Wuhan laboratorieprøver viser ingen nære slektninger til COVID-viruset

Wuhan laboratorieprøver viser ingen nære slektninger til COVID-viruset

Etter år med rykter om at viruset som forårsaker COVID-19 fra et laboratorium rømte i Kina, presenterte virologen i sentrum av diskusjonene data om dusinvis av nye koronavirus samlet inn fra flaggermus i det sørlige Kina. På en konferanse i Japan rapporterte Shi Zhengli, en flaggermuskoronavirusspesialist, at ingen av disse virusene som er lagret i fryseren deres er de siste forfedrene til SARS-CoV-2-viruset.

Shi ledet forskning på koronavirus ved Wuhan Institute of Virology (WIV), et høysikkerhetslaboratorium, da de første tilfellene av COVID-19 ble rapportert i den byen. Like etter teorier dukket opp at viruset rømte fra WIV - enten ved et uhell eller med vilje.

Shi har konsekvent understreket at SARS-CoV-2 aldri ble sett i laboratoriet hennes eller ble undersøkt. Likevel har noen kommentatorer fortsatt å stille spørsmål ved om et av de mange flaggermuskoronavirusene hennes team har samlet inn over flere tiår i Sør-Kina kan være nært beslektet. Shi lovet å sekvensere genomene til koronavirusene og publisere dataene.

Den siste analysen, som ennå ikke er fagfellevurdert, inkluderer data fra de komplette genomene til 56 nye betacoronavirus, den brede gruppen som inkluderer SARS-CoV-2, samt noen delsekvenser. Alle virus ble samlet inn mellom 2004 og 2021.

"Vi har ikke funnet noen nye sekvenser som er nærmere relatert til SARS-CoV-1 og SARS-CoV-2," sa Shi i en forhåndsinnspilt presentasjon på konferansen "Preparing for the Next Pandemic: Evolution, Pathogenesis and Virology of Coronaviruses" i Awaji, Japan, 4. desember. Tidligere i år flyttet Shi en ny nasjonal WIV-forskning i Guangzhou til Labor. instituttet.

Resultatene støtter deres påstand om at WIV-laboratoriet ikke hadde noen flaggermus-avledede sekvenser av virus som er nærmere relatert til SARS-CoV-2 enn de som allerede er beskrevet i vitenskapelige publikasjoner, sier Jonathan Pekar, en evolusjonsbiolog ved University of Edinburgh, Storbritannia. "Det bekrefter bare det hun sa: at hun ikke hadde noe som var ekstremt nært beslektet, som vi har sett i årene siden," legger han til.

De nærmeste kjente virusene til SARS-CoV-2 er funnet i flaggermus i Laos og Yunnan, Sør-Kina - men det har gått år, om ikke tiår, siden de delte sin nærmeste felles stamfar med viruset som forårsaker COVID-19. "Den fant i utgangspunktet mye av det vi forventer," sier Leo Poon, en virolog ved University of Hong Kong.

Langsiktig samarbeid

Shi har vært med oss ​​i flere tiår Peter Daszak, president for EcoHealth Alliance, en New York City-basert ideell organisasjon, for å undersøke flaggermus i det sørlige Kina for koronavirus og studere risikoen deres for mennesker. Arbeidet var finansiert av US National Institutes of Health og US Agency for International Development, men i mai i år statlig føderal finansiering for EcoHealth ble suspendert fordi tilstrekkelig tilsyn med forskningsaktiviteter i WIV ikke var sikret. Disse aktivitetene inkluderte å modifisere et koronavirus knyttet til alvorlig akutt respiratorisk syndrom (SARS) for å undersøke den potensielle opprinnelsen til denne typen virus hos flaggermus.

Gjennom årene har Shi og Daszak-samarbeidet samlet inn mer enn 15 000 vattpinner fra flaggermus i regionen. Teamet testet disse for koronavirus og re-sekvenserte genomene til de positive testresultatene. Samlingen utvider det kjente mangfoldet av koronavirus. "Hun fant sekvenser som i det minste bidrar til å utvide vår forståelse av koronavirus," sier Pekar.

I en mer omfattende analyse av 233 sekvenser - inkludert de nye sekvensene og noen tidligere publiserte - identifiserte Shi og hennes kolleger 7 brede linjer og bevis på virus som i stor grad byttet ut deler av RNA, en prosess kjent som rekombinasjon. Daszak sier at analysen også vurderer risikoen for at disse virusene hopper til mennesker og identifiserer potensielle medisinmål; "Informasjon av direkte verdi for folkehelsen".

Daszak rapporterer at på grunn av finansieringskutt, utfordringer med å jobbe på tvers av ulike regioner og flere amerikanske regjeringsundersøkelser utført av EcoHealth har opplevd forsinkelser med å sende inn papirer til vurdering. Forskerne planlegger imidlertid å sende inn analysen til et tidsskrift i løpet av de neste ukene.