Štúdia naznačuje, že netopiere sú podceňovaným rezervoárom pre arenavírusy

Štúdia naznačuje, že netopiere sú podceňovaným rezervoárom pre arenavírusy

V nedávnej štúdii publikovanej v časopise amerického Centra pre kontrolu a prevenciu chorôb (CDC). Vznikajúce infekčné choroby tím výskumníkov oznámil detekciu arenavírusovej ribonukleovej kyseliny (RNA) z rôznych druhov netopierov odobratých v Brazílii v rokoch 2007 až 2011.

Lernen: Sehr unterschiedliche Arenaviren in neotropischen Fledermäusen, Brasilien. Bildnachweis: Kateryna Kon/Shutterstock

pozadia

Zo štyroch rodov vírusovej čeľade Arenaviridae je Mammarenavirus jediným rodom, ktorý infikuje cicavce. Rod sa delí na arenavírusy Nového sveta a sérokomplex vírusu choriomeningitis-Lassa, ktoré sú rozšírené po celom svete. Niektoré arenavírusy Nového sveta, ako sú vírusy Junin, Chapare, Guanarito, Machupo a Sabia, spôsobujú u ľudí hemoragickú horúčku.

Zatiaľ čo patogénne arenavírusy sa vo všeobecnosti prenášajú na ľudí prostredníctvom infikovaných hlodavcov, mammarynavírus Tacaribe, ktorý sa nachádza u netopierov a nie je infekčný pre ľudí, je neoficiálne známy tým, že spôsobuje symptómy podobné chrípke. Hoci je známe, že netopiere prechovávajú zoonotické vírusy, existujú obmedzené epidemiologické dôkazy o súvislosti medzi netopiermi a arenavírusmi, ktoré pozostávajú predovšetkým z jediného izolovaného vírusu a experimentálnych infekcií netopierov.

Keďže však vírus Tacaribe patrí do rovnakej skupiny ako vírusy spôsobujúce hemoragickú horúčku, ktoré tiež vykazujú imunitný únik a bunkový tropizmus, nemožno vylúčiť možnosť závažných infekcií spôsobených vírusom Tacaribe.

O štúdiu

V tejto štúdii výskumníci zozbierali vzorky netopierov z juhovýchodnej Brazílie a zo vzoriek analyzovali tkanivá sleziny, pľúc, čriev, obličiek a pečene. Zozbierali celkovo 1 047 netopierov z 32 druhov a analyzovali 3 670 vzoriek tkaniva. Na detekciu arenavírusovej RNA vykonali reverznú transkripčnú-polymerázovú reťazovú reakciu (RT-PCR) s modifikovanými primérmi na amplifikáciu čiastočných sekvencií RNA-dependentného génu RNA polymerázy arenavírusov Nového sveta.

Okrem toho použili hlboké sekvenovanie na báze Illumina na získanie kompletných sekvencií kódujúcich arenavírus z dvoch zozbieraných druhov netopierov. Sekvencie získané z RT-PCR a kompletné kódujúce sekvencie sa použili na fylogenetické analýzy a na určenie homogénnych vzdialeností sekvencií.

Výsledky

Výsledky ukázali RNA arenavírusu z 1,62 % (17 z 1 047) skúmaných netopierov patriacich k trom druhom – jednému Artibeus planirostris, štyrom Artibeus lituratus a 12 Carollia perspicillata. Vírusy z dvoch druhov Artibeus boli identifikované ako Tacaribe mammarenavirus, zatiaľ čo vírus zistený v 12 vzorkách Carollia perspicillata bol identifikovaný ako nový druh, ktorý autori nazvali Tietê mammarenavirus.

Všetky vzorky boli odobraté v zalesnených a mestských oblastiach do 60 km od seba, čo naznačuje možnú vírusovú rezervoár u netopierov v regióne. Podobné hladiny vírusu sa našli v tkanivách zo sleziny a pľúc, čo naznačuje systémovú infekciu. Najvyššia koncentrácia arenavírusu bola zistená vo vzorke črevného tkaniva, čo naznačuje enterickú vírusovú exkréciu.

Fylogenetická rekonštrukcia založená na čiastočných RNA-dependentných génových sekvenciách RNA polymerázy odhalila dva klady arenavírusov Nového sveta v Brazílii. Arenavírusy z dvoch druhov Artibeus tvorili jeden klad, zatiaľ čo sekvencie zo vzoriek Carollia perspicillata tvorili ďalší klad. Kompletné kódujúce sekvencie vykazovali identickú organizáciu genómu s inými mammarenavírusmi a vytvorili monofyletickú skupinu s vírusom Tacaribe, ktorý bol dobre podporovaný.

Strom maximálnej pravdepodobnosti využívajúci kompletné gény pre veľké segmenty obnovil celý klad obsahujúci vírus Tacaribe a sekvencie z Brazílie ako sestry anavírusov Junin a Machupo New World.

Fylogenetická analýza s použitím kompletných génov malých segmentov však ukázala sesterský vzťah medzi vírusom Ocozocoautla de Espinosa a kladom obsahujúcim brazílske sekvencie a sekvencie vírusu Tacaribe.

Predpokladá sa, že vírus Ocozocoautla de Espinosa spôsobil vypuknutie hemoragickej horúčky v Mexiku. Okrem toho rekombinačné analýzy a sekvenčné vzdialenosti nenaznačovali rekombinačné udalosti.

Taxonomické hodnotenie nového druhu vírusu zo vzoriek Carollia perspicillata bolo založené na párovom porovnaní sekvencií s vírusom Tacaribe, pričom sa preukázala identita nukleotidovej sekvencie menej ako 80 % a identita aminokyselín nukleokapsidového proteínu 88,6 % až 90 % a prítomnosť odlišného hostiteľa. Druh bol pomenovaný podľa rieky v blízkosti miesta odberu vzoriek.

Závery

Stručne povedané, štúdia skúmala druhy netopierov zozbierané v juhozápadnej Brazílii na prítomnosť RNA arenavírusu pomocou metód amplifikácie sekvencií. Výsledky ukázali prítomnosť RNA arenavírusu z troch druhov netopierov, čo predstavuje 1,62 % z celkovej veľkosti vzorky.

Fylogenetické analýzy odhalili, že arenavírusy zistené vo vzorkách netopierov úzko súvisia s vírusom Tacaribe, arenavírusom Nového sveta nájdeným u netopierov. Jeden z zistených arenavírusov je nový druh a dostal názov Tietê Mammarenavirus.

Zatiaľ čo arenavírusy Nového sveta sa vo všeobecnosti nachádzajú u hlodavcov, výsledky tejto štúdie naznačujú, že netopiere môžu byť rezervoármi arenavírusov a je potrebné ich ďalej skúmať.

Referencia:

• Góes LGB, Fischer C, Campos ACA, de Carvalho C, Moreira-Soto A, Ambar G, et al. (2022) Hochgradig vielfältige Arenaviren in neotropischen Fledermäusen, Brasilien. Neu auftretende Infektionskrankheiten. doi: https://doi.org/10.3201/eid2812.220980 https://wwwnc.cdc.gov/eid/article/28/12/22-0980_article

.