Wuhan labbprover visar inga nära släktingar till covid-viruset

Wuhan labbprover visar inga nära släktingar till covid-viruset

Efter år av rykten om att viruset som orsakar covid-19 från ett laboratorium flydde i Kina presenterade virologen i centrum för överläggningarna data om dussintals nya coronavirus som samlats in från fladdermöss i södra Kina. På en konferens i Japan rapporterade Shi Zhengli, en fladdermus-coronavirusspecialist, att inget av dessa virus som lagras i deras frysar är de senaste förfäderna till SARS-CoV-2-viruset.

Shi ledde coronavirusforskningen vid Wuhan Institute of Virology (WIV), ett högsäkerhetslaboratorium, när de första fallen av covid-19 rapporterades i den staden. Strax efter teorier dök upp att viruset rymt från WIV - antingen av misstag eller avsiktligt.

Shi har konsekvent betonat att SARS-CoV-2 aldrig sågs i hennes laboratorium eller undersöktes. Ändå har vissa kommentatorer fortsatt att ifrågasätta om ett av de många fladdermus-coronavirus som hennes team har samlat in under decennier i södra Kina kan vara nära relaterat. Shi lovade att sekvensera genomerna av coronavirusen och publicera data.

Den senaste analysen, som ännu inte har granskats av experter, inkluderar data från de fullständiga genomen av 56 nya betacoronavirus, den breda gruppen som inkluderar SARS-CoV-2, såväl som några partiella sekvenser. Alla virus samlades in mellan 2004 och 2021.

"Vi har inte hittat några nya sekvenser som är närmare besläktade med SARS-CoV-1 och SARS-CoV-2," sa Shi i en förinspelad presentation vid konferensen "Preparing for the Next Pandemic: Evolution, Pathogenesis and Virology of Coronaviruses" i Awaji, Japan, den 4 december. Tidigare i år flyttade Shi en ny nationell forskning i Guangzhou från Labor till Guangzhou. institut.

Resultaten stödjer deras påstående att WIV-labbet inte hade några fladdermus-härledda sekvenser av virus som är närmare relaterade till SARS-CoV-2 än de som redan beskrivits i vetenskapliga publikationer, säger Jonathan Pekar, en evolutionsbiolog vid University of Edinburgh, Storbritannien. "Det bekräftar bara vad hon sa: att hon inte hade något som var extremt nära besläktat, som vi har sett under åren sedan", tillägger han.

De närmast kända virusen till SARS-CoV-2 har hittats i fladdermöss i Laos och Yunnan, södra Kina - men det har gått år, om inte decennier, sedan de delade sin närmaste gemensamma förfader med viruset som orsakar covid-19. "Den hittade i princip mycket av det vi förväntar oss", säger Leo Poon, virolog vid University of Hong Kong.

Långsiktigt samarbete

Shi har varit med oss ​​i decennier Peter Daszak, ordförande för EcoHealth Alliance, en New York City-baserad ideell organisation, för att undersöka fladdermöss i södra Kina för coronavirus och studera deras risker för människor. Arbetet var finansierat av US National Institutes of Health och US Agency for International Development, men i maj i år statlig federal finansiering för EcoHealth avbröts eftersom tillräcklig tillsyn över forskningsverksamheten i WIV inte säkerställdes. Dessa aktiviteter inkluderade modifiering av ett coronavirus kopplat till allvarligt akut respiratoriskt syndrom (SARS) för att undersöka det potentiella ursprunget till denna typ av virus hos fladdermöss.

Under åren har Shi och Daszak-samarbetet samlat in mer än 15 000 svabbar från fladdermöss i regionen. Teamet testade dessa för koronavirus och sekvenserade om genomen av de positiva testresultaten. Samlingen utökar den kända mångfalden av coronavirus. "Hon hittade sekvenser som åtminstone hjälper till att utöka vår förståelse av coronavirus", säger Pekar.

I en mer omfattande analys av 233 sekvenser - inklusive de nya sekvenserna och några tidigare publicerade - identifierade Shi och hennes kollegor 7 breda linjer och bevis på virus som i stor utsträckning bytte sektioner av RNA, en process som kallas rekombination. Daszak säger att analysen också bedömer risken för att dessa virus hoppar till människor och identifierar potentiella läkemedelsmål; "Information av direkt värde för folkhälsan".

Daszak rapporterar att på grund av finansieringsnedskärningar, utmaningar som arbetar över olika regioner och flera amerikanska myndigheters utredningar av EcoHealth har upplevt förseningar med att lämna in papper för granskning. Forskarna planerar dock att lämna in analysen till en tidskrift inom de närmaste veckorna.