Selon une étude du CDC, un virus de la grippe A d'origine porcine a été détecté chez l'homme au Danemark.

Selon une étude du CDC, un virus de la grippe A d'origine porcine a été détecté chez l'homme au Danemark.

Dans une étude récemment publiée dans Maladies infectieuses émergentes Journal, des chercheurs ont découvert un patient infecté par le virus de la grippe porcine A (IAV) lors d'une surveillance de routine au Centre national de la grippe au Danemark. La variante de la grippe détectée semble être différente de toutes les variantes précédemment trouvées au Danemark.

Lernen: Schwerer Fall einer zoonotischen Infektion beim Menschen mit dem vom Schwein stammenden Influenza-A-Virus, Dänemark, 2021. Bildnachweis: Liya Graphics/Shutterstock

arrière-plan

Selon les chiffres officiels, au cours de la saison grippale 2021-22 au Danemark, 16 160 cas étaient dus au virus grippal A, principalement du sous-type H3N2. Il n’y a eu aucun cas humain de virus de la grippe porcine au cours de cette période. Depuis la pandémie de grippe A (H1N1) de 2009, aucun cas de transmission interhumaine soutenue du VIA n’a été signalé. De plus, seuls des cas sporadiques d’infections humaines par des IAV porcins ont été signalés. Cependant, le potentiel zoonotique des IAV est très préoccupant.

Rapport de cas

Un jeune homme d'une cinquantaine d'années qui travaille dans un abattoir de porcs au Danemark a été admis à l'hôpital le 24 novembre 2021 après une maladie aiguë. Il avait des étourdissements la nuit, suivis de douleurs thoraciques, de douleurs irradiant vers le bras gauche, de diarrhée et de malaises, mais pas de fièvre. Le patient a souffert de convulsions répétées et a dû être admis à l’unité de soins intensifs (USI) et mis sous ventilation pour arrêter les convulsions et faire face à la baisse des niveaux d’oxygène.

Il ne présentait aucune déficience cardiovasculaire, rénale, neurologique ou autre, y compris une pneumonie, qui pourrait expliquer sa soudaine crise de maladie grave. Cependant, un échantillon de gorge prélevé sur le patient s’est révélé positif à l’IAV. Fait remarquable, aucun autre collègue sur le lieu de travail du patient n'a signalé l'apparition de la grippe.

Livre électronique sur la génétique et la génomique

Compilation des meilleurs interviews, articles et actualités de l'année dernière. Téléchargez une copie gratuite

Grâce aux médicaments antiviraux (oseltamivir) et aux soins de soutien, l'état clinique du patient s'est amélioré au cours des deux jours suivants, lui permettant de sortir de l'hôpital. Les chercheurs ont envoyé le reste de l'échantillon au Centre national danois de la grippe, qui a confirmé qu'il était positif à la souche pandémique H1N1.

Une analyse plus approfondie par séquençage du génome entier a révélé que sa séquence consensus est du sous-type H1N1. Notamment, le virus ressemblait davantage aux IAV porcins qu’aux souches de grippe humaine. L'équipe a téléchargé cette séquence dans la base de données de l'Initiative mondiale pour partager toutes les données sur la grippe (GISAID).

La séquence ne correspondait pas aux séquences IAV dans GISAID, comme l'a révélé la recherche avec l'outil de recherche d'alignement local de base (BLAST) ; Cependant, une comparaison avec les séquences internes des virus de la grippe porcine du Danemark a montré une grande similitude avec les IAV porcins de 2021. Cette souche virale présentait plusieurs différences génétiques et antigéniques par rapport aux autres virus grippaux A détectés au Danemark. De plus, il a montré une faible réactogénicité par rapport aux vaccins humains contre la grippe saisonnière actuellement utilisés. De plus, ses analyses phylogénétiques ont révélé que la plupart des segments génétiques étaient similaires au sous-type H1N1. Au contraire, sa neuraminidase et ses segments non structuraux appartenaient au clade 1C de la grippe porcine aviaire A(H1N1), présente en Eurasie.

Conclusion

Auparavant, au Danemark, un patient âgé présentant des comorbidités souffrait d'un syndrome grippal classique (SG). Cependant, le cas rapporté dans cette étude était unique dans la mesure où un adulte auparavant en bonne santé souffrait d’une maladie grave et soudaine. Une autre observation frappante est que ce patient souffrait de convulsions, rares chez les adultes et généralement accompagnées de fièvre ou d'encéphalite. Par conséquent, les souches virales infectantes dans ces deux cas sont probablement génétiquement différentes.

La détection d’une variante de l’IAV grâce à une surveillance de routine a mis en évidence l’importance d’une surveillance continue des IAV humains et porcins présentant un potentiel zoonotique. En outre, la nécessité de prendre des mesures immédiates pour ceux qui entrent en contact avec des porcs en raison de leur profession et de leur expérience du syndrome grippal a été soulignée.

Référence:

• Andersen KM, Vestergaard LS, Nissen JN, George SJ, Ryt-Hansen P, Hjulsager CK, et al. (2022). Schwerer Fall einer zoonotischen Infektion beim Menschen mit dem vom Schwein stammenden Influenza-A-Virus, Dänemark, 2021. Neu auftretende Infektionskrankheiten. doi: https://doi.org/10.3201/eid2812.220935 https://wwwnc.cdc.gov/eid/article/28/12/22-0935_article

.