Naukowcy identyfikują nowy wariant wirusa RSV powiązany z przedłużającą się infekcją

Naukowcy identyfikują nowy wariant wirusa RSV powiązany z przedłużającą się infekcją

Nowy Dziennik chorób zakaźnych W badaniu zbadano genetyczne czynniki ryzyka zakażenia RSV u patogenów lub żywicieli oraz to, czy określone warianty wirusa są powiązane z długotrwałym zakażeniem.

Książka elektroniczna Immunologia

Zestawienie najważniejszych wywiadów, artykułów i aktualności z ostatniego roku. Pobierz bezpłatną kopię

Uczyć się: Wirusowe determinanty genetyczne przedłużonej infekcji wirusem syncytialnym układu oddechowego u niemowląt w zdrowej kohorcie urodzeniowej.Źródło zdjęcia: ART_ur / Shutterstock.com

Transmisja RSV

Ludzki ortopneumowirus, bardziej znany jako syncytialny wirus oddechowy (RSV), może powodować znaczną śmiertelność i zachorowalność na całym świecie.

Wszystkie dzieci w wieku od dwóch do trzech lat przynajmniej raz zostają zakażone wirusem RSV. RSV infekuje przede wszystkim nabłonek dolnych i górnych dróg oddechowych; jednakże stwierdzono go również w źródłach innych niż oddechowe. Chociaż wirus RSV zwykle powoduje ostrą infekcję dróg oddechowych, u niektórych osób może również powodować trwałą lub długotrwałą chorobę.

Zaobserwowano, że przedłużone wydalanie wirusa RSV u niemowląt po pierwszym zakażeniu wydłuża średni czas wydalania wirusa. Nie wiadomo jednak, czy określone czynniki wirusowe prowadzą do długotrwałej infekcji u niemowląt.

Ważne jest, aby zrozumieć charakterystykę trwałej infekcji, ponieważ może ona zwiększyć szybkość przenoszenia i spowodować zmiany rozwojowe w nabłonku dróg oddechowych u młodych pacjentów. Nie jest znany również rezerwuar wirusa RSV, przy czym uważa się, że niektóre szczepy RSV krążą w społeczeństwie w niewielkich ilościach, podczas gdy inne mogą występować sezonowo.

O studiowaniu

Do obecnego badania włączono zdrowe donoszone niemowlęta z długotrwałym zakażeniem wirusem RSV. Przeprowadzono badanie asocjacyjne całego genomu wirusa (GWAS) przy użyciu sekwencjonowania całego genomu wirusa RSV, aby zrozumieć związek między długotrwałym zakażeniem wirusem RSV u niemowląt a genotypami wirusa.

Przeprowadzono ludzki GWAS w celu analizy wpływu ryzyka zakażenia RSV w pierwszym roku na genotyp. Dodatkowo oceniano lokalną odpowiedź immunologiczną na RSV wraz z analizą wszystkich danych dotyczących sekwencji wirusa.

Na koniec stworzono podsumowanie wszystkich danych funkcjonalnych dla zidentyfikowanego wariantu.

Wyniki badań

W sumie 19 niemowląt spełniło rozszerzone kryteria zakażenia, zdefiniowane jako ostra infekcja dróg oddechowych z dwiema lub większą liczbą próbek z nosa wykazujących reakcję łańcuchową polimerazy RSV (PCR) w okresie dłuższym niż 15 dni między dwiema datami badania.

Średnia wartość RSV-Ct pierwszego zakażenia wyniosła 25,9, drugiego 31,6. Mediana liczby dni pomiędzy dwiema infekcjami wyniosła 29 dni.

Zakażenie wirusem RSV miało niewielki lub żaden wpływ na genotypy niemowląt. Co więcej, długotrwała infekcja była spowodowana przez wirusy z różnych kladów filogenetycznych w porównaniu z jednym konkretnym kladem. Podobne sekwencje RSV zaobserwowano podczas początkowej i późniejszej detekcji wirusa, co sugeruje, że były to długotrwałe infekcje.

Zaobserwowano powiązanie genetyczne między długotrwałą infekcją a wariantem wiodącym, nie stwierdzono jednak, aby inne warianty korelowały z wariantem wiodącym. Genotypy wariantów p.E123K/D i p.P218T/S/L były głównie związane z przedłużoną infekcją; Jednakże informacje na temat wpływu tych dwóch wariantów na regionalną lub lokalną strukturę białka G RSV były niewystarczające. Ponadto wpływ na glikozylację był nieokreślony.

Wnioski

W bieżącym badaniu zidentyfikowano warianty wirusa RSV, które powodowały przedłużoną infekcję u zdrowych niemowląt; jednakże nie uzyskano żadnych informacji dotyczących genetycznej podatności żywiciela na zakażenie RSV.

Zrozumienie mechanizmów wirusa i żywiciela prowadzących do długotrwałej infekcji może pomóc w określeniu strategii pozwalających kontrolować zarówno krótko-, jak i długoterminowe skutki zakażenia RSV. Ponadto identyfikacja wariantów wirusa RSV powodujących przedłużoną infekcję może również pomóc w udoskonaleniu projektu szczepionki.

Konieczne są dalsze badania w celu określenia rezerwuaru wirusa RSV i jego zdolności do długotrwałej infekcji u gospodarzy z prawidłową odpornością.

ograniczenia

Obecne badanie nie miało na celu zbadania czasu trwania infekcji i wymagało dodatkowego pobierania próbek. Oprócz małej liczebności kohorty badacze byli w stanie przeanalizować jedynie ryzyko genetyczne zakażenia gospodarza, a nie długotrwałą infekcję. Wreszcie, nie mierzono modulującego wpływu poziomu przeciwciał matczynych na niemowlęta.

Odniesienie:

• Lawless, D., McKennan, CG, Das, SR, et al. (2022). Virale genetische Determinanten einer verlängerten Respiratory-Syncytial-Virus-Infektion bei Säuglingen in einer gesunden Geburtskohorte. Das Journal der Infektionskrankheiten. doi:10.1093/infdis/jiac442.

.