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Disregolazione delle proteine leganti l’RNA nell’artrite reumatoide e nell’osteoartrosi
Annuncio di una nuova pubblicazione per la rivista Acta Materia Medica. Sono stati ottenuti dati di sequenziamento dell'RNA a cellula singola (SCRNA-Seq) da set di dati pubblicati per esaminare l'espressione e la disregolazione delle proteine leganti l'RNA (RBPS), che sono fondamentali per lo splicing alternativo dell'mRNA e il controllo traslazionale nell'artrite reumatoide (RA). Il modo in cui la regolazione dell'RBP differisce tra l'artrite reumatoide e l'osteoartrosi (OA) è stato esaminato utilizzando l'RBP per il subclustering cellulare. Sono state eseguite reazioni a catena della polimerasi (PCR) quantitative per confermare gli RBP espressi in modo differenziale nei sinoviociti fibroblastici dell'AR (FLSS) e OA-FLS, nonché nei topi con artrite indotta da collagene (CIA) e nei topi di controllo. Inoltre, sono stati raccolti i dati di massa RNA-seq e sono state eseguite analisi di coespressione degli eventi di splicing alternativo (ASE) dell'RBP per...
Disregolazione delle proteine leganti l’RNA nell’artrite reumatoide e nell’osteoartrosi
Annuncio di una nuova versione perActa Materia MedicaRivista. Sono stati ottenuti dati di sequenziamento dell'RNA a cellula singola (SCRNA-Seq) da set di dati pubblicati per esaminare l'espressione e la disregolazione delle proteine leganti l'RNA (RBPS), che sono fondamentali per lo splicing alternativo dell'mRNA e il controllo traslazionale nell'artrite reumatoide (RA). Il modo in cui la regolazione dell'RBP differisce tra l'artrite reumatoide e l'osteoartrosi (OA) è stato esaminato utilizzando l'RBP per il subclustering cellulare.
Sono state eseguite reazioni a catena della polimerasi (PCR) quantitative per confermare gli RBP espressi in modo differenziale nei sinoviociti fibroblastici dell'AR (FLSS) e OA-FLS, nonché nei topi con artrite indotta da collagene (CIA) e nei topi di controllo. Inoltre, sono stati raccolti i dati di massa RNA-seq e sono state eseguite analisi di coespressione degli eventi di splicing alternativo (ASE) dell'RBP per rivelare il potenziale ruolo normativo degli RBP correlati all'AR con ASD. Sono state dimostrate variazioni significative nelle proporzioni relative dei sottotipi cellulari tra AR e OA con RBP sottoregolati, RBP sovraregolati in ciascun tipo di cellula e mostrando un'elevata specificità per alcuni sottoinsiemi. Nei fibroblasti sono stati identificati centocinque RBP sovraregolati e 133 sottoregolati. La proteina legante Y-box 3 (YBX3) e la subunità 6 del fattore di splicing 3B (SF3B6) sono risultate sovraregolate nei topi RA-FLS e CIA) erano sottoregolate in RA-FLS. Il gruppo RA ha mostrato interazioni più forti con i tipi cellulari rispetto al gruppo OA con percorsi di segnalazione migliorati come: B. Fibronectina 1 cluster di differenziazione 44 (FN1-CD44) e ligando delle chemochine con motivo CXC recettore 4 delle chemochine con motivo 12-CXC (CXCL12-CXCR4).
Inoltre, tre geni sovraregolati (ripetizione della spettrina contenente la proteina 2 dell'involucro nucleare, contenente la proteina 2 [SYNE2]S100, proteina legante il calcio A9 [S100A9] e la proteina indotta dall'interferone contenente ripetizioni del tetratricopeptide 3 [IFIT3]) e quattro geni sottoregolati (ribonucleasi 1 [RNASE1]granulina [GRN]Fn1 e sorbina e dominio SH3 contenente 2 [SORBS2]) sono stati co-espresso in RBP e ASES associati all'RA.
Questi risultati suggeriscono che la disregolazione degli RBP può contribuire allo sviluppo dell’artrite reumatoide e fornire potenziali bersagli per interventi terapeutici.
Fonti:
Luo, H.,et al. (2025). Decifrare i programmi regolatori delle proteine leganti l'RNA nell'artrite reumatoide attraverso l'analisi del trascrittoma di una singola cellula. Acta Materia Medica. doi.org/10.15212/amm-2024-0034.