Pētījumā tiek pārbaudīta pērtiķu baku vīrusa DNS stabilitāte dažādos ķermeņa šķidruma paraugos

Pētījumā tiek pārbaudīta pērtiķu baku vīrusa DNS stabilitāte dažādos ķermeņa šķidruma paraugos

Nesen publicētā pētījumā Infekciju žurnāls, pētnieki izmantoja laboratorijas diagnostikas testu datus no pērtiķu baku gadījumiem. Viņi veica matemātiskos modeļus, lai prognozētu, cik ilgi pērtiķu baku vīrusa dezoksiribonukleīnskābe (DNS) paliks nosakāma dažādos ķermeņa šķidruma paraugos.

Lernen: Persistenz der Affenpockenvirus-DNA in klinischen Proben. Bildquelle: MIA Studio/Shutterstock

fons

Pērtiķu baku vīruss, kas pieder pie Orthopoxvirus ģints, vēl nesen bija endēmisks Rietumāfrikas un Centrālāfrikas valstīs. 2022. gada augustā pērtiķu baku uzliesmojumi ir notikuši 99 valstīs.

Pērtiķu bakas izpaužas ar gļotādas un ādas bojājumiem, īpaši dzimumorgānu, perianālo un orofaringālo apvidos, ar augstu izplatību vīriešiem, kuriem ir sekss ar vīriešiem.

Pērtiķu baku apstiprinājumi ir balstīti uz pozitīviem polimerāzes ķēdes reakcijas (PCR) testiem, kas atklāj pērtiķu baku vīrusa DNS šķidruma paraugā. Lai gan pērtiķu baku noteikšanai ir izmantoti dažādi ķermeņa šķidruma paraugi, trūkst informācijas par to, cik stabila šajos paraugos saglabājas vīrusa DNS. Šī informācija varētu ievērojami uzlabot pērtiķu baku klīniskās diagnostikas metožu precizitāti.

Par pētījumu

Šajā pētījumā pētnieki izmantoja arhivētos laboratorijas testu rezultātus, lai savāktu molekulāro pierādījumu datus, kas tika tālāk grupēti pēc pacienta vecuma un dzimuma, cilvēka imūndeficīta vīrusa (HIV) statusa un pērtiķu baku klīniskajām izpausmēm.

Viņi izmantoja matemātiskos modeļus, piemēram, Veibula parametrisko regresiju, log-normālo un gamma modeļus, lai novērtētu, cik ilgi pērtiķu baku vīrusa DNS var noteikt dažāda veida ķermeņa šķidrumos. Laiks līdz DNS noteikšanas zudumam tika aprēķināts, pamatojoties uz dienu skaitu starp simptomu rašanos un pirmo negatīvo PCR testu. Paraugiem ar neskaidriem rezultātiem tika ņemts vērā laiks starp pēdējo pozitīvo rezultātu un pirmo negatīvo rezultātu.

Pētījumā tika iekļauti 62 pērtiķu baku gadījumi, tostarp 23 urīna paraugi, 19 bojājumu uztriepes un 17 nazofaringeālās un taisnās zarnas uztriepes. 16, 15, 14 un 14 spermas, asiņu, izkārnījumu un siekalu paraugi. vai Izlasē bija 49 vīrieši un 13 sievietes, tostarp 51 HIV negatīvs cilvēks.

Klīniskās izpausmes bija ādas izsitumi un bojājumi, drudzis, limfadenopātija, mialģija, galvassāpes, drebuļi un nogurums ziņotā biežuma dilstošā secībā.

Rezultāti

Matemātiskās modelēšanas rezultāti parādīja, ka pērtiķu baku vīrusa DNS noturība ķermeņa šķidrumos svārstījās no 5,7 līdz 13,5 dienām. Vidējais laiks bija augstākais urīna paraugiem (13,5 dienas), kam sekoja spermas un asins paraugi (attiecīgi 11,4 un 10,5 dienas). Vīrusu DNS bija vismazāk noturīga ādas bojājumu paraugos (vidēji 5,7 dienas).

Autori apsprieda dažus pētījuma ierobežojumus. Pētījumā netika pārbaudīta vīrusa daļiņu inficētspēja, tikai DNS noturība šķidrumos. Turklāt paraugu ņemšanas datums var atšķirties no simptomu rašanās datuma. Visbeidzot, autori uzskata, ka šajā pētījumā aprēķinātais vīrusa DNS noturības ilgums ķermeņa šķidrumos var nebūt vispārināms visām pērtiķu baku infekcijām, īpaši asimptomātiskām.

Secinājumi

Visbeidzot, pētījumā tika pārbaudīta pērtiķu baku vīrusa DNS stabilitāte dažāda veida ķermeņa šķidruma paraugos no pērtiķu bakām pacientiem. Pētnieki izmantoja matemātiskos modeļus, lai novērtētu laiku līdz DNS atpazīšanas zaudēšanai. Viņi atklāja, ka pērtiķu baku vīrusa DNS bija visstabilākā urīna paraugos, kam sekoja spermas un asins paraugi, un vismazāk stabila bija ādas bojājumu paraugos.

Pētījuma rezultātus var izmantot, lai sniegtu klīniskās pārbaudes ieteikumus efektīvai paraugu ņemšanai un pērtiķu baku gadījumu noteikšanai. Ātra un precīza pārbaude var uzlabot tādu profilaktisko pasākumu uzsākšanu kā izolācija un medikamenti, tādējādi ierobežojot turpmāku slimības pārnešanu.

Atsauce:

• Li, Z., Li, XX, Chen, Y., Ruan, Q., Huang, X., Zhu, G. & Sun, J. (2022). Persistenz der Monkeypox-Virus-DNA in klinischen Proben. Zeitschrift für Infektionen. doi: https://doi.org/10.1016/j.jinf.2022.10.013 https://www.journalofinfection.com/article/S0163-4453(22)00611-9/fulltext

.