Kromosom-mikroarray-analyse kan hjælpe med at identificere årsagen til SIDS eller SUDC hos ældre børn

Kromosom-mikroarray-analyse kan hjælpe med at identificere årsagen til SIDS eller SUDC hos ældre børn

En genetisk test kendt som kromosomal mikroarray-analyse (CMA) kunne hjælpe med at identificere årsagen til pludselig spædbørnsdødssyndrom (SIDS) eller dets modstykke hos ældre børn, kendt som pludselig uforklarlig død i barndommen (SUDC), finder en undersøgelse ledet af Boston Children's Hospital.

Forskerne, ledet af Richard Goldstein, MD, Ingrid Holm, MD, MPH, og Catherine Brownstein, MPH, PhD, opfordrer til, at CMA gøres til rutine i evalueringen af ​​SIDS og SUDC. De offentliggjorde deres undersøgelsesresultater online den 7. november i tidsskriftet Advanced Genetics.

"Vi mener, at vi har nok information til at sige, at CMA er værd at overveje, når et barn er død uden forklaring, og det er værd at undersøge nærmere for bedre at forstå disse dødsfald," siger Goldstein, der leder Roberts Sudden Unexpected Death in Pediatrics Program på Boston Children's og var seniorforfatter af undersøgelsen.

Holdet brugte CMA til at teste prøver fra 116 afdøde spædbørn og småbørn op til 28 måneder gamle, hvis dødsfald blev klassificeret som SIDS eller SUDC. Hos 14 børn (12 procent) identificerede CMA deletioner eller duplikationer af segmenter af barnets DNA eller små DNA-omlejringer, der var patogene eller "gunstigt patogene."

CMA bruges allerede rutinemæssigt til børn med tilstande som autisme, udviklingsforsinkelse og flere medfødte anomalier, såvel som børn med udiagnosticerede medicinske tilstande."

Ingrid Holm, co-senior forfatter af undersøgelsen

For yderligere at validere deres resultater sammenlignede forskerne CMA-resultater i SIDS/SUDC-patienter med dem i kontrolgrupper af børn i lokalsamfundet og to kohorter af børn med autismespektrumforstyrrelse. Ved vurdering af sandsynligheden for potentielt påvirkelige kromosomale ændringer i CMA, scorede SIDS/SUDC-gruppen signifikant højere end kontrolgruppen, men havde samme score som børn med autismespektrumforstyrrelse (ASD).

Mange af CMA-resultaterne havde ingen tilsyneladende sammenhæng med SIDS/SUDC og kræver yderligere undersøgelse. For eksempel havde to børn udiagnosticeret Klinefelters syndrom, hvor drenge er født med et ekstra X-kromosom, men generelt har en normal levetid. Adskillige identificerede kromosomale deletioner/duplikationer er også blevet forbundet med neuroudviklingsmæssige forhold, herunder anfald, ASD, udviklingsforsinkelse og skizofreni.

Tilføjelse til test-arsenalet

Genetik og genomik e-bog

Samling af de bedste interviews, artikler og nyheder fra det sidste år. Download en gratis kopi

I tidligere arbejde brugte forskere ved Boston Children's heleksom-sekventering (sekventering af 1 til 2 procent af genomet, der koder for proteiner) til at evaluere børn, hvis dødsfald blev klassificeret som SIDS eller SUDC. I denne undersøgelse havde 11 procent af børn genetiske varianter (ændringer), der sandsynligvis spillede en rolle i deres død. Det er stadig uvist, i hvilket omfang CMA ville bidrage til disse resultater, og hvor meget overlap der er mellem generne, der er fundet at være ændret ved exome-sekventering, og generne påvirket af DNA-deletioner/duplikationer.

Holdet håber, at deres resultater vil tilskynde medicinske efterforskere, der efterforsker SIDS-dødsfald, til at bede dem om hjælp.

"Medicinske efterforskere er interesserede i genetisk testning, men de mangler ressourcerne, især når det kommer til at fortolke resultaterne," siger Goldstein. "Vi forsøger at flytte denne bold fremad og give nyttig information."

Ud over exome-sekventering og kromosomafvigelser i CMA modtog forskere for nylig en bevilling fra American SIDS Institute til at studere mere komplekse strukturelle ændringer i kromosomer, der kan bidrage til SIDS og SUDC, ved at bruge en avanceret genomisk platform kaldet Bionano Saphyr til at afbilde ekstremt lange DNA-strenge.

"Denne teknik giver os muligheden for at finde strukturelle variationer, der er for store til at blive opfanget af traditionel DNA-sekventering, men for små til at detektere med kromosomale mikroarrays," siger Brownstein, hovedforfatter af undersøgelsen og videnskabelig leder af Manton Center for Orphan Disease Research Gene Discovery Core ved Boston Children's. "Vi kan også opdage tilfælde, hvor et DNA-segment "flipper" til et andet sted på kromosomet.

På lang sigt, da omkostningerne ved DNA-sekventering falder, ønsker forskere at bruge hel-genom-sekventering til at studere SIDS og SUDC, en enkelt test, der kan reducere behovet for CMA.

Kilde:

Boston børnehospital

Reference:

Brownstein, CA, et al. (2022) Variation af kopital og strukturelle genomiske fund i 116 tilfælde af pludselig uforklarlig død mellem 1 og 28 måneder. Avanceret genetik. doi.org/10.1002/ggn2.202200012.

.