RNA-d siduvate valkude düsregulatsioon reumatoidartriidi ja osteoartriidi korral

RNA-d siduvate valkude düsregulatsioon reumatoidartriidi ja osteoartriidi korral

Teatame uuest väljalasestActa Materia MedicaAjakiri. Avaldatud andmekogumitest saadi üherakulise RNA sekveneerimise (SCRNA-Seq) andmed, et uurida RNA-d siduvate valkude (RBPS) ekspressiooni ja düsregulatsiooni, mis on kriitilise tähtsusega alternatiivse mRNA splaissimise ja translatsioonikontrolli jaoks reumatoidartriidi (RA) korral. Uuriti, kuidas RBP regulatsioon RA ja osteoartriidi (OA) vahel erineb, kasutades rakkude alamklastriks RBP-d.

Kvantitatiivsed polümeraasi ahelreaktsioonid (PCR) viidi läbi, et kinnitada erinevalt ekspresseeritud RBP-sid RA fibroblastilistes sünoviotsüütides (FLSS) ja OA-FLS-is, samuti kollageenist põhjustatud artriidi (CIA) hiirtel ja kontrollhiirtel. Lisaks koguti RNA-seq hulgiandmed ja viidi läbi RBP alternatiivsete splaissimise sündmuste (ASE) koekspressioonianalüüsid, et paljastada RA-ga seotud RBP-de võimalik regulatiivne roll ASD-ga. RA ja OA vahel demonstreeriti olulisi erinevusi raku alatüüpide suhtelistes proportsioonides, kusjuures RBP-d olid allareguleeritud, RBP-d ülereguleeritud igas rakutüübis ja teatud alamhulkade puhul olid need kõrged. Fibroblastides tuvastati sada viis ülesreguleeritud ja 133 allareguleeritud RBP-d. Leiti, et Y-boxi siduv valk 3 (YBX3) ja splaissimisfaktori 3B alaühik 6 (SF3B6) olid RA-FLS-is ülesreguleeritud ja CIA hiirtel olid RA-FLS-is allareguleeritud. RA rühm näitas tugevamat interaktsiooni rakutüüpidega võrreldes OA rühmaga, millel on paremad signaalirajad, näiteks: B. Fibronektiin 1 diferentseerumisklaster 44 (FN1-CD44) ja CXC motiiv kemokiini ligand 12-CXC motiiv kemokiini retseptor 4 (CXCR4CL12-CX).

Lisaks kolm ülesreguleeritud geeni (spektriini kordus, mis sisaldab tuuma ümbrise valku 2, sisaldab valku 2 [SYNE2]S100 kaltsiumi siduvat valku A9 [S100A9] ja interferooniga indutseeritud valku, mis sisaldab tetratrikopeptiidi kordusi 3 [IFIT3]) ja neli allareguleeritud geeni (ribonukleaas 1 [RNASEN] domeen, mis sisaldab soronuliini [RNASE1] FSH1granuliin [SORBS2]) ekspresseeriti koos RA-ga seotud RBP-des ja ASES-is.
Need tulemused viitavad sellele, et RBP-de düsregulatsioon võib aidata kaasa RA arengule ja pakkuda potentsiaalseid sihtmärke terapeutilistele sekkumistele.

Allikad: