Les chercheurs identifient une nouvelle variante du RSV associée à une infection prolongée

Les chercheurs identifient une nouvelle variante du RSV associée à une infection prolongée

Un nouveau Le Journal des maladies infectieuses L'étude examine les facteurs de risque génétiques des agents pathogènes ou des hôtes pour l'infection par le RSV et si certaines variantes virales sont associées à une infection prolongée.

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Apprendre: Déterminants génétiques viraux de l’infection prolongée par le virus respiratoire syncytial chez les nourrissons d’une cohorte de naissance en bonne santé.Crédit photo : ART_ur / Shutterstock.com

La transmission du VRS

L'orthopneumovirus humain, plus communément appelé virus respiratoire syncytial (VRS), peut provoquer une mortalité et une morbidité importantes dans le monde entier.

Tous les enfants âgés de deux à trois ans sont infectés par le RSV au moins une fois. Le RSV infecte principalement l’épithélium des voies respiratoires inférieures et supérieures ; cependant, on en a également trouvé dans des sources non respiratoires. Bien que le VRS provoque généralement une infection respiratoire aiguë, il peut également provoquer une maladie persistante ou à long terme chez certaines personnes.

Il a été observé qu’une excrétion prolongée du RSV chez les nourrissons après la première infection augmente la durée moyenne de l’excrétion virale. Cependant, on ne sait pas si certains facteurs viraux entraînent une infection prolongée chez les nourrissons.

Il est important de comprendre les caractéristiques d’une infection persistante, car elle peut augmenter les taux de transmission et provoquer des modifications du développement de l’épithélium des voies respiratoires des jeunes patients. Le réservoir du VRS n’est pas non plus compris, certaines souches du VRS continuant à circuler dans la communauté à de faibles niveaux, tandis que d’autres pourraient rester saisonnières.

À propos des études

L’étude actuelle incluait des nourrissons nés à terme et en bonne santé qui présentaient une infection prolongée par le VRS. Une étude d'association à l'échelle du génome viral (GWAS) a été menée à l'aide du séquençage du génome entier du RSV pour comprendre la relation entre l'infection prolongée par le RSV chez les nourrissons et les génotypes viraux.

Une GWAS humaine a été réalisée pour analyser l'effet du risque d'infection par le VRS au cours de la première année sur le génotype. De plus, la réponse immunologique locale au RSV a été évaluée, ainsi que l'analyse de toutes les données de séquence virale.

Enfin, un résumé de toutes les données fonctionnelles pour la variante identifiée a été créé.

Résultats de l'étude

Au total, 19 nourrissons répondaient aux critères d'infection étendus, définis comme une infection respiratoire aiguë avec au moins deux échantillons nasaux positifs par réaction en chaîne par polymérase (PCR) du RSV avec plus de 15 jours entre les deux dates de test.

La valeur moyenne RSV-Ct de la première infection était de 25,9, celle de la seconde de 31,6. Le nombre médian de jours entre les deux infections était de 29 jours.

L'infection par le RSV a eu peu ou pas d'effet sur les génotypes des nourrissons. De plus, une infection prolongée était causée par des virus provenant de différents clades phylogénétiques par rapport à un seul clade spécifique. Des séquences similaires du VRS ont été observées lors de la détection virale initiale et ultérieure, ce qui suggère qu'il s'agissait d'infections prolongées.

Une association génétique entre une infection prolongée et la variante principale a été observée, aucune autre variante n’étant en corrélation avec la variante principale. Les génotypes variants p.E123K/D et p.P218T/S/L étaient principalement associés à une infection prolongée ; Cependant, les informations sur les effets des deux variantes sur la structure régionale ou locale de la protéine G du RSV étaient insuffisantes. De plus, l’effet sur la glycosylation était indéterminé.

Conclusions

L'étude actuelle a identifié des variantes du RSV qui ont entraîné une infection prolongée chez des nourrissons par ailleurs en bonne santé ; cependant, aucune information n'a été obtenue concernant la susceptibilité génétique de l'hôte à l'infection par le RSV.

Comprendre les mécanismes du virus et de l'hôte qui conduisent à une infection prolongée peut aider à déterminer des stratégies permettant de contrôler à la fois les effets à court et à long terme de l'infection par le VRS. En outre, l’identification des variantes du RSV qui provoquent une infection prolongée peut également contribuer à améliorer la conception des vaccins.

Des recherches supplémentaires sont nécessaires pour déterminer le réservoir du RSV et sa capacité d'infection prolongée chez les hôtes immunocompétents.

restrictions

L’étude actuelle n’a pas été conçue pour examiner la durée de l’infection et a nécessité un échantillonnage supplémentaire. En plus d'une petite taille de cohorte, les chercheurs ont uniquement pu analyser le risque génétique d'infection de l'hôte et non l'infection prolongée. Enfin, les effets modulateurs des niveaux d’anticorps maternels sur les nourrissons n’ont pas été mesurés.

Référence:

• Lawless, D., McKennan, CG, Das, SR, et al. (2022). Virale genetische Determinanten einer verlängerten Respiratory-Syncytial-Virus-Infektion bei Säuglingen in einer gesunden Geburtskohorte. Das Journal der Infektionskrankheiten. doi:10.1093/infdis/jiac442.

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