereld over het algemeen bij knaagdieren worden aangetroffen, suggereren de resultaten van deze studie dat vleermuizen arenavirusreservoirs kunnen zijn en verder moeten worden onderzocht.

Referentie:

• Góes LGB, Fischer C, Campos ACA, de Carvalho C, Moreira-Soto A, Ambar G, et al. (2022) Hochgradig vielfältige Arenaviren in neotropischen Fledermäusen, Brasilien. Neu auftretende Infektionskrankheiten. doi: https://doi.org/10.3201/eid2812.220980 https://wwwnc.cdc.gov/eid/article/28/12/22-0980_article

.