Badanie sprawdza stabilność DNA wirusa ospy małpiej w różnych próbkach płynów ustrojowych

Badanie sprawdza stabilność DNA wirusa ospy małpiej w różnych próbkach płynów ustrojowych

W niedawno opublikowanym badaniu w Dziennik infekcji naukowcy wykorzystali dane z laboratoryjnych testów diagnostycznych dotyczące przypadków ospy małpiej. Opracowali modele matematyczne, aby przewidzieć, jak długo kwas dezoksyrybonukleinowy (DNA) wirusa ospy małpiej pozostanie wykrywalny w różnych próbkach płynów ustrojowych.

Lernen: Persistenz der Affenpockenvirus-DNA in klinischen Proben. Bildquelle: MIA Studio/Shutterstock

tło

Wirus ospy małpiej, należący do rodzaju Orthopoxvirus, do niedawna występował endemicznie w krajach Afryki Zachodniej i Środkowej. Od sierpnia 2022 r. ogniska ospy małpiej wystąpiły w 99 krajach.

Ospa małpia objawia się zmianami na błonach śluzowych i skórze, szczególnie w okolicy narządów płciowych, okolicy odbytu i jamy ustnej i gardła, z dużą częstością występowania u mężczyzn utrzymujących kontakty seksualne z mężczyznami.

Potwierdzenie ospy małpiej opiera się na dodatnich testach reakcji łańcuchowej polimerazy (PCR), które wykrywają DNA wirusa ospy małpiej w próbce płynu. Chociaż do badania na obecność ospy małpiej używano różnych próbek płynów ustrojowych, brakuje informacji na temat stabilności wirusowego DNA w tych próbkach. Informacje te mogą znacząco poprawić dokładność klinicznych metod diagnostycznych ospy małpiej.

O badaniu

W niniejszym badaniu naukowcy wykorzystali zarchiwizowane wyniki badań laboratoryjnych do zebrania danych molekularnych, które następnie pogrupowano według wieku i płci pacjentów, statusu ludzkiego wirusa niedoboru odporności (HIV) oraz objawów klinicznych ospy małpiej.

Wykorzystali modele matematyczne, takie jak regresja parametryczna Weibulla, modele logarytmiczno-normalne i modele gamma, aby oszacować czas, przez jaki DNA wirusa ospy małpiej można wykryć w różnych typach płynów ustrojowych. Czas do utraty wykrywalności DNA oszacowano na podstawie liczby dni pomiędzy wystąpieniem objawów a pierwszym ujemnym wynikiem testu PCR. W przypadku próbek o niejasnych wynikach brano pod uwagę czas pomiędzy ostatnim wynikiem dodatnim a pierwszym wynikiem ujemnym.

Do badania włączono 62 przypadki ospy małpiej, w tym 23 próbki moczu, 19 wymazów ze zmian chorobowych i po 17 próbek wymazów z nosogardzieli i odbytnicy. 16, 15, 14 i 14 próbek nasienia, krwi, kału i śliny. lub Próba obejmowała 49 mężczyzn i 13 kobiet, w tym 51 osób zakażonych wirusem HIV.

Objawy kliniczne obejmowały wysypki i zmiany skórne, gorączkę, powiększenie węzłów chłonnych, bóle mięśni, ból głowy, dreszcze i zmęczenie w malejącej kolejności zgłaszanej częstości.

Wyniki

Wyniki modelowania matematycznego wykazały, że trwałość DNA wirusa ospy małpiej w płynach ustrojowych wahała się od 5,7 do 13,5 dnia. Mediana czasu była najwyższa w przypadku próbek moczu (13,5 dnia), a następnie próbek nasienia i krwi (odpowiednio 11,4 i 10,5 dnia). Wirusowe DNA było najmniej trwałe w próbkach zmian skórnych (średnio 5,7 dnia).

Autorzy omówili niektóre ograniczenia badania. W badaniu nie badano zakaźności cząstek wirusa, a jedynie trwałość DNA w płynach. Ponadto data pobrania próbki może różnić się od daty wystąpienia objawów. Wreszcie autorzy uważają, że oszacowanego w tym badaniu czasu utrzymywania się wirusowego DNA w płynach ustrojowych nie można uogólniać na wszystkie zakażenia ospą małpią, zwłaszcza te bezobjawowe.

Wnioski

Na koniec w badaniu zbadano stabilność DNA wirusa ospy małpiej w różnych rodzajach próbek płynów ustrojowych pobranych od pacjentów z ospą małpią. Naukowcy wykorzystali modele matematyczne do oszacowania czasu do utraty rozpoznawania DNA. Odkryli, że DNA wirusa ospy małpiej było najbardziej stabilne w próbkach moczu, następnie w próbkach nasienia i krwi, a najmniej stabilne w próbkach zmian skórnych.

Wyniki badania można wykorzystać do opracowania zaleceń dotyczących badań klinicznych w celu skutecznego pobierania próbek i wykrywania przypadków ospy małpiej. Szybkie i dokładne badania mogą ułatwić rozpoczęcie stosowania środków zapobiegawczych, takich jak izolacja i przyjmowanie leków, ograniczając w ten sposób dalsze przenoszenie choroby.

Odniesienie:

• Li, Z., Li, XX, Chen, Y., Ruan, Q., Huang, X., Zhu, G. & Sun, J. (2022). Persistenz der Monkeypox-Virus-DNA in klinischen Proben. Zeitschrift für Infektionen. doi: https://doi.org/10.1016/j.jinf.2022.10.013 https://www.journalofinfection.com/article/S0163-4453(22)00611-9/fulltext

.