En studie tyder på att fladdermöss är en underskattad reservoar för arenavirus

En studie tyder på att fladdermöss är en underskattad reservoar för arenavirus

I en nyligen publicerad studie publicerad i tidskriften för US Centers for Disease Control and Prevention (CDC). Nya infektionssjukdomar ett team av forskare rapporterade upptäckten av arenavirus ribonukleinsyra (RNA) från olika fladdermusarter som provades i Brasilien mellan 2007 och 2011.

Lernen: Sehr unterschiedliche Arenaviren in neotropischen Fledermäusen, Brasilien. Bildnachweis: Kateryna Kon/Shutterstock

bakgrund

Av de fyra släktena i virusfamiljen Arenaviridae är Mammarenavirus det enda släktet som infekterar däggdjur. Släktet är uppdelat i New World arenavirus och choriomeningitis-Lassa virus serokomplex, som är spridda över hela världen. Vissa arenavirus från Nya världen, som Junin-, Chapare-, Guanarito-, Machupo- och Sabia-virus, orsakar hemorragisk feber hos människor.

Medan de patogena arenavirusen i allmänhet överförs till människor genom infekterade gnagare, är Tacaribe mammarynavirus, som finns i fladdermöss och inte är smittsamt för människor, anekdotiskt känt för att orsaka influensaliknande symtom. Även om fladdermöss är kända för att hysa zoonotiska virus, finns det begränsade epidemiologiska bevis för sambandet mellan fladdermöss och arenavirus, främst bestående av ett enda isolerat virus och experimentella infektioner av fladdermöss.

Men eftersom Tacaribe-virus tillhör samma grupp som de hemorragiska feber-orsakande virusen, som också uppvisar immunflykt och celltropism, kan risken för allvarliga infektioner orsakade av Tacaribe-virus inte uteslutas.

Om att studera

I den aktuella studien samlade forskare fladdermusprover från sydöstra Brasilien och analyserade mjälte, lunga, tarm, njure och levervävnader från proverna. De samlade in totalt 1 047 fladdermöss från 32 arter och analyserade 3 670 vävnadsprover. För att detektera arenavirus-RNA utförde de omvänd transkription-polymeraskedjereaktion (RT-PCR) med modifierade primrar för att amplifiera partiella sekvenser av den RNA-beroende RNA-polymerasgenen från New World arenavirus.

Dessutom använde de Illumina-baserad djupsekvensering för att erhålla fullständiga arenaviruskodande sekvenser från två av de insamlade fladdermusarterna. Sekvenserna erhållna från RT-PCR och de fullständiga kodande sekvenserna användes för fylogenetiska analyser och för att bestämma de homogena sekvensavstånden.

Resultat

Resultaten visade arenavirus-RNA från 1,62 % (17 av 1047) av de undersökta fladdermössen, tillhörande tre arter - en Artibeus planirostris, fyra Artibeus lituratus och 12 Carollia perspicillata. Virusen från de två Artibeus-arterna identifierades som Tacaribe mammarenavirus, medan viruset som upptäcktes i de 12 proverna av Carollia perspicillata identifierades som en ny art, som författarna gav namnet Tietê mammarenavirus.

Alla prover samlades in i skogs- och stadsområden inom 60 km från varandra, vilket indikerar en möjlig virusreservoar hos fladdermöss i regionen. Liknande nivåer av virus hittades i vävnader från mjälten och lungan, vilket tyder på en systemisk infektion. Den högsta koncentrationen av arenavirus hittades i ett tarmvävnadsprov, vilket tyder på enterisk viral utsöndring.

Fylogenetisk rekonstruktion baserad på de partiella RNA-beroende RNA-polymerasgensekvenserna avslöjade två klader av New World arenavirus i Brasilien. Arenavirusen från de två Artibeus-arterna bildade en clade, medan sekvenserna från Carollia perspicillata-proverna bildade en annan clade. De fullständiga kodande sekvenserna visade en genomorganisation som var identisk med andra mammarenavirus och bildade en monofyletisk grupp med Tacaribe-virus som var väl understödd.

Det maximala sannolikhetsträdet som använde de fullständiga generna för stora segment återvann hela kladden som innehöll Tacaribe-viruset och sekvenser från Brasilien som syster till Junin och Machupo New World arenavirus.

Fylogenetisk analys med användning av de fullständiga generna med små segment visade emellertid ett systerförhållande mellan Ocozocoautla de Espinosa-viruset och kladden innehållande de brasilianska sekvenserna och Tacaribe-virussekvenserna.

Ocozocoautla de Espinosa-viruset tros ha orsakat ett utbrott av hemorragisk feber i Mexiko. Dessutom indikerade inte rekombinationsanalyser och sekvensavstånd rekombinationshändelser.

Den taxonomiska bedömningen av de nya virusarterna från Carollia perspicillata-proverna baserades på parvisa sekvensjämförelser med Tacaribe-virus, som visade en nukleotidsekvensidentitet på mindre än 80 % och en nukleokapsidproteinaminosyraidentitet på 88,6 % till 90 % och närvaron av en distinkt värd. Arten fick sitt namn efter en flod nära provtagningsplatsen.

Slutsatser

Sammanfattningsvis undersökte studien fladdermusarter som samlats in i sydvästra Brasilien med avseende på närvaron av arenavirus-RNA med användning av sekvensamplifieringsmetoder. Resultaten visade närvaron av arenavirus-RNA från tre fladdermusarter, vilket stod för 1,62 % av den totala provstorleken.

De fylogenetiska analyserna visade att arenavirusen som upptäckts i fladdermusproverna är nära besläktade med Tacaribe-viruset, ett arenavirus från New World som finns i fladdermöss. Ett av de upptäckta arenavirusen är en ny art och fick namnet Tietê Mammarenavirus.

Medan New World arenavirus vanligtvis finns i gnagare, tyder resultaten av denna studie på att fladdermöss kan vara arenavirusreservoarer och behöver utforskas ytterligare.

Hänvisning:

• Góes LGB, Fischer C, Campos ACA, de Carvalho C, Moreira-Soto A, Ambar G, et al. (2022) Hochgradig vielfältige Arenaviren in neotropischen Fledermäusen, Brasilien. Neu auftretende Infektionskrankheiten. doi: https://doi.org/10.3201/eid2812.220980 https://wwwnc.cdc.gov/eid/article/28/12/22-0980_article

.