染色体微阵列分析有助于确定年龄较大儿童 SIDS 或 SUDC 的病因

染色体微阵列分析有助于确定年龄较大儿童 SIDS 或 SUDC 的病因

波士顿儿童医院领导的一项研究发现，一种称为染色体微阵列分析 (CMA) 的基因测试可以帮助确定婴儿猝死综合症 (SIDS) 或年龄较大儿童的类似疾病（称为儿童不明原因猝死 (SUDC)）的原因。

由医学博士理查德·戈尔茨坦 (Richard Goldstein)、医学博士、公共卫生硕士英格丽德·霍尔姆 (Ingrid Holm) 和公共卫生硕士凯瑟琳·布朗斯坦 (Catherine Brownstein) 领导的研究人员呼吁将 CMA 纳入 SIDS 和 SUDC 的评估中。 他们于 11 月 7 日在《Advanced Genetics》杂志上在线发表了研究结果。

“我们相信，我们有足够的信息表明，当一名儿童在没有任何解释的情况下死亡时，CMA 值得考虑，并且值得进一步调查，以更好地了解这些死亡情况，”戈德斯坦说。他是波士顿儿童医院罗伯特意外猝死儿科项目的负责人，也是该研究的资深作者。

该团队使用 CMA 检测了 116 名已故婴儿和 28 个月以下幼儿的样本，这些婴儿和幼儿的死亡被归类为 SIDS 或 SUDC。 在 14 名儿童（12%）中，CMA 发现了儿童 DNA 片段的缺失或重复，或者是致病性或“有利致病性”的小 DNA 重排。

CMA 已常规用于患有自闭症、发育迟缓和多种先天性异常等疾病的儿童，以及患有未确诊疾病的儿童。”

英格丽德·霍尔姆（Ingrid Holm），该研究的共同高级作者

为了进一步验证他们的发现，研究人员将 SIDS/SUDC 患者的 CMA 结果与社区儿童对照组和两组自闭症谱系障碍儿童的 CMA 结果进行了比较。 在评估 CMA 染色体变化的可能性时，SIDS/SUDC 组的得分显着高于对照组，但与自闭症谱系障碍 (ASD) 儿童的得分相似。

许多 CMA 调查结果与 SIDS/SUDC 没有明显关联，需要进一步调查。 例如，两个孩子患有未确诊的克兰费尔特综合征，该综合征中的男孩生来就有一条额外的 X 染色体，但通常寿命正常。 一些已确定的染色体缺失/重复也与神经发育状况有关，包括癫痫、自闭症谱系障碍、发育迟缓和精神分裂症。

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在之前的工作中，波士顿儿童医院的研究人员使用全外显子组测序（对编码蛋白质的基因组的 1% 到 2% 进行测序）来评估死亡被归类为 SIDS 或 SUDC 的儿童。 在这项研究中，11% 的儿童存在可能导致其死亡的基因变异（变化）。 CMA 在多大程度上对这些结果有贡献，以及通过外显子组测序发现改变的基因与受 DNA 删除/重复影响的基因之间有多少重叠，还有待观察。

研究小组希望他们的发现能够鼓励调查婴儿猝死综合症死亡的医学调查人员向他们寻求帮助。

“医学研究人员对基因检测很感兴趣，但他们缺乏资源，尤其是在解释结果方面，”戈德斯坦说。 “我们正在努力推动这一进程并提供有用的信息。”

除了 CMA 中的外显子组测序和染色体异常之外，研究人员最近还获得了美国 SIDS 研究所的资助，用于研究可能导致 SIDS 和 SUDC 的更复杂的染色体结构变化，使用先进的基因组学平台 Bionano Saphyr 对极长的 DNA 链进行成像。

该研究的主要作者、波士顿儿童医院曼顿孤儿疾病研究基因发现核心中心的科学主任 Brownstein 说：“这项技术使我们能够发现太大而无法通过传统 DNA 测序检测到但又太小而无法通过染色体微阵列检测到的结构变异。” “我们还可以检测 DNA 片段“翻转”到染色体上不同位置的情况。

从长远来看，随着 DNA 测序成本的下降，研究人员希望使用全基因组测序来研究 SIDS 和 SUDC，这种单一测试可以减少 CMA 的需求。

来源：

波士顿儿童医院

参考：

加利福尼亚州布朗斯坦等人。 (2022) 116 例 1 至 28 个月内不明原因突然死亡病例的拷贝数变异和结构基因组发现。 先进的遗传学。 doi.org/10.1002/ggn2.202200012 。

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