Δυσρύθμιση των πρωτεϊνών που δεσμεύουν το RNA στη ρευματοειδή αρθρίτιδα και την οστεοαρθρίτιδα

Δυσρύθμιση των πρωτεϊνών που δεσμεύουν το RNA στη ρευματοειδή αρθρίτιδα και την οστεοαρθρίτιδα

Ανακοίνωση νέας κυκλοφορίας γιαActa Materia MedicaΠεριοδικό. Δεδομένα αλληλουχίας RNA μονοκυττάρου (SCRNA-Seq) από δημοσιευμένα σύνολα δεδομένων ελήφθησαν για να εξεταστεί η έκφραση και η απορρύθμιση των πρωτεϊνών που δεσμεύουν το RNA (RBPS), οι οποίες είναι κρίσιμες για εναλλακτικό μάτισμα mRNA και μεταφραστικό έλεγχο στη ρευματοειδή αρθρίτιδα (RA). Ο τρόπος με τον οποίο η ρύθμιση της RBP διαφέρει μεταξύ της ΡΑ και της οστεοαρθρίτιδας (ΟΑ) εξετάστηκε χρησιμοποιώντας RBP για υποομαδοποίηση κυττάρων.

Πραγματοποιήθηκαν ποσοτικές αλυσιδωτές αντιδράσεις πολυμεράσης (PCRs) για να επιβεβαιωθούν οι διαφορικά εκφρασμένες RBPs σε ινοβλαστικά αρθρικά κύτταρα RA (FLSS) και OA-FLS, καθώς και σε ποντίκια με αρθρίτιδα που προκαλείται από κολλαγόνο (CIA) και ποντίκια ελέγχου. Επιπλέον, συλλέχθηκαν τα μαζικά δεδομένα RNA-seq και πραγματοποιήθηκαν αναλύσεις συνέκφρασης συμβάντων εναλλακτικής ματίσματος RBP (ASE) για να αποκαλυφθεί ο πιθανός ρυθμιστικός ρόλος των RBP που σχετίζονται με RA με ASD. Σημαντικές διακυμάνσεις στις σχετικές αναλογίες των υποτύπων κυττάρων καταδείχθηκαν μεταξύ RA και OA με τα RBP να ρυθμίζονται προς τα κάτω, τα RBP να υπερρυθμίζονται σε κάθε τύπο κυττάρου και να δείχνουν υψηλή ειδικότητα για ορισμένα υποσύνολα. Εκατόν πέντε ρυθμισμένα προς τα πάνω και 133 μειωμένα RBP ταυτοποιήθηκαν στους ινοβλάστες. Η πρωτεΐνη 3 που δεσμεύει το κουτί Y (YBX3) και ο παράγοντας ματίσματος 3Β υπομονάδα 6 (SF3B6) βρέθηκε ότι ρυθμίζονται προς τα πάνω σε ποντίκια RA-FLS και CIA) ρυθμίζονται προς τα κάτω στο RA-FLS. Η ομάδα RA εμφάνισε ισχυρότερες αλληλεπιδράσεις με κυτταρικούς τύπους σε σύγκριση με την ομάδα ΟΑ με βελτιωμένα μονοπάτια σηματοδότησης όπως: Β. Σύμπλεγμα διαφοροποίησης ινονεκτίνης 1 44 (FN1-CD44) και υποδοχέας χημειοκίνης με μοτίβο CXC μοτίβος 12-CXC υποδοχέας χημειοκίνης 44-CXCXCR12-CXC.

Επιπλέον, τρία γονίδια ρυθμισμένα προς τα πάνω (επανάληψη σπεκτρίνης που περιέχει πρωτεΐνη πυρηνικού φακέλου 2, που περιέχει πρωτεΐνη 2 [SYNE2]S100 πρωτεΐνη δέσμευσης ασβεστίου A9 [S100A9] και πρωτεΐνη που προκαλείται από ιντερφερόνη που περιέχει επαναλήψεις τετρατρικοπετιδίου 3 [IFIT3]) και τέσσερα γονίδια μειωμένης ρύθμισης (ριβονουκλεάση [ριβονουκλεϊνη 1ΡΝΑ και 1ΝΕ1Ν]Γρανάση [ριβονουκλεϊνη 11νΕΓ] και 1ΝΕ1Ν]Γρανάση [ριβονουκλεϊνάση 11ulbinSE] 1N1N] Η περιοχή SH3 που περιέχει 2 [SORBS2]) συνεκφράστηκαν σε RBP και ASES που σχετίζονται με RA.
Αυτά τα αποτελέσματα υποδηλώνουν ότι η απορρύθμιση των RBP μπορεί να συμβάλει στην ανάπτυξη της ΡΑ και να παρέχει πιθανούς στόχους για θεραπευτικές παρεμβάσεις.

Πηγές: