Dysregulering af RNA-bindende proteiner ved reumatoid arthritis og slidgigt

Dysregulering af RNA-bindende proteiner ved reumatoid arthritis og slidgigt

Annoncerer en ny udgivelse forActa Materia MedicaMagasin. Enkeltcellede RNA-sekventeringsdata (SCRNA-Seq) fra offentliggjorte datasæt blev opnået for at undersøge ekspressionen og dysreguleringen af ​​RNA-bindende proteiner (RBPS), som er kritiske for alternativ mRNA-splejsning og translationel kontrol ved reumatoid arthritis (RA). Hvordan RBP-regulering adskiller sig mellem RA og slidgigt (OA) blev undersøgt ved hjælp af RBP til cellesubclustering.

Kvantitative polymerasekædereaktioner (PCR'er) blev udført for at bekræfte differentielt udtrykte RBP'er i RA fibroblastiske synoviocytter (FLSS) og OA-FLS, såvel som i kollagen-induceret arthritis (CIA) mus og kontrolmus. Derudover blev masse-RNA-seq-dataene indsamlet, og RBP alternative splejsningshændelser (ASE) co-ekspressionsanalyser blev udført for at afsløre den potentielle regulatoriske rolle af RA-relaterede RBP'er med ASD. Signifikante variationer i de relative andele af celleundertyper blev påvist mellem RA og OA med RBP'er nedregulerede, RBP'er overregulerede i hver celletype og viste høj specificitet for visse undergrupper. Et hundrede fem opregulerede og 133 nedregulerede RBP'er blev identificeret i fibroblaster. Y-boks bindende protein 3 (YBX3) og splejsningsfaktor 3B underenhed 6 (SF3B6) viste sig at være opreguleret i RA-FLS og CIA mus) blev nedreguleret i RA-FLS. RA-gruppen viste stærkere interaktioner med celletyper sammenlignet med OA-gruppen med forbedrede signalveje såsom: B. Fibronectin 1 klynge af differentiering 44 (FN1-CD44) og CXC motiv kemokin ligand 12-CXC motiv kemokin receptor 4 (CXCL12-CXCR).

Derudover tre opregulerede gener (spektrin-gentagelse indeholdende nuklear kappeprotein 2, indeholdende protein 2 [SYNE2]S100 calciumbindende protein A9 [S100A9] og interferon-induceret protein indeholdende tetratricopeptid-gentagelser 3 [IFIT3]) og fire nedregulerede gener (ribonuklease [ribonuklease] og sorbinRNASEGR1N 1 [granF1nRNASEGR1] SH3-domæne indeholdende 2 [SORBS2]) blev co-udtrykt i RA-associerede RBP'er og ASES.
Disse resultater tyder på, at dysregulering af RBP'er kan bidrage til udviklingen af ​​RA og give potentielle mål for terapeutiske interventioner.

Kilder: