Tutkimus tutkii apinapoxviruksen DNA:n pysyvyyttä erilaisissa kehon nestenäytteissä

Tutkimus tutkii apinapoxviruksen DNA:n pysyvyyttä erilaisissa kehon nestenäytteissä

Äskettäin julkaistussa tutkimuksessa Infektiolehti, tutkijat käyttivät laboratoriodiagnostisten testien tietoja apinarokkotapauksista. He suorittivat matemaattisia malleja ennustaakseen, kuinka kauan apinarokkoviruksen deoksiribonukleiinihappo (DNA) säilyy havaittavissa eri kehon nestenäytteissä.

Lernen: Persistenz der Affenpockenvirus-DNA in klinischen Proben. Bildquelle: MIA Studio/Shutterstock

tausta

Apinarokkovirus, joka kuuluu sukuun Orthopoxvirus, oli viime aikoihin asti endeeminen Länsi- ja Keski-Afrikan maissa. Elokuuhun 2022 mennessä apinarokkoepidemia on esiintynyt 99 maassa.

Apinarokko ilmenee limakalvo- ja ihovaurioina, erityisesti sukupuolielinten, perianaalien ja suunnielun alueilla, ja esiintyy paljon miehillä, jotka harrastavat seksiä miesten kanssa.

Apinarokkovarmistukset perustuvat positiivisiin polymeraasiketjureaktiotesteihin (PCR), jotka havaitsevat apinarokkoviruksen DNA:ta nestenäytteestä. Vaikka apinarokon testaamiseen on käytetty erilaisia ​​kehon nestenäytteitä, ei ole tietoa siitä, kuinka vakaana virus-DNA pysyy näissä näytteissä. Nämä tiedot voivat parantaa merkittävästi apinarokon kliinisten diagnostisten menetelmien tarkkuutta.

Tietoja tutkimuksesta

Tässä tutkimuksessa tutkijat käyttivät arkistoituja laboratoriotestituloksia kerätäkseen molekyylitodisteita, jotka ryhmiteltiin edelleen potilaan iän ja sukupuolen, ihmisen immuunikatoviruksen (HIV) tilan ja apinarokon kliinisten ilmentymien mukaan.

He käyttivät matemaattisia malleja, kuten Weibull-parametrista regressiota, log-normaali- ja gammamalleja arvioidakseen, kuinka kauan apinapoxviruksen DNA voitiin havaita erityyppisistä ruumiinnesteistä. DNA-tunnistuksen häviämiseen kuluva aika arvioitiin oireiden alkamisen ja ensimmäisen negatiivisen PCR-testin välisen päivän perusteella. Näytteissä, joiden tulokset olivat epäselviä, otettiin huomioon aika viimeisen positiivisen tuloksen ja ensimmäisen negatiivisen tuloksen välillä.

Tutkimukseen sisältyi 62 apinarokkotapausta, mukaan lukien 23 virtsanäytettä, 19 leesion pyyhkäisyä ja 17 nenänielun ja peräsuolen vanupuikkonäytettä. 16, 15, 14 ja 14 näytettä siemennesteestä, verestä, ulosteesta ja syljestä. tai Otokseen kuului 49 miestä ja 13 naista, joista 51 oli HIV-negatiivista henkilöä.

Kliinisinä oireina olivat ihottumat ja -leesiot, kuume, lymfadenopatia, lihaskipu, päänsärky, vilunväristykset ja väsymys raportoitujen esiintymistiheysten mukaisessa alenevassa järjestyksessä.

Tulokset

Matemaattisen mallinnuksen tulokset osoittivat, että apinarokkoviruksen DNA:n pysyvyys kehon nesteissä vaihteli 5,7 - 13,5 vuorokauden välillä. Mediaaniaika oli korkein virtsanäytteillä (13,5 päivää), jota seurasivat siemenneste- ja verinäytteet (11,4 ja 10,5 päivää, vastaavasti). Virus-DNA oli vähiten pysyvä ihovaurionäytteissä (keskimäärin 5,7 päivää).

Kirjoittajat keskustelivat joistakin tutkimuksen rajoituksista. Tutkimuksessa ei tutkittu viruspartikkelien tarttuvuutta, vaan ainoastaan ​​DNA:n pysyvyyttä nesteissä. Lisäksi näytteenottopäivä voi poiketa oireiden alkamispäivästä. Lopuksi kirjoittajat uskovat, että tässä tutkimuksessa arvioitu virus-DNA:n säilymisen kesto kehon nesteissä ei ehkä ole yleistettävissä kaikkiin apinarokkoinfektioihin, etenkään oireettomiin.

Johtopäätökset

Lopuksi tutkimuksessa tarkasteltiin apinarokkoviruksen DNA:n stabiilisuutta apinarokkopotilaiden erityyppisissä kehon nestenäytteissä. Tutkijat käyttivät matemaattisia malleja arvioidakseen DNA-tunnistuksen menettämiseen kuluvan ajan. He havaitsivat, että apinarokkoviruksen DNA oli stabiilin virtsanäytteissä, sen jälkeen siemenneste- ja verinäytteissä, ja se oli vähiten stabiili ihovaurionäytteissä.

Tutkimuksen tuloksia voidaan käyttää kliinisten testaussuositusten tekemiseen apinarokkotapausten tehokkaaseen näytteenottoon ja havaitsemiseen. Nopea ja tarkka testaus voi parantaa ennaltaehkäisevien toimenpiteiden, kuten eristämisen ja lääkityksen, aloittamista, mikä rajoittaa taudin leviämistä edelleen.

Viite:

• Li, Z., Li, XX, Chen, Y., Ruan, Q., Huang, X., Zhu, G. & Sun, J. (2022). Persistenz der Monkeypox-Virus-DNA in klinischen Proben. Zeitschrift für Infektionen. doi: https://doi.org/10.1016/j.jinf.2022.10.013 https://www.journalofinfection.com/article/S0163-4453(22)00611-9/fulltext

.