Die Open-Source-Bibliothek Epicurrents bringt klinische neurophysiologische Aufzeichnungen in Webbrowser

Klinische neurophysiologische Untersuchungen umfassen Elektroenzephalographie, Schlaf- und Vigilanzstudien sowie Nervenleitungsaufzeichnungen. Die Interpretation dieser Aufzeichnungen wird größtenteils während der klinischen Arbeit erlernt, wobei dieselben Geräte und Software verwendet werden, die auch in der täglichen Praxis eingesetzt werden. Browserbasierte Anwendungen bieten eine einfache, sichere und kostengünstige Möglichkeit, unbeaufsichtigten Unterricht aus der Ferne durchzuführen. Dieselben Datensätze können sowohl für Bildungszwecke als auch für wissenschaftliche Forschung verwendet werden.

Sampsa Lohi, Doktorandin an der Universität Ostfinnland, hat mit Epicurrents eine Open-Source-JavaScript-Bibliothek entwickelt, die es Benutzern ermöglicht, verschiedene Arten klinischer neurophysiologischer Aufzeichnungen direkt in einem Webbrowser anzuzeigen. Die Anwendung wurde bereits in der Lehre eingesetzt, unter anderem auf Kongressen der European Academy of Neurology. Eine Beschreibung der Anwendung wurde jetzt in der Open-Access-Zeitschrift Clinical Neurophysiology Practice veröffentlicht.

Einfacher Zugriff über eine webbasierte Anwendung

Eine der Hauptstärken browserbasierter Anwendungen ist ihre hohe Zugänglichkeit. Die Epicurrents-Anwendung kann auf jedem Gerät verwendet werden, das einen Chromium-basierten Webbrowser ausführen kann. Es muss keine zusätzliche Software installiert werden, da die Anwendung direkt im Browser ausgeführt wird. Da die Anwendung das Öffnen von Dateien sowohl lokal als auch über das Netzwerk unterstützt, können pseudonymisierte Aufzeichnungsdatensätze über den Browser geteilt und in einem sekundären Verwendungskontext, beispielsweise in der wissenschaftlichen Forschung, angezeigt werden. Webbrowser ermöglichen zudem eine zuverlässige Benutzerauthentifizierung, wenn Zugriffsbeschränkungen erforderlich sind.

Fortschrittliche Tools für die wissenschaftliche Forschung

Als JavaScript-basierte Anwendung ist Epicurrents nicht besonders für umfangreiche numerische Berechnungen optimiert. Zur Unterstützung erweiterter Analysen ermöglicht die Anwendung die Ausführung von Python-Code und ONNX-basierten maschinellen Lernmodellen für die Signaldatenverarbeitung.

Diese zusätzlichen Features erhöhen den Speicherbedarf und eignen sich daher vor allem für Desktop-Computer oder leistungsstärkere Laptops.

Sampsa Lohi, Doktorandin, Universität Ostfinnland

Offenheit steigert das Vertrauen

Im Einklang mit den Open-Source-Prinzipien ist der Quellcode von Epicurrents nicht nur öffentlich einsehbar, sondern auch frei zur Nutzung, Änderung und Weiterverbreitung verfügbar. „Open Source erhöht typischerweise das Vertrauen in ein Projekt – nicht nur aufgrund der Transparenz, sondern auch, weil es die langfristige Nachhaltigkeit unterstützt. Es ermöglicht auch Beiträge von anderen Personen, die sich für das Thema interessieren“, fügt Lohi hinzu.

Quellen: