L'étude examine la stabilité de l'ADN du virus de la variole du singe dans divers échantillons de fluides corporels

L'étude examine la stabilité de l'ADN du virus de la variole du singe dans divers échantillons de fluides corporels

Dans une étude récemment publiée dans Journal des infections, les chercheurs ont utilisé les données de tests de diagnostic en laboratoire provenant de cas de variole du singe. Ils ont exécuté des modèles mathématiques pour prédire combien de temps l’acide désoxyribonucléique (ADN) viral du Monkeypox resterait détectable dans différents échantillons de fluides corporels.

Lernen: Persistenz der Affenpockenvirus-DNA in klinischen Proben. Bildquelle: MIA Studio/Shutterstock

arrière-plan

Le virus de la variole du singe, qui appartient au genre Orthopoxvirus, était jusqu'à récemment endémique dans les pays d'Afrique occidentale et centrale. En août 2022, des épidémies de variole du singe étaient survenues dans 99 pays.

Le Monkeypox se manifeste par des lésions des muqueuses et de la peau, en particulier dans les zones génitales, périanales et oropharyngées, avec une prévalence élevée chez les hommes ayant des rapports sexuels avec des hommes.

Les confirmations de la variole du singe sont basées sur des tests positifs de réaction en chaîne par polymérase (PCR) qui détectent l'ADN viral de la variole du singe dans l'échantillon de liquide. Bien que divers échantillons de fluides corporels aient été utilisés pour tester la variole du singe, il existe un manque d'informations sur la stabilité de l'ADN viral dans ces échantillons. Ces informations pourraient améliorer considérablement la précision des méthodes de diagnostic clinique de la variole du singe.

À propos de l'étude

Dans la présente étude, les chercheurs ont utilisé les résultats de tests de laboratoire archivés pour collecter des données de preuves moléculaires, qui ont ensuite été regroupées par âge et sexe des patients, statut du virus de l'immunodéficience humaine (VIH) et manifestations cliniques de la variole du singe.

Ils ont utilisé des modèles mathématiques tels que la régression paramétrique de Weibull, des modèles log-normaux et gamma pour estimer la durée pendant laquelle l'ADN du virus de la variole du singe pouvait être détecté dans différents types de fluides corporels. Le délai avant la perte de détection de l’ADN a été estimé sur la base du nombre de jours entre l’apparition des symptômes et le premier test PCR négatif. Pour les échantillons dont les résultats ne sont pas clairs, le délai entre le dernier résultat positif et le premier résultat négatif a été pris en compte.

L'étude a porté sur 62 cas de variole du singe, dont 23 échantillons d'urine, 19 prélèvements de lésions et 17 prélèvements nasopharyngés et rectaux. 16, 15, 14 et 14 échantillons de sperme, sang, selles et salive. ou L'échantillon comprenait 49 hommes et 13 femmes, dont 51 personnes séronégatives.

Les manifestations cliniques étaient des éruptions cutanées et des lésions, de la fièvre, des adénopathies, des myalgies, des maux de tête, des frissons et de la fatigue, par ordre décroissant de fréquence rapportée.

Résultats

Les résultats de la modélisation mathématique ont montré que la persistance de l’ADN du virus de la variole du singe dans les fluides corporels variait entre 5,7 et 13,5 jours. Le délai médian était le plus élevé pour les échantillons d’urine (13,5 jours), suivis par les échantillons de sperme et de sang (11,4 et 10,5 jours, respectivement). L'ADN viral était le moins persistant dans les échantillons de lésions cutanées (en moyenne 5,7 jours).

Les auteurs ont discuté de certaines des limites de l'étude. L’étude n’a pas examiné le pouvoir infectieux des particules virales, mais uniquement la persistance de l’ADN dans les fluides. De plus, la date de prélèvement des échantillons peut différer de la date d’apparition des symptômes. Enfin, les auteurs estiment que la durée de persistance de l’ADN viral dans les fluides corporels estimée dans cette étude pourrait ne pas être généralisable à toutes les infections par le singe, en particulier celles asymptomatiques.

Conclusions

Enfin, l’étude a examiné la stabilité de l’ADN du virus de la variole du singe dans différents types d’échantillons de fluides corporels provenant de patients atteints de la variole du singe. Les chercheurs ont utilisé des modèles mathématiques pour estimer le temps nécessaire à la perte de la reconnaissance de l'ADN. Ils ont découvert que l’ADN viral du Monkeypox était le plus stable dans les échantillons d’urine, suivis par les échantillons de sperme et de sang, et qu’il était le moins stable dans les échantillons de lésions cutanées.

Les résultats de l’étude peuvent être utilisés pour formuler des recommandations en matière de tests cliniques pour un échantillonnage et une détection efficaces des cas de variole du singe. Des tests rapides et précis peuvent améliorer la mise en place de mesures préventives telles que l’isolement et la médication, limitant ainsi la transmission de la maladie.

Référence:

• Li, Z., Li, XX, Chen, Y., Ruan, Q., Huang, X., Zhu, G. & Sun, J. (2022). Persistenz der Monkeypox-Virus-DNA in klinischen Proben. Zeitschrift für Infektionen. doi: https://doi.org/10.1016/j.jinf.2022.10.013 https://www.journalofinfection.com/article/S0163-4453(22)00611-9/fulltext

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