Una nueva investigación desentraña el código postal bacteriano del cáncer colorrectal para la predicción y la supervivencia

Una nueva investigación desentraña el código postal bacteriano del cáncer colorrectal para la predicción y la supervivencia

Un estudio reciente muestra que las bacterias que viven en los tumores colorrectales forman ecosistemas distintos que están estrechamente relacionados con la progresión de la enfermedad.nortey resultados de los pacientes. Estos microbios "residentes en los tejidos" parecen desempeñar un papel esencial en la configuración de la biología del tumor y pueden ayudar a predecir la supervivencia del paciente con mayor precisión que los factores clínicos tradicionales por sí solos.

La investigación fue realizada por científicos de BGI Genomics en colaboración con la Universidad de Uppsala, la Universidad de Umeå y el Real Instituto de Tecnología KTH. Fue publicado encomunicación de la naturalezaPrincipios de diciembre de 2025.

Al analizar casi 1000 muestras de cáncer colorrectal, los investigadores identificaron patrones microbianos específicos asociados con la ubicación del tumor, las características genéticas y los resultados de los pacientes. También desarrollaron una nueva puntuación de riesgo microbiano (MRS) basada en estos patrones, lo que proporciona una forma práctica de transformar datos complejos del microbioma en conocimientos de pronóstico.

Este trabajo se basa en una colaboración a largo plazo entre BGI Genomics y la red de investigación U-CAN en Suecia. Aestudio previopor el mismo equipo, publicado enNaturalezael año pasado estableció un marco genómico integral para el cáncer colorrectal mediante secuenciación del genoma completo y del transcriptoma a gran escala. La nueva investigación amplía este marco para incluir una nueva dimensión crucial: la caracterización sistemática de los microbios residentes en los tejidos y proporciona conocimientos más profundos sobre el complejo panorama biológico del cáncer colorrectal.

Las comunidades microbianas difieren de izquierda a derecha.

Uno de los hallazgos más sorprendentes es que la ubicación anatómica del tumor tiene una influencia significativa en su microbioma. Los cánceres que surgen en los lados derecho e izquierdo del colon albergan comunidades microbianas significativamente diferentes.

Los tumores del lado derecho estuvieron dominadosFirmicutesLas bacterias, incluidas familias comoLachnospiraceae(Por ejemplo,Blautia) Yruminococcáceas(incluidoFaecalibacterium). Estos tumores contenían una gran cantidad de bacterias pero mostraban una menor diversidad microbiana general.

Por el contrario, los tumores del lado izquierdo y rectales sustentaron comunidades más diversas con menor abundancia bacteriana. Estas ubicaciones fueron enriquecidas con microbios comoEscherichia coli (E. coli),Akkermansia muciniphilaYPorfiromonasEspecies.

La diferencia entre el tejido tumoral y el tejido normal adyacente fue particularmente pronunciada en el colon derecho. Ciertas bacterias asociadas al cáncer, incluidas subespecies específicasFusobacterium nucleatumestaban constantemente enriquecidos con tumores independientemente de su ubicación.

Estas "firmas" microbianas se han validado en cohortes de pacientes independientes. Utilizando modelos de aprendizaje automático, los investigadores pudieron predecir con precisión si un tumor provenía del lado derecho o izquierdo del colon basándose únicamente en su microbioma. Los perfiles microbianos del lado derecho también se han relacionado con vías de señalización relacionadas con la hipoxia, lo que sugiere que las condiciones de bajo oxígeno en los tumores ayudan a la selección de bacterias específicas, lo que a su vez puede influir en el comportamiento del tumor.

Los microbios alteran la genética de los tumores

El estudio también encontró una fuerte conexión entre los microbios residentes en tumores y el panorama genético del cáncer colorrectal.

Los tumores con un elevado número de mutaciones genéticas, más comunes en el colon derecho, albergaban comunidades microbianas distintas enriquecidas con bacterias originadas en la boca. Estos incluían varias subespecies deFusobacterium nucleatumy microbios comotreponema.

Los tumores con menos mutaciones mostraron un patrón diferente. Estos cánceres son más comunesE. coliincluidas las cepas que portan las islas genómicas pks que dañan el ADN. Estas bacterias se asociaron con patrones de mutación específicos y fueron más comunes en los tumores del lado izquierdo.

Es importante destacar que los investigadores observaron que la alteración microbiana en sí misma es una característica definitoria del cáncer colorrectal. En todos los subtipos genéticos, los tumores se enriquecieron consistentemente en bacterias patógenas en comparación con el tejido normal adyacente. Esto sugiere que el desequilibrio microbiano no es simplemente un subproducto de cambios genéticos, sino un componente central de la tumorigénesis.

Las bacterias indican un comportamiento tumoral específico de subtipo

Cuando los tumores se estratificaron según subtipos moleculares establecidos, la importancia pronóstica de microbios específicos se volvió aún más clara.

Hay niveles elevados en los tumores CMS2, un subtipo más común en los cánceres del lado izquierdo y en pacientes más jóvenes.enterobacteriasespecialmente pks positivoE. colise asociaron fuertemente con una peor supervivencia. Estos tumores también mostraron signos de aumento de la hipoxia.

Por el contrario, en el subtipo CMS4, los niveles elevados de Fusobacterium se asociaron con peores resultados. Estos tumores mostraron una respuesta inmune antitumoral debilitada, incluida una actividad reducida de las células T CD8 positivas.

Estos resultados muestran que el efecto de una bacteria particular depende del subtipo molecular y del microambiente tumoral. Un mismo microorganismo puede señalar comportamientos biológicos muy diferentes según dónde y cómo opere.

Puntuación de riesgo microbiano con potencial clínico

El resultado del estudio que se puede implementar más rápidamente es la puntuación de riesgo microbiano.

Al combinar ambas bacterias de alto riesgo (por ejemplo, ciertasclostridioespecies) y tipos de protección (incluyendoFaecalibacterium prausnitzii), el Microbial Risk Score predijo de forma independiente la supervivencia del paciente. En varios análisis, mejoró la precisión del pronóstico más allá de factores estándar como la edad, el estadio del tumor y la genética del cáncer. Los perfiles microbianos protectores se asociaron con una reducción de la señalización inflamatoria, mientras que los perfiles de alto riesgo fueron consistentes con vías de señalización que se sabe que promueven la progresión del cáncer.

Esa fue una idea notable.Akkermansia muciniphilaa menudo considerada una bacteria beneficiosa, se asoció con peores tasas de supervivencia cuando estaba presente en grandes cantidades en el tejido adyacente a los tumores. Esto pone de relieve el papel dependiente del contexto de los microbios en el cáncer.

En conjunto, estos hallazgos están cambiando la visión del cáncer colorrectal de una enfermedad causada únicamente por células humanas a una que está esencialmente determinada por las interacciones entre la genética humana y los microbios residentes en el tumor. Al decodificar los "códigos postales" microbianos dentro de los tumores, el estudio añade un nuevo nivel de conocimiento biológico y abre la puerta a una evaluación de pronóstico más personalizada.

Si bien los tratamientos basados ​​en microbiomas aún no están a nuestro alcance, los microbios residentes en tumores están surgiendo como biomarcadores importantes y posibles objetivos futuros. A medida que los datos genómicos y microbianos continúan convergiendo, comprender el cáncer puede requerir cada vez más mirar más allá de los genes tumorales hacia los complejos ecosistemas microbianos que los rodean e interactúan con ellos.

Acerca de BGI Genomics

Con sede en Shenzhen, China, BGI Genomics es el proveedor líder mundial de soluciones integradas para medicina de precisión. Nuestros servicios cubren más de 100 países y regiones e incluyen más de 2300 instalaciones médicas. En julio de 2017, BGI Genomics (300676.SZ) cotizó oficialmente en la Bolsa de Valores de Shenzhen como filial de BGI Group.

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