Suche
Mein Konto
RNR surišančių baltymų reguliavimas sergant reumatoidiniu artritu ir osteoartritu
Skelbiame naują leidinį Acta Materia Medica žurnalui. Vienos ląstelės RNR sekos (SCRNA-Seq) duomenys buvo gauti iš paskelbtų duomenų rinkinių, siekiant ištirti RNR surišančių baltymų (RBPS), kurie yra labai svarbūs alternatyviam mRNR sujungimui ir transliacijos kontrolei sergant reumatoidiniu artritu (RA), ekspresiją ir reguliavimo sutrikimą. Kaip RBP reguliavimas skiriasi tarp RA ir osteoartrito (OA), buvo ištirta naudojant RBP ląstelių subgrupavimui. Buvo atliktos kiekybinės polimerazės grandininės reakcijos (PCR), siekiant patvirtinti skirtingai išreikštus RBP RA fibroblastiniuose sinoviocituose (FLSS) ir OA-FLS, taip pat kolageno sukelto artrito (CIA) pelėse ir kontrolinėse pelėse. Be to, buvo surinkti masiniai RNR-seq duomenys ir atlikta RBP alternatyvių sujungimo įvykių (ASE) koekspresijos analizė, siekiant...
RNR surišančių baltymų reguliavimas sergant reumatoidiniu artritu ir osteoartritu
Skelbiame apie naują leidimąActa Materia MedicaŽurnalas. Vienos ląstelės RNR sekos (SCRNA-Seq) duomenys buvo gauti iš paskelbtų duomenų rinkinių, siekiant ištirti RNR surišančių baltymų (RBPS), kurie yra labai svarbūs alternatyviam mRNR sujungimui ir transliacijos kontrolei sergant reumatoidiniu artritu (RA), ekspresiją ir reguliavimo sutrikimą. Kaip RBP reguliavimas skiriasi tarp RA ir osteoartrito (OA), buvo ištirta naudojant RBP ląstelių subgrupavimui.
Buvo atliktos kiekybinės polimerazės grandininės reakcijos (PCR), siekiant patvirtinti skirtingai išreikštus RBP RA fibroblastiniuose sinoviocituose (FLSS) ir OA-FLS, taip pat kolageno sukelto artrito (CIA) pelėse ir kontrolinėse pelėse. Be to, buvo surinkti masiniai RNR-seq duomenys ir atlikta RBP alternatyvių sujungimo įvykių (ASE) koekspresijos analizė, siekiant atskleisti galimą su RA susijusių RBP su ASD reguliavimo vaidmenį. Buvo parodyti reikšmingi santykinių ląstelių potipių proporcijų skirtumai tarp RA ir OA, kai RBP buvo sumažintas, RBP buvo per daug reguliuojamas kiekviename ląstelių tipe ir parodė didelį specifiškumą tam tikriems pogrupiams. Fibroblastuose buvo identifikuoti šimtai penki sureguliuoti ir 133 sumažinti RBP. Nustatyta, kad Y-box surišantis baltymas 3 (YBX3) ir sujungimo faktoriaus 3B 6 subvienetas (SF3B6) buvo sureguliuoti RA-FLS, o CIA pelėse – buvo sumažintas RA-FLS. RA grupė parodė stipresnę sąveiką su ląstelių tipais, palyginti su OA grupe, su patobulintais signalizacijos keliais, tokiais kaip: B. Fibronektino 1 diferenciacijos klasteris 44 (FN1-CD44) ir CXC motyvo chemokino ligando 12-CXC motyvo chemokino receptorius 4 (CXCR412-CX).
Be to, trys sureguliuoti genai (spektrino pakartojimas, turintis 2 branduolio apvalkalo baltymą, 2 baltymą [SYNE2]S100 kalcį surišantis baltymas A9 [S100A9] ir interferono sukeltas baltymas, turintis tetratrikopeptido pasikartojimus 3 [IFIT3]) ir keturi sureguliuoti genai (ribonukleazės 1 domenas [RNASE1] ir FSH3granulinas [SORBS2]) buvo išreikšti su RA susijusiuose RBP ir ASES.
Šie rezultatai rodo, kad RBP reguliavimas gali prisidėti prie RA vystymosi ir būti galimi terapinių intervencijų tikslai.
Šaltiniai:
Luo, H.,ir kt. (2025). RNR surišančių baltymų reguliavimo programų iššifravimas sergant reumatoidiniu artritu, atliekant vienos ląstelės transkripto analizę. Acta Materia Medica. doi.org/10.15212/amm-2024-0034.