Suche
Mein Konto
Dysregulace RNA-vazebných proteinů u revmatoidní artritidy a osteoartritidy
Oznamujeme novou publikaci pro časopis Acta Materia Medica. Data sekvenování jednobuněčné RNA (SCRNA-Seq) z publikovaných datových souborů byla získána pro zkoumání exprese a dysregulace RNA-vazebných proteinů (RBPS), které jsou kritické pro alternativní sestřih mRNA a translační kontrolu u revmatoidní artritidy (RA). Jak se liší regulace RBP mezi RA a osteoartritidou (OA), bylo zkoumáno pomocí RBP pro subshlukování buněk. Byly provedeny kvantitativní polymerázové řetězové reakce (PCR), aby se potvrdily rozdílně exprimované RBP v RA fibroblastických synoviocytech (FLSS) a OA-FLS, stejně jako u myší s kolagenem indukovanou artritidou (CIA) a kontrolních myší. Kromě toho byla shromážděna hromadná data RNA-seq a byly provedeny analýzy koexprese RBP alternativních sestřihových událostí (ASE) za účelem...
Dysregulace RNA-vazebných proteinů u revmatoidní artritidy a osteoartritidy
Oznamuje nové vydání proActa Materia MedicaČasopis. Data sekvenování jednobuněčné RNA (SCRNA-Seq) z publikovaných datových souborů byla získána pro zkoumání exprese a dysregulace RNA-vazebných proteinů (RBPS), které jsou kritické pro alternativní sestřih mRNA a translační kontrolu u revmatoidní artritidy (RA). Jak se liší regulace RBP mezi RA a osteoartritidou (OA), bylo zkoumáno pomocí RBP pro subshlukování buněk.
Byly provedeny kvantitativní polymerázové řetězové reakce (PCR), aby se potvrdily rozdílně exprimované RBP v RA fibroblastických synoviocytech (FLSS) a OA-FLS, stejně jako u myší s kolagenem indukovanou artritidou (CIA) a kontrolních myší. Kromě toho byla shromážděna hromadná data RNA-seq a byly provedeny analýzy koexprese RBP alternativních sestřihových událostí (ASE), aby se odhalila potenciální regulační úloha RBP souvisejících s RA s ASD. Mezi RA a OA byly prokázány významné variace v relativních podílech buněčných subtypů s RBP downregulovanými, RBP nadměrně regulovanými v každém buněčném typu a vykazující vysokou specificitu pro určité podskupiny. Ve fibroblastech bylo identifikováno 115 upregulovaných a 133 downregulovaných RBP. Bylo zjištěno, že vazebný protein Y-boxu 3 (YBX3) a sestřihový faktor 3B podjednotka 6 (SF3B6) jsou upregulovány u RA-FLS a CIA myší) byly downregulovány u RA-FLS. Skupina RA vykazovala silnější interakce s buněčnými typy ve srovnání se skupinou OA se zlepšenými signálními cestami, jako jsou: B. Fibronektin 1 shluk diferenciace 44 (FN1-CD44) a CXC motiv chemokinový ligand 12-CXC motiv chemokinový receptor 4 (CXCL12-CXCR4).
Kromě toho tři upregulované geny (spektrinová repetice obsahující protein jaderného obalu 2, obsahující protein 2 [SYNE2]S100 protein vázající vápník A9 [S100A9] a interferonem indukovaný protein obsahující tetratrikopeptidové repetice 3 [IFIT3]) a čtyři downregulované geny (ribonukleáza 1 [RNASE1]granulin] a doménu [SGRN3BSF]1 obsahující [SGRN3BSFn] byly koexprimovány v RBP spojených s RA a ASES.
Tyto výsledky naznačují, že dysregulace RBP může přispět k rozvoji RA a poskytnout potenciální cíle pro terapeutické intervence.
Zdroje:
Luo, H.,a kol. (2025). Dešifrování regulačních programů RNA vazebných proteinů u revmatoidní artritidy pomocí jednobuněčné transkriptomové analýzy. Acta Materia Medica. doi.org/10.15212/amm-2024-0034.