Une étude ne montre aucune transmission non détectée du virus de la variole du singe avant mai 2022 à Rotterdam et à Amsterdam

Une étude ne montre aucune transmission non détectée du virus de la variole du singe avant mai 2022 à Rotterdam et à Amsterdam

Dans une étude récemment publiée medRxiv * Les chercheurs des serveurs de préimpression ont étudié si une transmission non détectée du virus de la variole humaine du singe (hMPXV) s'était produite avant le premier cas documenté de MPX à Rotterdam et à Amsterdam.

Lernen: Ausbruch des humanen Affenpockenvirus bei Männern, die Sex mit Männern haben, in Amsterdam und Rotterdam, Niederlande: keine Hinweise auf eine unentdeckte Übertragung vor Mai 2022 in einer retrospektiven Studie. Bildnachweis: Dotted Yeti/Shutterstock

arrière-plan

Le premier cas de hMPXV a été documenté à Amsterdam le 10 mai 2022 et à Rotterdam le 19 mai 202222. Depuis lors, plusieurs personnes dans le monde ont été touchées par le MPX. Cependant, la transmission potentielle antérieure du hMPXV parmi les Néerlandais est inconnue. L’analyse de la transmission non identifiée en cours du hMPXV pourrait améliorer la compréhension de la dynamique de l’épidémie de MPXV en cours en 2022 et guider l’élaboration de politiques et d’interventions visant à réduire le fardeau sanitaire du MPX.

À propos des études

Dans la présente étude rétrospective, les chercheurs ont vérifié si une transmission non détectée du virus humain de la variole du singe (hMPXV) s'était produite avant le cas initialement documenté d'infection par le hMPXV à Rotterdam et à Amsterdam.

Au total, 401 échantillons ano-rectaux et d'ulcères provenant d'hommes ayant eu des rapports sexuels avec des hommes (HSH) fréquentant les centres de santé sexuelle (CSH) de Rotterdam et d'Amsterdam, datés du 14 février, ont été analysés. Le CSH reçoit régulièrement les prélèvements ano-rectaux pour les tests Ct (Chlamydia trachomatis) et Ng (Neisseria gonorrhoeae). En revanche, des échantillons d'ulcères sont obtenus pour les tests VZV (virus varicelle-zona), Tp (Treponema pallidum) et HSV (virus de l'herpès simplex)-1, -2. Tous les spécimens ont été conservés pendant quatre mois.

Une analyse quantitative par réaction en chaîne par polymérase (qPCR) a été réalisée entre le 14 et le 9 février pour détecter le hMPXV dans les échantillons. Les données des participants ont été dissociées de leurs fichiers électroniques avant que les rapports de test hMPXV ne soient disponibles. L'équipe a utilisé rétrospectivement les dates limites comme la veille de la première présentation d'un cas MPX identifié à Rotterdam et à Amsterdam, respectivement le 18 et le 9 mai.

Au CSH de Rotterdam, des échantillons ano-rectaux provenant d'individus HSH régulièrement collectés pour des tests Ct ou Ng et des échantillons d'ulcères collectés pour les tests VZV et HSV-1, -2 ont été soumis au test hMPXV entre le 1er avril et le 18 mai 2022. L'équipe a découvert le hMPXV grâce à une analyse PCR quantitative du pan-orthopoxvirus, suivie d'un séquençage du génome entier ou en utilisant une cible spécifique au MPXV. En outre, une analyse phylogénétique a été réalisée à l'aide des séquences GenBank disponibles et des méthodes de sous-échantillonnage.

Résultats

À Amsterdam, 169 échantillons ano-rectaux positifs pour Ng/Ct et 125 échantillons d'ulcères (indépendamment de la positivité au VZV, au Tp ou au HSV-1, -2) ont été testés pour la présence de hMPXV. Aucun des échantillons n’était positif pour hMPXV. À Rotterdam, 93 échantillons ano-rectaux positifs au Ct/Ng ont été testés, parmi lesquels 30 visiteurs ont signalé des plaintes entre le 1er avril et le 18 mai 18. De plus, 12 échantillons d'ulcères ont été testés pour la présence de hMPXV au cours de cette période. Un résident du groupe échantillon d’ulcères d’Amsterdam et un résident du groupe échantillon ano-rectal de Rotterdam ont été identifiés comme hMPXV positifs au cours de la première semaine de mai 2022.

Le patient hMPXV positif diagnostiqué à Amsterdam était âgé de 50 à 54 ans, présentait de multiples ulcères et une éruption cutanée prurigineuse sur la partie supérieure des jambes, n'avait pas présenté d'infection sexuellement transmissible (IST) et avait reçu un diagnostic d'herpès génital lors de la consultation, n'avait pas reçu de PrEP anti-humaine (prophylaxie pré-exposition). Le receveur du virus de l'immunodéficience (VIH) a déclaré avoir utilisé occasionnellement un préservatif anal avec un partenaire sexuel au cours des six derniers mois et avait déjà reçu un diagnostic d'infection par le VIH, d'infection par Ct, d'infection par Ng et de syphilis primaire.

Le patient hMPXV positif, diagnostiqué à Rotterdam au cours d'une période similaire, avait entre 20 et 24 ans, souffrait de rectite, avait été signalé pour une IST, avait été diagnostiqué lors d'une consultation avec Ct et Ng ano-rectaux et pharyngés, avait reçu une PrEP pour le VIH, avait fait état d'une utilisation occasionnelle de préservatifs anaux chez 30 partenaires sexuels au cours des six derniers mois, avait participé à des relations sexuelles en groupe et à une consommation de drogues récréatives et avait déjà reçu un diagnostic d'abus sexuel. maladie transmise.

Les séquences de l'individu HMPXV positif d'Amsterdam MSM ont été identifiées comme des séquences du clade IIb (B.1) et étaient étroitement liées aux souches mondiales de hMPXV. Les séquences résidentes de Rotterdam positives pour hMPXV n'ont pas pu être analysées en raison d'une insuffisance d'acide désoxyribonucléique (ADN). Les deux cas positifs pour hMPXV ont été identifiés au cours d’une période (fin avril 2022) coïncidant avec celle de la première documentation de cas MPX en Espagne (26 avril), au Portugal (29 avril) et au Royaume-Uni (Royaume-Uni, 21 avril). . En moyenne, le hMPXV a été incubé pendant neuf jours dans les cas diagnostiqués aux Pays-Bas.

Avant mai 2022, aucune preuve d’une transmission généralisée du hMPXV n’avait été trouvée dans les réseaux sexuels d’HSH néerlandais. Il est très probable que la propagation de l’épidémie néerlandaise de hMPXV à travers l’Europe s’est produite dans un court laps de temps au cours de la saison du printemps 2022 parmi les individus HSH activement impliqués dans une activité sexuelle.

Dans l’ensemble, les résultats de l’étude n’ont montré aucune preuve d’une transmission étendue et non détectée du hMPXV parmi les HSH vivant à Rotterdam ou à Amsterdam avant mai 2022. Les résultats de l’étude sont cohérents avec ceux d’autres villes européennes et soutiennent une épidémie clonale mondiale de hMPXV au printemps 2022.

*REMARQUE importante

medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui n'ont pas été évalués par des pairs et ne doivent donc pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/le comportement lié à la santé, ou être traités comme des informations établies.

Référence:

• Henry J. de Vrieset al. (2022). Ausbruch des humanen Affenpockenvirus bei Männern, die Sex mit Männern haben, in Amsterdam und Rotterdam, Niederlande: keine Hinweise auf eine unentdeckte Übertragung vor Mai 2022 in einer retrospektiven Studie. medRxiv. doi: https://doi.org/10.1101/2022.11.19.22282179 https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2022.11.19.22282179v1

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