Studie zkoumá stabilitu DNA viru opičích neštovic v různých vzorcích tělesných tekutin

Studie zkoumá stabilitu DNA viru opičích neštovic v různých vzorcích tělesných tekutin

V nedávno zveřejněné studii v Journal of Infections, vědci použili laboratorní diagnostická testovací data z případů opičích neštovic. Spustili matematické modely, aby předpověděli, jak dlouho zůstane virová deoxyribonukleová kyselina (DNA) z opičích neštovic detekovatelná v různých vzorcích tělesných tekutin.

Lernen: Persistenz der Affenpockenvirus-DNA in klinischen Proben. Bildquelle: MIA Studio/Shutterstock

pozadí

Virus opičích neštovic, který patří do rodu Orthopoxvirus, byl donedávna endemický v zemích západní a střední Afriky. V srpnu 2022 se opičí neštovice objevily v 99 zemích.

Opičí neštovice se projevují slizničními a kožními lézemi, zejména v genitální, perianální a orofaryngeální oblasti, s vysokou prevalencí u mužů, kteří mají sex s muži.

Potvrzení opičích neštovic je založeno na pozitivních testech polymerázové řetězové reakce (PCR), které detekují virovou DNA opičích neštovic ve vzorku tekutiny. Zatímco různé vzorky tělních tekutin byly použity k testování na opičí neštovice, chybí informace o tom, jak stabilní virová DNA zůstává v těchto vzorcích. Tyto informace by mohly významně zlepšit přesnost klinických diagnostických metod pro opičí neštovice.

O studiu

V této studii výzkumníci použili archivované výsledky laboratorních testů ke sběru dat molekulárních důkazů, která byla dále seskupena podle věku a pohlaví pacienta, stavu viru lidské imunodeficience (HIV) a klinických projevů opičích neštovic.

Použili matematické modely, jako je Weibullova parametrická regrese, log-normální a gama modely, aby odhadli dobu, po kterou mohla být DNA viru opičích neštovic detekována v různých typech tělesných tekutin. Doba do ztráty detekce DNA byla odhadnuta na základě počtu dní mezi nástupem symptomů a prvním negativním PCR testem. U vzorků s nejasnými výsledky byla brána v úvahu doba mezi posledním pozitivním výsledkem a prvním negativním výsledkem.

Studie zahrnovala 62 případů opičích neštovic, včetně 23 vzorků moči, 19 výtěrů z lézí a 17 vzorků výtěrů z nosohltanu a rekta. 16, 15, 14 a 14 vzorků spermatu, krve, stolice a slin. nebo Vzorek zahrnoval 49 mužů a 13 žen, včetně 51 HIV negativních lidí.

Klinickými projevy byly kožní vyrážky a léze, horečka, lymfadenopatie, myalgie, bolest hlavy, zimnice a únava v sestupném pořadí podle uváděné frekvence.

Výsledky

Výsledky matematického modelování ukázaly, že perzistence DNA viru opičích neštovic v tělesných tekutinách se pohybovala od 5,7 do 13,5 dne. Střední doba byla nejvyšší u vzorků moči (13,5 dne), následovaly vzorky spermatu a krve (11,4 a 10,5 dne). Virová DNA byla nejméně perzistentní ve vzorcích kožních lézí (průměrně 5,7 dne).

Autoři diskutovali o některých omezeních studie. Studie nezkoumala infekčnost virových částic, pouze perzistenci DNA v tekutinách. Kromě toho se datum odběru vzorku může lišit od data nástupu příznaků. Konečně se autoři domnívají, že trvání perzistence virové DNA v tělesných tekutinách odhadnuté v této studii nemusí být zobecnitelné na všechny infekce opičími neštovicemi, zejména asymptomatické.

Závěry

Nakonec studie zkoumala stabilitu DNA viru opičích neštovic v různých typech vzorků tělesných tekutin pacientů s opičími neštovicemi. Vědci použili matematické modely k odhadu doby do ztráty rozpoznání DNA. Zjistili, že virová DNA opičích neštovic byla nejstabilnější ve vzorcích moči, po nich následovaly vzorky spermatu a krve a nejméně stabilní ve vzorcích kožních lézí.

Výsledky studie mohou být použity pro doporučení klinického testování pro efektivní odběr vzorků a detekci případů opičích neštovic. Rychlé a přesné testování může zlepšit zahájení preventivních opatření, jako je izolace a medikace, a tím omezit další přenos nemoci.

Odkaz:

• Li, Z., Li, XX, Chen, Y., Ruan, Q., Huang, X., Zhu, G. & Sun, J. (2022). Persistenz der Monkeypox-Virus-DNA in klinischen Proben. Zeitschrift für Infektionen. doi: https://doi.org/10.1016/j.jinf.2022.10.013 https://www.journalofinfection.com/article/S0163-4453(22)00611-9/fulltext

.