Suche
Mein Konto
RNS saistošo proteīnu disregulācija reimatoīdā artrīta un osteoartrīta gadījumā
Paziņojam par jaunu žurnāla Acta Materia Medica publikāciju. Vienšūnu RNS sekvencēšanas (SCRNA-Seq) dati no publicētajām datu kopām tika iegūti, lai pārbaudītu RNS saistošo proteīnu (RBPS) ekspresiju un disregulāciju, kas ir būtiski alternatīvai mRNS splicēšanai un translācijas kontrolei reimatoīdā artrīta (RA) gadījumā. Tika pārbaudīts, kā RBP regulējums atšķiras starp RA un osteoartrītu (OA), izmantojot RBP šūnu apakšgrupēšanai. Tika veiktas kvantitatīvās polimerāzes ķēdes reakcijas (PCR), lai apstiprinātu atšķirīgi ekspresētus RBP RA fibroblastiskajos sinoviocītos (FLSS) un OA-FLS, kā arī kolagēna izraisīta artrīta (CIA) pelēm un kontroles pelēm. Turklāt tika savākti lielapjoma RNS-seq dati un veiktas RBP alternatīvo splicēšanas notikumu (ASE) koekspresijas analīzes, lai ...
RNS saistošo proteīnu disregulācija reimatoīdā artrīta un osteoartrīta gadījumā
Tiek paziņots par jaunu izlaidumu vietneiActa Materia MedicaŽurnāls. Vienšūnu RNS sekvencēšanas (SCRNA-Seq) dati no publicētajām datu kopām tika iegūti, lai pārbaudītu RNS saistošo proteīnu (RBPS) ekspresiju un disregulāciju, kas ir būtiski alternatīvai mRNS splicēšanai un translācijas kontrolei reimatoīdā artrīta (RA) gadījumā. Tika pārbaudīts, kā RBP regulējums atšķiras starp RA un osteoartrītu (OA), izmantojot RBP šūnu apakšgrupēšanai.
Tika veiktas kvantitatīvās polimerāzes ķēdes reakcijas (PCR), lai apstiprinātu atšķirīgi ekspresētus RBP RA fibroblastiskajos sinoviocītos (FLSS) un OA-FLS, kā arī kolagēna izraisīta artrīta (CIA) pelēm un kontroles pelēm. Turklāt tika savākti lielapjoma RNS-seq dati un veiktas RBP alternatīvo splicēšanas notikumu (ASE) koekspresijas analīzes, lai atklātu ar RA saistīto RBP ar ASD iespējamo regulējošo lomu. Tika demonstrētas būtiskas atšķirības šūnu apakštipu relatīvajās proporcijās starp RA un OA ar samazinātu RBP regulēšanu, RBP pārregulēšanu katrā šūnu tipā un uzrādot augstu specifiskumu noteiktām apakškopām. Fibroblastos tika identificēti simts pieci paaugstināti un 133 pazemināti regulēti RBP. Tika konstatēts, ka Y-box saistošais proteīns 3 (YBX3) un splicēšanas faktora 3B apakšvienība 6 (SF3B6) ir paaugstināti regulēti RA-FLS un CIA pelēm) tika pazemināti RA-FLS. RA grupa uzrādīja spēcīgāku mijiedarbību ar šūnu tipiem, salīdzinot ar OA grupu, ar uzlabotiem signalizācijas ceļiem, piemēram: B. Fibronektīna 1. klastera diferenciācija 44 (FN1-CD44) un CXC motīva ķīmokīna liganda 12-CXC motīva ķīmokīna receptoru 4 (CXCR4CL12-CX).
Turklāt trīs augšupregulēti gēni (spektrīna atkārtojums, kas satur kodola apvalka proteīnu 2, satur proteīnu 2 [SYNE2]S100 kalciju saistošu proteīnu A9 [S100A9] un interferonu inducētu proteīnu, kas satur tetratrikopeptīdu atkārtojumus 3 [IFIT3]) un četri pazemināti regulēti gēni (ribonukleāze 1, kas satur ribonukleāzi 1 [RNASE1] FRANCION1 granulīns [SORBS2]) tika līdzizteikti ar RA saistītajos RBP un ASES.
Šie rezultāti liecina, ka RBP disregulācija var veicināt RA attīstību un nodrošināt potenciālus terapeitiskās iejaukšanās mērķus.
Avoti:
Luo, H.,et al. (2025). RNS saistošo proteīnu regulējošo programmu atšifrēšana reimatoīdā artrīta gadījumā, izmantojot vienas šūnas transkripta analīzi. Acta Materia Medica. doi.org/10.15212/amm-2024-0034.