Studien undersöker stabiliteten hos appoxvirus-DNA i olika kroppsvätskeprover

Studien undersöker stabiliteten hos appoxvirus-DNA i olika kroppsvätskeprover

I en nyligen publicerad studie i Journal of Infections, forskarna använde diagnostiska testdata för laboratoriet från monkeypoxfall. De körde matematiska modeller för att förutsäga hur länge appox viral deoxiribonukleinsyra (DNA) skulle förbli detekterbar i olika kroppsvätskeprover.

Lernen: Persistenz der Affenpockenvirus-DNA in klinischen Proben. Bildquelle: MIA Studio/Shutterstock

bakgrund

Monkeypoxviruset, som tillhör släktet Orthopoxvirus, var tills nyligen endemiskt i väst- och centralafrikanska länder. I augusti 2022 har utbrott av apkoppor inträffat i 99 länder.

Apkoppor visar sig genom slemhinne- och hudskador, särskilt i genital, perianal och orofaryngeal områden, med en hög prevalens hos män som har sex med män.

Monkeypox-bekräftelser är baserade på positiv polymeraskedjereaktion (PCR)-tester som detekterar appoxvirus-DNA i vätskeprovet. Medan olika kroppsvätskeprover har använts för att testa för apkoppor, finns det en brist på information om hur stabilt virus-DNA:t förblir i dessa prover. Denna information kan avsevärt förbättra noggrannheten hos kliniska diagnostiska metoder för appox.

Om studien

I den aktuella studien använde forskarna arkiverade laboratorietestresultat för att samla in molekylära bevisdata, som ytterligare grupperades efter patientens ålder och kön, status för humant immunbristvirus (HIV) och kliniska manifestationer av apkoppor.

De använde matematiska modeller som Weibull parametrisk regression, log-normal och gamma-modeller för att uppskatta hur lång tid appoxvirus-DNA kunde detekteras i olika typer av kroppsvätskor. Tiden till förlust av DNA-detektion uppskattades baserat på antalet dagar mellan debut av symtom och det första negativa PCR-testet. För prover med oklara resultat togs hänsyn till tiden mellan det senaste positiva resultatet och det första negativa resultatet.

Studien inkluderade 62 fall av apkoppor, inklusive 23 urinprover, 19 sårprover, och 17 vardera av nasofaryngeala och rektala pinnprover. 16, 15, 14 och 14 prover av sperma, blod, avföring och saliv. eller I urvalet ingick 49 män och 13 kvinnor, inklusive 51 HIV-negativa personer.

De kliniska manifestationerna var hudutslag och lesioner, feber, lymfadenopati, myalgi, huvudvärk, frossa och trötthet i fallande ordning efter rapporterad frekvens.

Resultat

Resultaten av matematisk modellering visade att persistensen av appoxvirus-DNA i kroppsvätskor varierade från 5,7 till 13,5 dagar. Mediantiden var högst för urinprov (13,5 dagar), följt av sperma och blodprov (11,4 respektive 10,5 dagar). Viralt DNA var minst persistent i hudskador (i genomsnitt 5,7 dagar).

Författarna diskuterade några av studiens begränsningar. Studien undersökte inte viruspartiklarnas infektivitet, bara DNA:ts beständighet i vätskorna. Dessutom kan datumet för provtagningen skilja sig från datumet för debut av symtom. Slutligen tror författarna att varaktigheten av virus-DNA-persistens i kroppsvätskor som uppskattas i denna studie kanske inte är generaliserbar till alla appoxinfektioner, särskilt asymtomatiska.

Slutsatser

Slutligen undersökte studien stabiliteten hos appoxvirus-DNA i olika typer av kroppsvätskeprover från appoxpatienter. Forskarna använde matematiska modeller för att uppskatta tiden till förlust av DNA-igenkänning. De fann att appoxvirus-DNA var mest stabilt i urinprover, följt av sperma och blodprover, och var minst stabilt i hudskador.

Resultaten av studien kan användas för att ge kliniska testrekommendationer för effektiv provtagning och upptäckt av appoxfall. Snabba och exakta tester kan förbättra initieringen av förebyggande åtgärder som isolering och medicinering, och därigenom begränsa vidare överföring av sjukdomen.

Hänvisning:

• Li, Z., Li, XX, Chen, Y., Ruan, Q., Huang, X., Zhu, G. & Sun, J. (2022). Persistenz der Monkeypox-Virus-DNA in klinischen Proben. Zeitschrift für Infektionen. doi: https://doi.org/10.1016/j.jinf.2022.10.013 https://www.journalofinfection.com/article/S0163-4453(22)00611-9/fulltext

.