Az RNS-kötő fehérjék szabályozási zavara rheumatoid arthritisben és osteoarthritisben

Az RNS-kötő fehérjék szabályozási zavara rheumatoid arthritisben és osteoarthritisben

Új kiadás bejelentése a számáraActa Materia MedicaMagazin. Az egysejtű RNS szekvenálás (SCRNA-Seq) adatait publikált adatkészletekből nyertük az RNS-kötő fehérjék (RBPS) expressziójának és diszregulációjának vizsgálatára, amelyek kritikusak az alternatív mRNS splicing és a transzlációs szabályozás szempontjából rheumatoid arthritisben (RA). Azt, hogy az RBP szabályozása miben különbözik az RA és az osteoarthritis (OA) között, RBP segítségével vizsgáltuk a sejtek alcsoportosítására.

Kvantitatív polimeráz láncreakciókat (PCR) végeztünk a differenciálisan kifejeződő RBP-k megerősítésére RA fibroblaszt synoviocytákban (FLSS) és OA-FLS-ben, valamint kollagén-indukált arthritises (CIA) egerekben és kontroll egerekben. Ezenkívül összegyűjtöttük a tömeges RNS-seq adatokat, és RBP alternatív splicing események (ASE) koexpressziós elemzéseket végeztünk, hogy feltárjuk az RA-val kapcsolatos RBP-k lehetséges szabályozó szerepét ASD-vel. Szignifikáns eltéréseket mutattak ki a sejtaltípusok relatív arányában az RA és az OA között, az RBP-k leszabályozása, az RBP-k túlszabályozása mindegyik sejttípusban, és bizonyos alcsoportok esetében magas specifitást mutattak. Százöt felszabályozott és 133 downregulált RBP-t azonosítottak a fibroblasztokban. Az Y-box kötő fehérje 3 (YBX3) és a splicing faktor 3B 6. alegysége (SF3B6) RA-FLS-ben, a CIA egerekben pedig leszabályozott RA-FLS-ben. Az RA csoport erősebb kölcsönhatásokat mutatott a sejttípusokkal, mint az OA csoport, a jobb jelátviteli útvonalakkal, mint például: B. Fibronectin 1 klaszter differenciálódás 44 (FN1-CD44) és CXC motívum kemokin ligand 12-CXC motívum kemokin receptor 4 (CXCR4CL12-CX).

Ezen kívül három felszabályozott gén (nukleáris burok fehérjét 2 tartalmazó spektrin ismétlődés, 2 fehérje [SYNE2]S100 kalciumkötő fehérje A9 [S100A9] és interferonnal indukált fehérje, amely tetratrikopeptid ismétlődéseket tartalmaz 3 [IFIT3]) és négy downregulált gén (ribonukleáz 1-et tartalmazó [RNASE1]F szorún3GR domén és 2granulin 1 [SORBS2]) RA-asszociált RBP-ben és ASES-ben együtt expresszálódnak.
Ezek az eredmények arra utalnak, hogy az RBP-k diszregulációja hozzájárulhat az RA kialakulásához, és potenciális célpontokat jelenthet a terápiás beavatkozásokhoz.

Források: