A kromoszóma microarray elemzés segíthet azonosítani a SIDS vagy SUDC okát idősebb gyermekeknél

A kromoszóma microarray elemzés segíthet azonosítani a SIDS vagy SUDC okát idősebb gyermekeknél

A kromoszómális mikroarray-analízis (CMA) néven ismert genetikai teszt segíthet azonosítani a hirtelen csecsemőhalál szindróma (SIDS) okát vagy annak megfelelőjét idősebb gyermekeknél, vagyis a hirtelen megmagyarázhatatlan gyermekkori halált (SUDC) – állapítja meg a Boston Children's Hospital által vezetett tanulmány.

A Richard Goldstein (MD), Ingrid Holm (MD, MPH) és Catherine Brownstein (MPH, PhD) által vezetett kutatók azt kérik, hogy a CMA-t rutinszerűvé kell tenni a SIDS és a SUDC értékelésében. Tanulmányi eredményeiket online publikálták november 7-én az Advanced Genetics folyóiratban.

"Úgy véljük, elegendő információnk van ahhoz, hogy kijelenthessük, a CMA-t érdemes figyelembe venni, ha egy gyermek magyarázat nélkül halt meg, és érdemes tovább vizsgálni, hogy jobban megértsük ezeket a haláleseteket" - mondja Goldstein, aki a Boston Children's Robert's Sudden Unexpected Death in Pediatrics Program irányítója és a tanulmány vezető szerzője volt.

A csapat CMA-t használt 116 elhunyt csecsemő és 28 hónaposnál fiatalabb kisgyermek mintáinak vizsgálatára, akiknek halálát SIDS-nek vagy SUDC-nek minősítették. A CMA 14 gyermeknél (12 százalék) azonosította a gyermek DNS-ének szegmenseinek delécióját vagy megkettőződését, vagy kis DNS-átrendeződéseket, amelyek patogén vagy „kedvezően patogén” volt.

A CMA-t már rutinszerűen alkalmazzák olyan betegségekben szenvedő gyermekeknél, mint az autizmus, a fejlődési késés és a többszörös veleszületett rendellenességek, valamint a nem diagnosztizált egészségügyi problémákkal küzdő gyermekek.

Ingrid Holm, a tanulmány társszerzője

Eredményeik további validálása érdekében a kutatók összehasonlították a SIDS/SUDC-betegek CMA-eredményeit a közösségi gyerekek kontrollcsoportjaiban és két autizmusspektrum-zavarban szenvedő gyermekek kohorszával. A CMA potenciálisan befolyásoló kromoszómális elváltozásainak valószínűségének értékelése során a SIDS/SUDC csoport szignifikánsan magasabb pontszámot ért el, mint a kontrollcsoport, de hasonló pontszámokat értek el, mint az autizmus spektrum zavarban (ASD) szenvedő gyermekek.

A CMA számos megállapítása nem mutatott nyilvánvaló összefüggést a SIDS/SUDC-vel, és további vizsgálatot igényel. Például két gyermeknek nem diagnosztizált Klinefelter-szindrómája volt, amelyben a fiúk extra X-kromoszómával születnek, de általában normális élettartamúak. Számos azonosított kromoszómális deléció/duplikáció is összefüggésbe hozható az idegrendszeri fejlődési állapotokkal, ideértve a rohamokat, az ASD-t, a fejlődési késleltetést és a skizofréniát.

Hozzáadás a tesztelési arzenálhoz

Genetika és genomika e-könyv

Összeállítás az elmúlt év legjobb interjúiból, cikkeiről és híreiről. Tölts le egy ingyenes példányt

Korábbi munkájuk során a Boston Children's kutatói teljes exóm szekvenálást (a fehérjéket kódoló genom 1-2 százalékának szekvenálását) alkalmazták azon gyermekek értékelésére, akiknek halálát SIDS vagy SUDC kategóriába sorolták. Ebben a tanulmányban a gyerekek 11 százalékának voltak olyan genetikai változatai (elváltozásai), amelyek valószínűleg szerepet játszottak a halálában. Továbbra is látni kell, hogy a CMA milyen mértékben járul hozzá ezekhez az eredményekhez, és mekkora átfedés van az exome szekvenálás által megváltozott gének és a DNS-deléciók/duplikációk által érintett gének között.

A csapat reméli, hogy eredményeik arra ösztönzik majd a SIDS-haláleseteket vizsgáló orvosi nyomozókat, hogy segítséget kérjenek tőlük.

"Az orvosi nyomozókat érdekli a genetikai tesztelés, de hiányoznak az erőforrások, különösen az eredmények értelmezésében" - mondja Goldstein. „Megpróbáljuk előrevinni ezt a labdát, és hasznos információkkal szolgálni.”

A CMA exome-szekvenálása és kromoszóma-rendellenességei mellett a kutatók nemrégiben támogatást kaptak az Amerikai SIDS Intézettől, hogy tanulmányozzák a kromoszómák bonyolultabb szerkezeti változásait, amelyek hozzájárulhatnak a SIDS-hez és a SUDC-hez, a Bionano Saphyr nevű fejlett genomikai platform segítségével rendkívül hosszú DNS-szálak leképezésére.

„Ez a technika lehetővé teszi számunkra, hogy olyan szerkezeti variációkat találjunk, amelyek túl nagyok ahhoz, hogy a hagyományos DNS-szekvenálással felvegyék őket, de túl kicsik ahhoz, hogy kromoszómális mikromátrixokkal detektáljuk őket” – mondja Brownstein, a tanulmány vezető szerzője és a Boston Children’s Manton Orphan Disease Research Gene Discovery Core tudományos igazgatója. „Azokat az eseteket is kimutathatjuk, amikor egy DNS-szakasz „átfordul” a kromoszómán egy másik helyre.

Hosszú távon, mivel a DNS-szekvenálás költségei csökkennek, a kutatók a teljes genom szekvenálását szeretnék használni a SIDS és a SUDC tanulmányozására, amely egyetlen teszt csökkentheti a CMA szükségességét.

Forrás:

Bostoni Gyermekkórház

Referencia:

Brownstein, CA, et al. (2022) Példányszám-változás és strukturális genomikai leletek 116 hirtelen megmagyarázhatatlan halálesetben 1 és 28 hónap között. Fejlett genetika. doi.org/10.1002/ggn2.202200012.

.