Štúdia skúma stabilitu DNA vírusu opičích kiahní v rôznych vzorkách telesných tekutín

Štúdia skúma stabilitu DNA vírusu opičích kiahní v rôznych vzorkách telesných tekutín

V nedávno publikovanej štúdii v Journal of Infections, vedci použili laboratórne diagnostické testovacie údaje z prípadov opičích kiahní. Spustili matematické modely, aby predpovedali, ako dlho zostane vírusová deoxyribonukleová kyselina (DNA) z opičích kiahní detekovateľná v rôznych vzorkách telesných tekutín.

Lernen: Persistenz der Affenpockenvirus-DNA in klinischen Proben. Bildquelle: MIA Studio/Shutterstock

pozadia

Vírus opičích kiahní, ktorý patrí do rodu Orthopoxvirus, bol donedávna endemický v krajinách západnej a strednej Afriky. Od augusta 2022 sa epidémie opičích kiahní vyskytli v 99 krajinách.

Opičie kiahne sa prejavujú slizničnými a kožnými léziami, najmä v genitálnej, perianálnej a orofaryngeálnej oblasti, s vysokou prevalenciou u mužov, ktorí majú sex s mužmi.

Potvrdenia opičích kiahní sú založené na pozitívnych testoch polymerázovej reťazovej reakcie (PCR), ktoré detegujú vírusovú DNA opičích kiahní vo vzorke tekutiny. Aj keď sa na testovanie opičích kiahní použili rôzne vzorky telesných tekutín, chýbajú informácie o tom, ako stabilná zostáva vírusová DNA v týchto vzorkách. Tieto informácie by mohli výrazne zlepšiť presnosť klinických diagnostických metód pre opičie kiahne.

O štúdiu

V tejto štúdii výskumníci použili archivované výsledky laboratórnych testov na zber údajov o molekulárnych dôkazoch, ktoré boli ďalej zoskupené podľa veku a pohlavia pacienta, stavu vírusu ľudskej imunodeficiencie (HIV) a klinických prejavov opičích kiahní.

Použili matematické modely, ako je Weibullova parametrická regresia, log-normálne a gama modely, aby odhadli dĺžku času, počas ktorého je možné detegovať DNA vírusu opičích kiahní v rôznych typoch telesných tekutín. Čas do straty detekcie DNA sa odhadol na základe počtu dní medzi nástupom symptómov a prvým negatívnym testom PCR. Pri vzorkách s nejasnými výsledkami sa bral do úvahy čas medzi posledným pozitívnym výsledkom a prvým negatívnym výsledkom.

Štúdia zahŕňala 62 prípadov opičích kiahní, vrátane 23 vzoriek moču, 19 výterov z lézií a 17 vzoriek výterov z nosohltanu a konečníka. 16, 15, 14 a 14 vzoriek spermy, krvi, stolice a slín. alebo Vzorka zahŕňala 49 mužov a 13 žien, vrátane 51 HIV negatívnych ľudí.

Klinickými prejavmi boli kožné vyrážky a lézie, horúčka, lymfadenopatia, myalgia, bolesť hlavy, triaška a únava v zostupnom poradí podľa hlásenej frekvencie.

Výsledky

Výsledky matematického modelovania ukázali, že perzistencia DNA vírusu opičích kiahní v telesných tekutinách sa pohybovala od 5,7 do 13,5 dňa. Medián času bol najvyšší pre vzorky moču (13,5 dňa), po ktorých nasledovali vzorky spermy a krvi (11,4 a 10,5 dňa). Vírusová DNA bola najmenej perzistentná vo vzorkách kožných lézií (priemerne 5,7 dňa).

Autori diskutovali o niektorých obmedzeniach štúdie. Štúdia neskúmala infekčnosť vírusových častíc, iba perzistenciu DNA v tekutinách. Okrem toho sa dátum odberu vzorky môže líšiť od dátumu nástupu symptómov. Nakoniec sa autori domnievajú, že trvanie pretrvávania vírusovej DNA v telesných tekutinách odhadnuté v tejto štúdii nemusí byť zovšeobecniteľné na všetky infekcie opičích kiahní, najmä asymptomatické.

Závery

Nakoniec štúdia skúmala stabilitu DNA vírusu opičích kiahní v rôznych typoch vzoriek telesných tekutín od pacientov s opičím kiahňam. Vedci použili matematické modely na odhadnutie času do straty rozpoznávania DNA. Zistili, že vírusová DNA opičích kiahní bola najstabilnejšia vo vzorkách moču, po ktorých nasledovali vzorky spermy a krvi a najmenej stabilná bola vo vzorkách kožných lézií.

Výsledky štúdie sa môžu použiť na vytvorenie odporúčaní pre klinické testovanie na účinný odber vzoriek a detekciu prípadov opičích kiahní. Rýchle a presné testovanie môže zlepšiť začatie preventívnych opatrení, ako je izolácia a medikácia, čím sa obmedzí ďalší prenos choroby.

Referencia:

• Li, Z., Li, XX, Chen, Y., Ruan, Q., Huang, X., Zhu, G. & Sun, J. (2022). Persistenz der Monkeypox-Virus-DNA in klinischen Proben. Zeitschrift für Infektionen. doi: https://doi.org/10.1016/j.jinf.2022.10.013 https://www.journalofinfection.com/article/S0163-4453(22)00611-9/fulltext

.