Analiza micromatricelor cromozomilor ar putea ajuta la identificarea cauzei SIDS sau SUDC la copiii mai mari

Analiza micromatricelor cromozomilor ar putea ajuta la identificarea cauzei SIDS sau SUDC la copiii mai mari

Un test genetic cunoscut sub numele de analiză cu microarray cromozomiale (CMA) ar putea ajuta la identificarea cauzei sindromului morții subite a sugarului (SIDS) sau omologul său la copiii mai mari, cunoscut sub numele de moarte subită inexplicabilă în copilărie (SUDC), arată un studiu condus de Spitalul de Copii din Boston.

Cercetătorii, conduși de Richard Goldstein, MD, Ingrid Holm, MD, MPH, și Catherine Brownstein, MPH, PhD, solicită ca CMA să fie făcută de rutină în evaluarea SIDS și SUDC. Ei au publicat rezultatele studiului lor online pe 7 noiembrie, în revista Advanced Genetics.

„Credem că avem suficiente informații pentru a spune că CMA merită luată în considerare atunci când un copil a murit fără explicații și merită investigat în continuare pentru a înțelege mai bine aceste decese”, spune Goldstein, care conduce programul Robert Sudden Unexpected Death in Pediatrics la Boston Children’s și a fost autor principal al studiului.

Echipa a folosit CMA pentru a testa mostre de la 116 sugari și copii mici de până la 28 de luni ale căror decese au fost clasificate ca SIDS sau SUDC. La 14 copii (12 la sută), CMA a identificat ștergeri sau dublări ale segmentelor ADN-ului copilului sau mici rearanjamente ale ADN-ului care au fost patogene sau „favorabil patogene”.

CMA este deja utilizat în mod obișnuit pentru copiii cu afecțiuni precum autismul, întârzierea dezvoltării și anomalii congenitale multiple, precum și pentru copiii cu afecțiuni medicale nediagnosticate.

Ingrid Holm, co-autor principal al studiului

Pentru a valida în continuare concluziile lor, cercetătorii au comparat rezultatele CMA la pacienții cu SIDS/SUDC cu cei din grupurile de control de copii din comunitate și două cohorte de copii cu tulburări din spectrul autist. La evaluarea probabilității unor modificări cromozomiale cu potențial impact în CMA, grupul SIDS/SUDC a obținut scoruri semnificativ mai mari decât grupul de control, dar a avut scoruri similare cu copiii cu tulburare din spectrul autist (ASD).

Multe dintre constatările CMA nu au avut nicio asociere aparentă cu SIDS/SUDC și necesită investigații suplimentare. De exemplu, doi copii au avut sindromul Klinefelter nediagnosticat, în care băieții se nasc cu un cromozom X în plus, dar au, în general, o durată de viață normală. Mai multe deleții/duplicări cromozomiale identificate au fost, de asemenea, legate de condițiile de neurodezvoltare, inclusiv convulsii, ASD, întârzierea dezvoltării și schizofrenia.

Adăugând la arsenalul de testare

Carte electronică Genetică și Genomică

Compilare a celor mai bune interviuri, articole și știri din ultimul an. Descărcați o copie gratuită

În lucrările anterioare, cercetătorii de la Boston Childrens au folosit secvențierea întregului exom (secvențierea a 1 până la 2% din genomul care codifică proteine) pentru a evalua copiii ale căror decese au fost clasificate ca SIDS sau SUDC. În acest studiu, 11% dintre copii au avut variante genetice (modificări) care probabil au jucat un rol în moartea lor. Rămâne de văzut în ce măsură CMA ar contribui la aceste rezultate și cât de multă suprapunere există între genele găsite a fi modificate prin secvențierea exomului și genele afectate de ștergeri/duplicări ADN.

Echipa speră că descoperirile lor vor încuraja anchetatorii medicali care investighează decesele SIDS să le ceară ajutor.

„Investigatorii medicali sunt interesați de testarea genetică, dar le lipsesc resursele, mai ales când vine vorba de interpretarea rezultatelor”, spune Goldstein. „Încercăm să avansăm această minge și să oferim informații utile.”

Pe lângă secvențierea exomului și anomaliile cromozomiale din CMA, cercetătorii au primit recent o subvenție de la Institutul american SIDS pentru a studia modificări structurale mai complexe ale cromozomilor care pot contribui la SIDS și SUDC, folosind o platformă avansată de genomică numită Bionano Saphyr pentru a realiza imagini cu fire de ADN extrem de lungi.

„Această tehnică ne oferă capacitatea de a găsi variații structurale care sunt prea mari pentru a fi detectate de secvențierea ADN-ului tradițional, dar prea mici pentru a fi detectate cu micromatrice cromozomiale”, spune Brownstein, autorul principal al studiului și directorul științific al Centrului Manton pentru Cercetarea Bolilor Orfane Gene Discovery Core la Boston Children’s. „Putem detecta, de asemenea, cazuri în care un segment de ADN „se întoarce” într-o locație diferită a cromozomului.

Pe termen lung, pe măsură ce costul secvențierii ADN-ului scade, cercetătorii doresc să folosească secvențierea întregului genom pentru a studia SIDS și SUDC, un singur test care ar putea reduce nevoia de CMA.

Sursă:

Spitalul de Copii din Boston

Referinţă:

Brownstein, CA, şi colab. (2022) Variația numărului de copii și descoperirile genomice structurale în 116 cazuri de moarte subită inexplicabilă între 1 și 28 de luni. Genetica avansata. doi.org/10.1002/ggn2.202200012.

.