Tutkimus tutkii Klebsiella-superbakteerin leviämistä ihmisten ja ympäristön välillä

Tutkimus tutkii Klebsiella-superbakteerin leviämistä ihmisten ja ympäristön välillä

Kansainvälinen tutkijaryhmä, joka tutkii MRSA:n kanssa kilpailevan tappavan lääkeresistentin bakteerin leviämistä, on havainnut, että vaikka vikoja löytyy karjasta, lemmikkieläimistä ja laajemmasta ympäristöstä, ne tarttuvat harvoin ihmisiin tällä tavalla.

Bathin yliopiston Milner Center for Evolution -keskuksen professori Ed Feilin johtamat tutkijat tutkivat Klebsiella-bakteeriperheen leviämistä, joka elää harmittomasti suolistossa, mutta voi olla vaarallinen leviäessään muihin kehon osiin.

Klebsiella pneumoniae on tämän perheen tunnetuin laji, joka voi aiheuttaa keuhkokuumetta, aivokalvontulehdusta, virtsatietulehduksia ja verenkiertoinfektioita.

Nämä bakteerit ovat nyt erittäin vastustuskykyisiä antibiooteille, ja jotkut kannat ovat jopa resistenttejä karbapeneemeille, niin sanotuille "viimeisen keinon" antibiooteille, joita käytetään vain, kun mikään muu antibioottihoito ei tehoa.

Klebsiella on ohittanut MRSA:n terveysongelmana Yhdistyneessä kuningaskunnassa, ja määrät nousevat tasaisesti. WHO on tunnustanut bakteerin erittäin tärkeäksi taudinaiheuttajaksi.

Sairaaloista löytymisen lisäksi mikrobia on löydetty myös ympäristöstä, mukaan lukien karjasta ja jätevedestä, mutta toistaiseksi ei ollut selvää, siirtyivätkö bakteerit kliinisen ja ei-kliinisen ympäristön välillä.

Suurimmassa koskaan tehdyssä tutkimuksessa ryhmä keräsi 6 548 näytettä 15 kuukauden aikana eri paikoista Italian Pavian kaupungista ja sen ympäristöstä, jossa tämä patogeeni on suuri ongelma sairaaloissa, ja analysoi ne käyttämällä koko genomin sekvensointitekniikoita havaitakseen ja tunnistaakseen mahdolliset Klebsiella-bakteerit.

Tiimi pyyhkäisi potilaita sairaaloissa ja terveitä "kantajia" yhteisössä, otti näytteitä maatiloilta, lätäköistä, lemmikkeistä ja jopa huonekärpäsistä ja muista hyönteisistä selvittääkseen, missä bakteerit olivat läsnä.

He löysivät 3 482 isolaattia, mukaan lukien 15 erilaista Klebsiella-lajia, joista puolet positiivisista näytteistä sisälsi K. pneumoniaea.

Kun ryhmä sekvensoi bakteerit geneettisesti saadakseen selville, mitä kantoja niissä oli, he havaitsivat, että sairaaloista löydettyjen ja ympäristössä olevien vikojen välillä oli hyvin vähän päällekkäisyyttä.

Tutkimusta johtanut professori Ed Feil sanoi: "Klebsiella-infektiot ovat yhä vastustuskykyisempiä antibiooteille. Vaikka aiemmin useimmat virtsatietulehdukset voitiin hoitaa helposti, nyt on yleisempää, että potilaat saavat infektioita, jotka uusiutuvat ja aiheuttavat ongelmia.

Genetiikka ja genomiikka e-kirja

Kokoelma viime vuoden huippuhaastatteluista, artikkeleista ja uutisista. Lataa ilmainen kopio

"Klebsiella voi myös aiheuttaa keuhkokuumetta, joka tappaa noin puolet potilaista. Tämä bakteeri on Isossa-Britanniassa suurempi ongelma kuin MRSA.

”Tutkijamme halusivat selvittää, leviävätkö vastustuskykyiset bakteerit nyt lemmikeissä, maatiloilla, karjassa, kasveissa ja vedessä, ja siksi halusimme tutkia Klebsiellan esiintymispaikkoja ja seurata sen leviämistä saadaksemme tietoa siitä, miten tautipesäkkeitä voidaan parhaiten ehkäistä ja hallita.

"Huomasimme, että sitä esiintyi kaikkialla, mutta olimme yllättyneitä siitä, että sairaalasta löydetyt kannat poikkesivat ympäristöstä, mikä viittaa siihen, että näiden kahden elinympäristön välillä on hyvin vähän tartuntaa: ihmiset saavat tämän melkein aina muilta ihmisiltä.

"Tämä vahvistaa, että paras tapa hallita näiden bakteerien infektioita on edelleen tiukka sairaalahygienia ja että eläinten tai ympäristön aiheuttamien taudinpurkausten todennäköisyys on pienempi kuin aiemmin pelättiin, ainakin Italian kaltaisessa luonnonvararikkaassa maassa."

Pelättiin, että viljelijät voisivat saada nämä bakteerit karjasta tai maaperästä, että saattaisimme saastua saastuneesta salaatista tai sairastua uimisesta saastuneissa järvissä.

Tutkimuksemme ei löytänyt todisteita tästä, mutta löysimme resistenttejä Klebsiellaa lemmikeistä, kuten kissoista ja koirista. Eläinlääkäreiden ja omistajien tulee olla tietoisia tästä, koska nämä eläimet voivat aiheuttaa riskin bakteerien leviämiselle."

Tohtori Harry Thorpe,teoksen ensimmäinen kirjoittaja,Oslon yliopisto (Norja)

SpARK-nimistä projektikonsortiota johti Bath, mutta mukana oli tutkijoita Isosta-Britanniasta (Wellcome Sanger Institute, Bristolin ja Glasgow'n yliopistot), Norjasta, Ranskasta, Suomesta ja Italiasta. Työ on rahoitettu Joint Programming Initiative on Antimikrobial Resistance (JPI-AMR) ja MRC:ltä, ja se julkaistiin Nature Microbiology -lehdessä.

Professori Feil sanoi: "Tämä on suurin ja järjestelmällisin tutkimus, joka on tehty samanaikaisesti yhdellä maantieteellisellä paikalla.

”Olemme tutkineet kantojen leviämistä, mutta antibioottiresistenssi voi tarttua erittäin helposti muihin kantoihin, kun ne vaihtavat ja ottavat pyöreitä DNA-palasia, joita kutsutaan plasmideiksi.

"Seuraavaksi haluamme seurata, kuinka plasmideja siirretään kantojen välillä käyttämällä tekniikkaa, jota kutsutaan pitkän lukusekvenssin suorittamiseksi."

Tätä tarkoitusta varten tiimi sai äskettäin verkkorahoitusta JPIAMR:lta, joka perustuu GW4-tutkimusyhteisöön ja jota GW4 AMR Alliance tuki.

Lähde:

Bathin yliopisto

Viite:

Thorpe, H.A., et ai. (2022) Laajan mittakaavan genominen tilannekuva Klebsiella spp. Pohjois-Italian isolaatit osoittavat rajallista siirtymistä kliinisen ja ei-kliinisen ympäristön välillä. Luonnollinen mikrobiologia. doi.org/10.1038/s41564-022-01263-0.

.