Η ανάλυση μικροσυστοιχίας χρωμοσωμάτων θα μπορούσε να βοηθήσει στον εντοπισμό της αιτίας του SIDS ή του SUDC σε μεγαλύτερα παιδιά

Η ανάλυση μικροσυστοιχίας χρωμοσωμάτων θα μπορούσε να βοηθήσει στον εντοπισμό της αιτίας του SIDS ή του SUDC σε μεγαλύτερα παιδιά

Μια γενετική εξέταση γνωστή ως ανάλυση χρωμοσωμικών μικροσυστοιχιών (CMA) θα μπορούσε να βοηθήσει στον εντοπισμό της αιτίας του συνδρόμου αιφνίδιου βρεφικού θανάτου (SIDS) ή του αντίστοιχου συνδρόμου σε μεγαλύτερα παιδιά, γνωστό ως ξαφνικός ανεξήγητος θάνατος στην παιδική ηλικία (SUDC), διαπιστώνει μια μελέτη από το Νοσοκομείο Παίδων της Βοστώνης.

Οι ερευνητές, με επικεφαλής τον Richard Goldstein, MD, την Ingrid Holm, MD, MPH, και την Catherine Brownstein, MPH, PhD, ζητούν να γίνει ρουτίνα η CMA στην αξιολόγηση του SIDS και του SUDC. Δημοσίευσαν τα αποτελέσματα της μελέτης τους διαδικτυακά στις 7 Νοεμβρίου στο περιοδικό Advanced Genetics.

«Πιστεύουμε ότι έχουμε αρκετές πληροφορίες για να πούμε ότι το CMA αξίζει να ληφθεί υπόψη όταν ένα παιδί έχει πεθάνει χωρίς εξήγηση και αξίζει να διερευνηθεί περαιτέρω για να κατανοηθούν καλύτερα αυτοί οι θάνατοι», λέει ο Goldstein, ο οποίος διευθύνει το πρόγραμμα Robert's Sudden Unnexpected Death in Pediatrics στο Boston Children's και ήταν επικεφαλής συγγραφέας της μελέτης.

Η ομάδα χρησιμοποίησε CMA για να δοκιμάσει δείγματα από 116 νεκρά βρέφη και νήπια ηλικίας έως 28 μηνών των οποίων οι θάνατοι ταξινομήθηκαν ως SIDS ή SUDC. Σε 14 παιδιά (12 τοις εκατό), η CMA εντόπισε διαγραφές ή διπλασιασμούς τμημάτων του DNA του παιδιού ή μικρές αναδιατάξεις DNA που ήταν παθογόνες ή «ευνοϊκά παθογόνες».

Το CMA χρησιμοποιείται ήδη συστηματικά για παιδιά με παθήσεις όπως αυτισμό, αναπτυξιακή καθυστέρηση και πολλαπλές συγγενείς ανωμαλίες, καθώς και για παιδιά με μη διαγνωσμένες ιατρικές παθήσεις».

Ingrid Holm, συν-ανώτερη συγγραφέας της μελέτης

Για να επικυρώσουν περαιτέρω τα ευρήματά τους, οι ερευνητές συνέκριναν τα αποτελέσματα CMA σε ασθενείς με SIDS/SUDC με εκείνους σε ομάδες ελέγχου παιδιών της κοινότητας και δύο ομάδες παιδιών με διαταραχή του φάσματος του αυτισμού. Κατά την αξιολόγηση της πιθανότητας δυνητικά επιδρώντων χρωμοσωμικών αλλαγών στο CMA, η ομάδα SIDS/SUDC σημείωσε σημαντικά υψηλότερη βαθμολογία από την ομάδα ελέγχου, αλλά είχε παρόμοια βαθμολογία με τα παιδιά με διαταραχή του φάσματος του αυτισμού (ASD).

Πολλά από τα ευρήματα της CMA δεν είχαν εμφανή συσχέτιση με το SIDS/SUDC και απαιτούν περαιτέρω διερεύνηση. Για παράδειγμα, δύο παιδιά είχαν αδιάγνωστο σύνδρομο Klinefelter, στο οποίο τα αγόρια γεννιούνται με ένα επιπλέον χρωμόσωμα Χ, αλλά γενικά έχουν φυσιολογική διάρκεια ζωής. Αρκετές ταυτοποιημένες χρωμοσωμικές διαγραφές/διπλασιασμοί έχουν επίσης συνδεθεί με νευροαναπτυξιακές καταστάσεις, συμπεριλαμβανομένων των επιληπτικών κρίσεων, της ΔΑΦ, της αναπτυξιακής καθυστέρησης και της σχιζοφρένειας.

Προσθήκη στο οπλοστάσιο των δοκιμών

Ηλεκτρονικό βιβλίο Γενετικής & Γονιδιωματικής

Συγκέντρωση των κορυφαίων συνεντεύξεων, άρθρων και ειδήσεων του περασμένου έτους. Κατεβάστε ένα δωρεάν αντίγραφο

Σε προηγούμενη εργασία, ερευνητές στο Boston Children's χρησιμοποίησαν αλληλουχία ολόκληρου του εξώματος (αλληλουχία του 1 έως 2 τοις εκατό του γονιδιώματος που κωδικοποιεί τις πρωτεΐνες) για να αξιολογήσουν παιδιά των οποίων οι θάνατοι ταξινομήθηκαν ως SIDS ή SUDC. Σε αυτή τη μελέτη, το 11 τοις εκατό των παιδιών είχαν γενετικές παραλλαγές (αλλαγές) που πιθανότατα έπαιξαν ρόλο στον θάνατό τους. Μένει να φανεί σε ποιο βαθμό το CMA θα συνεισέφερε σε αυτά τα αποτελέσματα και πόση επικάλυψη υπάρχει μεταξύ των γονιδίων που διαπιστώθηκε ότι αλλοιώθηκαν από την αλληλουχία του εξώματος και των γονιδίων που επηρεάζονται από διαγραφές/διπλασιασμούς DNA.

Η ομάδα ελπίζει ότι τα ευρήματά της θα ενθαρρύνουν τους ιατρικούς ερευνητές που ερευνούν τους θανάτους από SIDS να τους ζητήσουν βοήθεια.

«Οι ιατρικοί ερευνητές ενδιαφέρονται για τις γενετικές δοκιμές, αλλά τους λείπουν οι πόροι, ειδικά όταν πρόκειται για την ερμηνεία των αποτελεσμάτων», λέει ο Goldstein. «Προσπαθούμε να προχωρήσουμε αυτήν την μπάλα προς τα εμπρός και να παρέχουμε χρήσιμες πληροφορίες».

Εκτός από την αλληλουχία των εξωμάτων και τις χρωμοσωμικές ανωμαλίες στο CMA, οι ερευνητές έλαβαν πρόσφατα επιχορήγηση από το Αμερικανικό Ινστιτούτο SIDS για να μελετήσουν πιο σύνθετες δομικές αλλαγές στα χρωμοσώματα που μπορεί να συμβάλλουν στο SIDS και το SUDC, χρησιμοποιώντας μια προηγμένη πλατφόρμα γονιδιωματικής που ονομάζεται Bionano Saphyr για την απεικόνιση εξαιρετικά μακριών κλώνων DNA.

«Αυτή η τεχνική μας δίνει τη δυνατότητα να βρίσκουμε δομικές παραλλαγές που είναι πολύ μεγάλες για να συλληφθούν με την παραδοσιακή αλληλουχία DNA αλλά πολύ μικρές για να ανιχνευθούν με χρωμοσωμικές μικροσυστοιχίες», λέει ο Brownstein, επικεφαλής συγγραφέας της μελέτης και επιστημονικός διευθυντής του Manton Center for Orphan Disease Research Gene Discovery Core στο Boston Children’s. «Μπορούμε επίσης να ανιχνεύσουμε περιπτώσεις όπου ένα τμήμα DNA «αναστρέφεται» σε διαφορετική θέση στο χρωμόσωμα.

Μακροπρόθεσμα, καθώς το κόστος της αλληλουχίας DNA μειώνεται, οι ερευνητές θέλουν να χρησιμοποιήσουν την αλληλουχία ολόκληρου του γονιδιώματος για να μελετήσουν το SIDS και το SUDC, μια ενιαία δοκιμή που θα μπορούσε να μειώσει την ανάγκη για CMA.

Πηγή:

Νοσοκομείο Παίδων της Βοστώνης

Αναφορά:

Brownstein, CA, et al. (2022) Διακύμανση αριθμού αντιγράφων και δομικά γονιδιωματικά ευρήματα σε 116 περιπτώσεις αιφνίδιου ανεξήγητου θανάτου μεταξύ 1 και 28 μηνών. Προηγμένη γενετική. doi.org/10.1002/ggn2.202200012.

.