San Antonio teadlased kasutavad masinõpet surmavate viiruste võimalike ravimeetodite tuvastamiseks

San Antonio teadlased kasutavad masinõpet surmavate viiruste võimalike ravimeetodite tuvastamiseks

San Antonios asuvate biomeditsiini teadlaste meeskond koolitas masinõppe algoritmi, et tuvastada enam kui kaks tosinat elujõulist ravimeetodit haigustele, mida põhjustavad zoonootilised patogeenid, mis võivad levida peremeesorganismidelt inimestele. Edela-uurimisinstituudi (Swri), San Antonio Texase ülikooli (UTSA) ja biomeditsiiniuuringute instituudi (Texas Biomed) teadlased kasutasid Swri väljatöötatud Rhodium™ tarkvara, et uurida nahkhiirtest sündinud Nipah ja Hendra henipaviirusi, mis on levinud mõnes maailma osas, eriti Lusthals, inimestel.

Koostöö käigus kaardistasid teadlased henipaviirustega samasse viiruste perekonda kuuluva leetrite viiruse valgustruktuuri. Kasutades masereid plaanina, uuriti praktiliselt roodiumi ja hinnati ühendeid sobivate struktuuride ja seondumise efektiivsuse osas. 40 miljonist ühendist tuvastas roodium Nipahi ja Hendra jaoks 30 potentsiaalselt elujõulist viiruse inhibiitorit. Kuigi uuringud on keskendunud henipaviiruste viirusevastastele ravidele, võivad kõik laia toimespektriga ravimid ravida seotud viirusi, sealhulgas leetreid.

"Tulemused näitavad, et masinõpe suudab kiiresti tuvastada viirusevastaseid kandidaate kõrge patogeensusega viiruste jaoks, mida on ruumipiirangute ja bioohutuse piirangute tõttu raske uurida," ütles Swri personaliteadlane dr Jonathan Bohmann, kes tutvustas neid leide Hendra@30 Henipavirus rahvusvahelisel konverentsil Austraalias Melbourne'is Austraalias. "Meie algoritmid võimaldavad meil ressursse kõige paremini kasutada, et pakkuda edasiseks testimiseks potentsiaalsete ravimeetodite "lühike loetelu".

Seda kaitseministeeriumi uurimistööd rahastab eelretsenseeritud meditsiiniuuringute programm (PRMRP) Kongressi meditsiiniuuringute programmide (CDMRP) raames ja avab ukse Nipahi ja Hendra ravimeetodite leidmiseks. Maailma Terviseorganisatsiooni andmetel sureb 40–75% nendesse haigustesse nakatunud inimestest.

Henipaviirused on surmavad patogeenid. Need on Aasia ja Austraalia loomapopulatsioonidele endeemilised, kuid kariloomade ja inimestega seotud sündmused toimuvad regulaarselt hooajaliselt, mis on pandeemiapotentsiaali tõttu muret tekitav. “

Dr Jonathan Bohmann, Swri personaliteadlane

Selliste nakkushaiguste uurimine nõuab rangete ohutusstandardite järgimist ja juurdepääsu BSL-4 kõrge kontsentratsiooniga laborile. Ühendeid praktiliselt sõeludes säästavad teadlased aega ja ressursse.

"Meie töö rõhutab meie San Antonio asutustes läbiviidavate multidistsiplinaarsete uuringute võimsust, et koostada kõikehõlmav ja ühtne strateegia uudsete viirusevastaste ravimite kandidaatide väljatöötamiseks," ütles dr Stanton Mcchardy, Texase ülikooli professor ja meditsiinilise keemia ja sünteesi innovatiivse tõhususe põhifunktsioonide direktor.

"Roodium teeb väga head tööd toksiliste ühendite kõrvaldamisel ja tõhusate haiguste inhibiitorite leidmisel," ütles Texas Biomedi dotsent dr Olena Shtanko, kes töötas koos McHardy ja Bohmanniga, hinnates roodiumiga tuvastatud viirusevastaste ühendite tõhusust. "Oleme lühikese aja jooksul teinud üsna palju edusamme, kuid vaja on rohkem uuringuid."

SWRI farmaatsia ja bioinseneri osakond pakub FDA-le senitundmatuid rajatisi, mis vastavad praegustele heade tootmistavade standarditele.

Allikad: