RNA:ta sitovien proteiinien säätelyhäiriö nivelreumassa ja nivelrikossa

RNA:ta sitovien proteiinien säätelyhäiriö nivelreumassa ja nivelrikossa

Uudesta julkaisusta tiedotetaanActa Materia MedicaAikakauslehti. Yksisoluisen RNA-sekvensoinnin (SCRNA-Seq) tiedot julkaistuista tietosarjoista saatiin tutkimaan RNA:ta sitovien proteiinien (RBPS) ilmentymistä ja säätelyhäiriöitä, jotka ovat kriittisiä vaihtoehtoiselle mRNA:n silmukoitumiselle ja translaation säätelylle nivelreumassa (RA). Kuinka RBP:n säätely eroaa RA:n ja nivelrikon (OA) välillä, tutkittiin käyttämällä RBP:tä solujen alaklusterointiin.

Kvantitatiiviset polymeraasiketjureaktiot (PCR:t) suoritettiin eri tavoin ilmentyneiden RBP:iden vahvistamiseksi RA-fibroblastisissa synoviosyyteissä (FLSS) ja OA-FLS:ssä sekä kollageenin aiheuttamassa niveltulehduksessa (CIA) ja kontrollihiirissä. Lisäksi kerättiin massa RNA-seq-dataa ja suoritettiin RBP:n vaihtoehtoisten silmukointitapahtumien (ASE) yhteisilmentymisanalyysit paljastamaan ASD:tä sairastavien RA:hen liittyvien RBP:iden mahdollinen säätelyrooli. Merkittäviä vaihteluja solualatyyppien suhteellisissa osuuksissa osoitettiin RA:n ja OA:n välillä, kun RBP:t olivat alhaalla, RBP:t ylisäädeltyinä kussakin solutyypissä ja osoittivat suurta spesifisyyttä tietyille alaryhmille. Fibroblasteista tunnistettiin sataviisi ylössäädeltyä ja 133 alassäänneltyä RBP:tä. Y-laatikkoa sitovan proteiinin 3 (YBX3) ja silmukointitekijän 3B:n alayksikön 6 (SF3B6) havaittiin olevan ylössäädelty RA-FLS:ssä ja CIA-hiirissä) säädelty alas RA-FLS:ssä. RA-ryhmä osoitti voimakkaampia vuorovaikutuksia solutyyppien kanssa verrattuna OA-ryhmään, jolla oli parannetut signalointireitit, kuten: B. Fibronektiini 1:n erilaistumisklusteri 44 (FN1-CD44) ja CXC-motiivi kemokiiniligandi 12-CXC-motiivi kemokiinireseptori 4 (CXCR4CL12-CX).

Lisäksi kolme ylössäädeltyä geeniä (spektriinitoisto, joka sisältää tuman vaippaproteiinin 2, sisältää proteiinin 2 [SYNE2]S100 kalsiumia sitovan proteiinin A9 [S100A9] ja interferonin indusoimaa proteiinia sisältävää tetratrikopeptiditoistoa 3 [IFIT3]) ja neljä alasäädeltyä geeniä (ribonukleaasi 1:n sisältävä [RNASE1]Fsorn3GR3-domeeni ja 2-granuliini [RNASE1]F-granuliini1. [SORBS2]) ilmentyivät yhdessä RA:hen liittyvissä RBP:issä ja ASES:issä.
Nämä tulokset viittaavat siihen, että RBP:iden säätelyhäiriöt voivat edistää nivelreuman kehittymistä ja tarjota mahdollisia kohteita terapeuttisille interventioille.

Lähteet: