Desregulación de las proteínas de unión a ARN en la artritis reumatoide y la osteoartritis

Desregulación de las proteínas de unión a ARN en la artritis reumatoide y la osteoartritis

Anunciando un nuevo lanzamiento paraActa Materia MédicaRevista. Se obtuvieron datos de secuenciación de ARN unicelular (SCRNA-Seq) de conjuntos de datos publicados para examinar la expresión y desregulación de las proteínas de unión a ARN (RBPS), que son fundamentales para el empalme alternativo de ARNm y el control traslacional en la artritis reumatoide (AR). Se examinó cómo la regulación de la RBP difiere entre la AR y la osteoartritis (OA) utilizando RBP para la subagrupación celular.

Se realizaron reacciones en cadena de la polimerasa cuantitativa (PCR) para confirmar las RBP expresadas diferencialmente en sinoviocitos fibroblásticos de AR (FLSS) y OA-FLS, así como en ratones con artritis inducida por colágeno (CIA) y ratones de control. Además, se recopilaron datos masivos de RNA-seq y se realizaron análisis de coexpresión de eventos de empalme alternativo (ASE) de RBP para revelar el posible papel regulador de los RBP relacionados con la AR con TEA. Se demostraron variaciones significativas en las proporciones relativas de los subtipos de células entre AR y OA con RBP reguladas negativamente, RBP sobrerreguladas en cada tipo de célula y mostrando una alta especificidad para ciertos subconjuntos. Se identificaron en los fibroblastos ciento cinco RBP regulados positivamente y 133 regulados negativamente. Se encontró que la proteína de unión a la caja Y 3 (YBX3) y la subunidad 6 del factor de empalme 3B (SF3B6) estaban reguladas positivamente en ratones RA-FLS y CIA) estaban reguladas negativamente en RA-FLS. El grupo de AR mostró interacciones más fuertes con los tipos de células en comparación con el grupo de OA con vías de señalización mejoradas, como: B. Grupo de diferenciación 44 de fibronectina 1 (FN1-CD44) y ligando de quimiocina con motivo CXC 12-receptor de quimiocina 4 con motivo CXC (CXCL12-CXCR4).

Además, se detectaron tres genes regulados positivamente (repetición de espectrina que contiene la proteína 2 de la envoltura nuclear, que contiene la proteína 2 [SYNE2]S100, proteína A9 de unión al calcio [S100A9] y proteína inducida por interferón que contiene repeticiones tetratricopeptídicas 3 [IFIT3]) y cuatro genes regulados negativamente (ribonucleasa 1 [RNASE1]granulina [GRN]Fn1 y sorbina y dominio SH3 que contiene 2 [SORBS2]). coexpresado en RBP y ASES asociados a RA.
Estos resultados sugieren que la desregulación de las RBP puede contribuir al desarrollo de la AR y proporcionar objetivos potenciales para intervenciones terapéuticas.

Fuentes: