Tyrimas tiria Klebsiella superbug plitimą tarp žmonių ir aplinkos

Tyrimas tiria Klebsiella superbug plitimą tarp žmonių ir aplinkos

Tarptautinė mokslininkų grupė, tirianti mirtinos vaistams atsparios bakterijos, konkuruojančios su MRSA, perdavimą, nustatė, kad, nors bakterijos randamos gyvuliuose, naminiuose gyvūnėliuose ir platesnėje aplinkoje, žmonėms jos tokiu būdu perduodamos retai.

Tyrėjai, vadovaujami profesoriaus Edo Feilo iš Milnerio evoliucijos centro Bato universitete, ištyrė Klebsiella – bakterijų šeimos, kuri nekenksmingai gyvena žarnyne, bet gali būti pavojinga, jei ji išplis į kitas kūno dalis, plitimą.

Klebsiella pneumoniae yra geriausiai žinoma šios šeimos rūšis, galinti sukelti pneumoniją, meningitą, šlapimo takų infekcijas ir kraujotakos infekcijas.

Šios bakterijos dabar yra labai atsparios antibiotikams, o kai kurios padermės net atsparios karbapenemams, vadinamųjų „paskutinės išeities“ antibiotikų klasei, kurie naudojami tik tada, kai joks kitas gydymas antibiotikais neveikia.

Klebsiella aplenkė MRSA kaip sveikatos problemą JK, o rodikliai nuolat auga. PSO pripažino, kad ši bakterija yra itin svarbios sveikatos priežiūros patogenas.

Mikrobas buvo aptiktas ne tik ligoninėse, bet ir aplinkoje, įskaitant gyvulius ir nuotekas, tačiau iki šiol nebuvo aišku, ar bakterijos buvo perduotos iš klinikinės ir neklinikinės aplinkos.

Didžiausio kada nors atlikto tyrimo metu komanda per 15 mėnesių surinko 6548 mėginius iš įvairių vietų Italijos Pavijos mieste ir aplink jį, kur šis patogenas yra pagrindinė ligoninių problema, ir išanalizavo juos naudodama viso genomo sekos nustatymo metodus, kad aptiktų ir identifikuotų bet kokias Klebsiella bakterijas.

Grupė ėmė tepinėlius ligoninėse ir sveikus „nešiojus“ bendruomenėje, paėmė mėginius iš fermų, balų, naminių gyvūnėlių ir net kambarinių musių bei kitų vabzdžių, kad nustatytų, kur yra bakterijų.

Jie rado 3 482 izoliatus, įskaitant 15 skirtingų Klebsiella rūšių, kurių pusėje teigiamų mėginių buvo K. pneumoniae.

Kai komanda genetiškai sekvenavo bakterijas, kad išsiaiškintų, kurios padermės yra, jie nustatė, kad ligoninėse ir aplinkoje esančios klaidos labai mažai sutampa.

Tyrimui vadovavęs profesorius Edas Feilas sakė: "Klebsiella infekcijos tampa vis atsparesnės antibiotikams. Nors anksčiau dauguma šlapimo takų infekcijų buvo lengvai išgydomos, dabar pacientai dažniau suserga infekcijomis, kurios pasikartoja ir sukelia problemų.

Genetika ir genomika e-knyga

Populiariausių praėjusių metų interviu, straipsnių ir naujienų rinkinys. Atsisiųsti nemokamą kopiją

„Klebsiella taip pat gali sukelti plaučių uždegimą, nuo kurio miršta maždaug pusė pacientų. Ši bakterija JK yra didesnė problema nei MRSA.

„Mūsų mokslininkai norėjo išsiaiškinti, ar atsparios bakterijos dabar plinta naminiuose gyvūnėliuose, ūkiuose, gyvuliuose, augaluose ir vandenyje, todėl norėjome ištirti, kur randama Klebsiella, ir stebėti, kaip ji plinta, kad informuotume, kaip geriausiai užkirsti kelią protrūkiams ir juos kontroliuoti.

„Mes nustatėme, kad jo yra visur, tačiau nustebome, kad ligoninėje rastos padermės skiriasi nuo aplinkoje rastų padermių, o tai rodo, kad tarp dviejų buveinių yra labai mažai perdavimo: žmonės beveik visada tai gauna iš kitų žmonių.

„Tai patvirtina, kad geriausias būdas kontroliuoti šių bakterijų infekciją išlieka griežta ligoninės higiena ir kad protrūkių, kuriuos sukelia sąlytis su gyvūnais ar aplinka, tikimybė yra mažesnė, nei buvo baiminamasi anksčiau, bent jau tokioje išteklių turtingoje šalyje kaip Italija.

Baiminamasi, kad ūkininkai gali gauti šių bakterijų iš savo gyvulių ar dirvožemio, kad mes galime užsikrėsti nuo užterštos salotos arba kad galime susirgti maudydamiesi užkrėstuose ežeruose.

Mūsų tyrimai nerado jokių to įrodymų, tačiau naminiams gyvūnėliams, tokiems kaip katės ir šunys, aptikome atsparių Klebsiella. Veterinarai ir savininkai turėtų tai žinoti, nes šie gyvūnai gali kelti bakterijų plitimo pavojų.

Daktaras Haris Torpas,pirmasis kūrinio autorius,Oslo universitetas (Norvegija)

Projekto konsorciumui, vadinamam SpARK, vadovavo Bathas, tačiau jame dalyvavo mokslininkai iš JK (Wellcome Sanger Institute, Bristolio ir Glazgo universitetai), Norvegijos, Prancūzijos, Suomijos ir Italijos. Darbas buvo finansuotas Bendro programavimo iniciatyvos dėl atsparumo antimikrobinėms medžiagoms (JPI-AMR) ir MRC ir paskelbtas Nature Microbiology.

Profesorius Feilas sakė: „Tai didžiausias ir sistemingiausias tyrimas, vienu metu atliktas vienoje geografinėje vietoje.

„Ištyrėme padermių perdavimą, tačiau atsparumas antibiotikams gali būti labai lengvai perduodamas kitoms padermėms, kai jos keičiasi ir paima žiedines DNR dalis, vadinamas plazmidėmis.

"Toliau mes norime stebėti, kaip plazmidės perkeliamos tarp padermių, naudojant metodą, vadinamą ilgai skaitytu sekos nustatymu."

Šiuo tikslu komanda neseniai gavo tinklo finansavimą iš JPIAMR, kuris remiasi GW4 mokslinių tyrimų bendruomene ir buvo remiamas GW4 AMR aljanso.

Šaltinis:

Bato universitetas

Nuoroda:

Thorpe, H.A. ir kt. (2022) Didelio masto Klebsiella spp. genomo momentinė nuotrauka. Šiaurės Italijoje esantys izoliatai rodo ribotą perdavimą tarp klinikinių ir neklinikinių. Natūrali mikrobiologija. doi.org/10.1038/s41564-022-01263-0.

.