Uuring uurib ahvirõugete viiruse DNA stabiilsust erinevates kehavedelike proovides

Uuring uurib ahvirõugete viiruse DNA stabiilsust erinevates kehavedelike proovides

Hiljuti avaldatud uuringus Infektsioonide ajakiri, kasutasid teadlased ahvirõugete juhtude laboratoorsete diagnostiliste testide andmeid. Nad kasutasid matemaatilisi mudeleid, et ennustada, kui kaua jääb ahvirõugete viiruse desoksüribonukleiinhape (DNA) tuvastatavaks erinevates kehavedelike proovides.

Lernen: Persistenz der Affenpockenvirus-DNA in klinischen Proben. Bildquelle: MIA Studio/Shutterstock

taustal

Ahvirõugete viirus, mis kuulub perekonda Orthopoxvirus, oli kuni viimase ajani endeemiline Lääne- ja Kesk-Aafrika riikides. 2022. aasta augusti seisuga on ahvirõugete puhanguid esinenud 99 riigis.

Ahvirõuged avalduvad limaskestade ja nahakahjustuste kaudu, eriti suguelundites, perianaalsetes ja orofarüngeaalsetes piirkondades, kusjuures levimus on kõrge meestega seksivatel meestel.

Ahvirõugete kinnitused põhinevad positiivsetel polümeraasi ahelreaktsiooni (PCR) testidel, mis tuvastavad vedelikuproovis ahvi viiruse DNA. Kuigi ahvirõugete testimiseks on kasutatud erinevaid kehavedelike proove, puudub teave selle kohta, kui stabiilseks viiruse DNA nendes proovides püsib. See teave võib märkimisväärselt parandada ahvirõugete kliiniliste diagnostikameetodite täpsust.

Uuringu kohta

Käesolevas uuringus kasutasid teadlased arhiveeritud laboratoorsete testide tulemusi molekulaarsete tõendite kogumiseks, mis rühmitati patsiendi vanuse ja soo, inimese immuunpuudulikkuse viiruse (HIV) staatuse ja ahvirõugete kliiniliste ilmingute järgi.

Nad kasutasid matemaatilisi mudeleid, nagu Weibulli parameetriline regressioon, log-normaal- ja gammamudel, et hinnata ahvirõugete viiruse DNA tuvastamise aega erinevat tüüpi kehavedelikes. DNA tuvastamise kadumiseni kuluvat aega hinnati sümptomite ilmnemise ja esimese negatiivse PCR-testi vahelise päevade arvu põhjal. Ebaselgete tulemustega proovide puhul võeti arvesse aega viimase positiivse tulemuse ja esimese negatiivse tulemuse vahel.

Uuring hõlmas 62 ahvirõugete juhtumit, sealhulgas 23 uriiniproovi, 19 kahjustuse tampooniproovi ja 17 nina-neelu ja rektaalset tampooniproovi. 16, 15, 14 ja 14 sperma-, vere-, väljaheite- ja süljeproovi. või Valimisse kuulus 49 meest ja 13 naist, sealhulgas 51 HIV-negatiivset inimest.

Kliinilised ilmingud olid nahalööbed ja -kahjustused, palavik, lümfadenopaatia, müalgia, peavalu, külmavärinad ja väsimus teatatud esinemissageduse kahanevas järjekorras.

Tulemused

Matemaatilise modelleerimise tulemused näitasid, et ahvirõugete viiruse DNA püsivus kehavedelikes jäi vahemikku 5,7–13,5 päeva. Keskmine aeg oli suurim uriiniproovide puhul (13,5 päeva), millele järgnesid sperma- ja vereproovid (vastavalt 11,4 ja 10,5 päeva). Viiruse DNA püsis kõige vähem nahakahjustuse proovides (keskmiselt 5,7 päeva).

Autorid arutasid mõningaid uuringu piiranguid. Uuringus ei uuritud viiruseosakeste nakkavust, vaid ainult DNA püsivust vedelikes. Lisaks võib proovide võtmise kuupäev erineda sümptomite ilmnemise kuupäevast. Lõpuks usuvad autorid, et selles uuringus hinnatud viiruse DNA püsivuse kestus kehavedelikes ei pruugi olla üldistatav kõikidele ahvirõugete infektsioonidele, eriti asümptomaatilisele.

Järeldused

Lõpuks uuriti uuringus ahvirõugete viiruse DNA stabiilsust ahvirõugete patsientide erinevat tüüpi kehavedelike proovides. Teadlased kasutasid matemaatilisi mudeleid, et hinnata aega DNA äratundmise kadumiseni. Nad leidsid, et ahvirõugete viiruse DNA oli kõige stabiilsem uriiniproovides, seejärel sperma- ja vereproovides ning kõige vähem stabiilne nahakahjustuste proovides.

Uuringu tulemusi saab kasutada kliinilise testimise soovituste andmiseks tõhusaks proovide võtmiseks ja ahvirõugete juhtude tuvastamiseks. Kiire ja täpne testimine võib parandada ennetusmeetmete, nagu isoleerimine ja ravimite alustamist, piirates seeläbi haiguse edasist levikut.

Viide:

• Li, Z., Li, XX, Chen, Y., Ruan, Q., Huang, X., Zhu, G. & Sun, J. (2022). Persistenz der Monkeypox-Virus-DNA in klinischen Proben. Zeitschrift für Infektionen. doi: https://doi.org/10.1016/j.jinf.2022.10.013 https://www.journalofinfection.com/article/S0163-4453(22)00611-9/fulltext

.