Suche
Mein Konto
Disregulacija RNA-vezujućih proteina u reumatoidnom artritisu i osteoartritisu
Najavljujemo novu publikaciju časopisa Acta Materia Medica. Podaci sekvenciranja jednostanične RNA (SCRNA-Seq) iz objavljenih skupova podataka dobiveni su za ispitivanje ekspresije i disregulacije RNA-vezujućih proteina (RBPS), koji su ključni za alternativno spajanje mRNA i kontrolu translacije kod reumatoidnog artritisa (RA). Kako se regulacija RBP-a razlikuje između RA i osteoartritisa (OA) ispitano je korištenjem RBP-a za subklasteriranje stanica. Provedene su kvantitativne lančane reakcije polimeraze (PCR) kako bi se potvrdili različito izraženi RBP u RA fibroblastičnim sinoviocitima (FLSS) i OA-FLS, kao i kod miševa izazvanog kolagenom (CIA) i kontrolnih miševa. Dodatno, prikupljeni su skupni RNA-seq podaci i provedene su koekspresijske analize RBP alternativnih događaja spajanja (ASE) kako bi se...
Disregulacija RNA-vezujućih proteina u reumatoidnom artritisu i osteoartritisu
Najavljujemo novo izdanje zaActa Materia MedicaČasopis. Podaci sekvenciranja jednostanične RNA (SCRNA-Seq) iz objavljenih skupova podataka dobiveni su za ispitivanje ekspresije i disregulacije RNA-vezujućih proteina (RBPS), koji su ključni za alternativno spajanje mRNA i kontrolu translacije kod reumatoidnog artritisa (RA). Kako se regulacija RBP-a razlikuje između RA i osteoartritisa (OA) ispitano je korištenjem RBP-a za subklasteriranje stanica.
Provedene su kvantitativne lančane reakcije polimeraze (PCR) kako bi se potvrdili različito izraženi RBP u RA fibroblastičnim sinoviocitima (FLSS) i OA-FLS, kao i kod miševa izazvanog kolagenom (CIA) i kontrolnih miševa. Dodatno, prikupljeni su skupni RNA-seq podaci i provedene su analize koekspresije RBP alternativnih događaja spajanja (ASE) kako bi se otkrila potencijalna regulatorna uloga RBP-ova povezanih s RA s ASD-om. Značajne varijacije u relativnim udjelima podtipova stanica pokazane su između RA i OA s RBP-ima smanjenim, RBP-ima prereguliranim u svakom tipu stanica i pokazujući visoku specifičnost za određene podskupine. Sto pet pojačano reguliranih i 133 smanjena RBP-a identificirano je u fibroblastima. Utvrđeno je da su Y-box vezni protein 3 (YBX3) i podjedinica 6 faktora spajanja 3B (SF3B6) regulirani prema gore u RA-FLS i CIA miševa) bili smanjeni u RA-FLS. Skupina RA pokazala je snažnije interakcije s tipovima stanica u usporedbi sa skupinom OA s poboljšanim signalnim putovima kao što su: B. Fibronektin 1 klaster diferencijacije 44 (FN1-CD44) i CXC motiv kemokinski ligand 12-CXC motiv kemokinski receptor 4 (CXCL12-CXCR4).
Osim toga, tri pojačano regulirana gena (spektrinsko ponavljanje koje sadrži protein jezgrene ovojnice 2, sadrži protein 2 [SYNE2]S100 protein koji veže kalcij A9 [S100A9] i interferonom inducirani protein koji sadrži tetratrikopeptidne ponavljanje 3 [IFIT3]) i četiri smanjeno regulirana gena (ribonukleaza 1 [RNASE1]granulin [GRN]Fn1 i sorbina i SH3 domene koje sadrže 2 [SORBS2]) bile su koeksprimirane u RBP-ima i ASES-ima povezanim s RA.
Ovi rezultati sugeriraju da disregulacija RBP-a može pridonijeti razvoju RA i pružiti potencijalne ciljeve za terapijske intervencije.
Izvori:
Luo, H.,et al. (2025). Dešifriranje regulatornih programa proteina vezanja RNK u reumatoidnom artritisu analizom jednostaničnog transkriptoma. Acta Materia Medica. doi.org/10.15212/amm-2024-0034.