Studiet undersøger stabiliteten af ​​abekoppevirus-DNA i forskellige kropsvæskeprøver

Studiet undersøger stabiliteten af ​​abekoppevirus-DNA i forskellige kropsvæskeprøver

I en nyligt offentliggjort undersøgelse i Journal of Infections, brugte forskerne laboratoriediagnostiske testdata fra abekopper. De kørte matematiske modeller for at forudsige, hvor længe abekopper viral deoxyribonukleinsyre (DNA) ville forblive påviselig i forskellige kropsvæskeprøver.

Lernen: Persistenz der Affenpockenvirus-DNA in klinischen Proben. Bildquelle: MIA Studio/Shutterstock

baggrund

Abekoppevirussen, som tilhører slægten Orthopoxvirus, var indtil for nylig endemisk i vest- og centralafrikanske lande. Fra august 2022 var der udbrud af abekopper i 99 lande.

Abekopper manifesterer sig gennem slimhinde- og hudlæsioner, især i de genitale, perianale og oropharyngeale områder, med en høj forekomst hos mænd, der har sex med mænd.

Abekopper-bekræftelser er baseret på positiv polymerasekædereaktion (PCR) test, der påviser abekopper viralt DNA i væskeprøven. Mens forskellige kropsvæskeprøver er blevet brugt til at teste for abekopper, er der mangel på information om, hvor stabilt det virale DNA forbliver i disse prøver. Denne information kan forbedre nøjagtigheden af ​​kliniske diagnostiske metoder for abekopper væsentligt.

Om studiet

I denne undersøgelse brugte forskere arkiverede laboratorietestresultater til at indsamle molekylære bevisdata, som blev yderligere grupperet efter patientens alder og køn, status for human immundefektvirus (HIV) og kliniske manifestationer af abekopper.

De brugte matematiske modeller såsom Weibull parametrisk regression, log-normal og gamma-modeller til at estimere, hvor lang tid abekoppevirus-DNA kunne påvises i forskellige typer kropsvæsker. Tiden til tab af DNA-detektion blev estimeret baseret på antallet af dage mellem symptomdebut og den første negative PCR-test. For prøver med uklare resultater blev tiden mellem det sidste positive resultat og det første negative resultat taget i betragtning.

Undersøgelsen omfattede 62 abekopper, herunder 23 urinprøver, 19 læsionspodninger og 17 hver af nasopharyngeale og rektale podninger. 16, 15, 14 og 14 prøver af sæd, blod, afføring og spyt. eller Prøven omfattede 49 mænd og 13 kvinder, herunder 51 HIV-negative personer.

De kliniske manifestationer var hududslæt og læsioner, feber, lymfadenopati, myalgi, hovedpine, kulderystelser og træthed i faldende rækkefølge efter rapporteret hyppighed.

Resultater

Resultaterne af matematisk modellering viste, at persistensen af ​​abekoppevirus-DNA i kropsvæsker varierede fra 5,7 til 13,5 dage. Mediantiden var højest for urinprøver (13,5 dage), efterfulgt af sæd- og blodprøver (henholdsvis 11,4 og 10,5 dage). Viralt DNA var mindst persistent i hudlæsionsprøver (gennemsnit 5,7 dage).

Forfatterne diskuterede nogle af undersøgelsens begrænsninger. Undersøgelsen undersøgte ikke viruspartiklernes smitteevne, kun DNA'ets persistens i væskerne. Derudover kan datoen for prøvetagning afvige fra datoen for debut af symptomer. Endelig mener forfatterne, at varigheden af ​​viral DNA-persistens i kropsvæsker, der er estimeret i denne undersøgelse, muligvis ikke kan generaliseres til alle abekopperinfektioner, især asymptomatiske.

Konklusioner

Endelig undersøgte undersøgelsen stabiliteten af ​​abekoppevirus-DNA i forskellige typer kropsvæskeprøver fra abekoppepatienter. Forskerne brugte matematiske modeller til at estimere tiden til tab af DNA-genkendelse. De fandt, at abekopper-virus-DNA var mest stabilt i urinprøver, efterfulgt af sæd- og blodprøver, og var mindst stabilt i prøver af hudlæsioner.

Resultaterne af undersøgelsen kan bruges til at lave kliniske testanbefalinger for effektiv prøveudtagning og påvisning af abekopper. Hurtig og præcis testning kan forbedre iværksættelsen af ​​forebyggende foranstaltninger såsom isolation og medicinering og derved begrænse videre overførsel af sygdommen.

Reference:

• Li, Z., Li, XX, Chen, Y., Ruan, Q., Huang, X., Zhu, G. & Sun, J. (2022). Persistenz der Monkeypox-Virus-DNA in klinischen Proben. Zeitschrift für Infektionen. doi: https://doi.org/10.1016/j.jinf.2022.10.013 https://www.journalofinfection.com/article/S0163-4453(22)00611-9/fulltext

.