Ontregeling van RNA-bindende eiwitten bij reumatoïde artritis en osteoartritis

Ontregeling van RNA-bindende eiwitten bij reumatoïde artritis en osteoartritis

Aankondiging van een nieuwe release voorActa Materia MedicaTijdschrift. Single-cell RNA-sequencing (SCRNA-Seq) gegevens uit gepubliceerde datasets werden verkregen om de expressie en ontregeling van RNA-bindende eiwitten (RBPS) te onderzoeken, die cruciaal zijn voor alternatieve mRNA-splitsing en translationele controle bij reumatoïde artritis (RA). Hoe RBP-regulatie verschilt tussen RA en artrose (OA) werd onderzocht met behulp van RBP voor celsubclustering.

Kwantitatieve polymerasekettingreacties (PCR's) werden uitgevoerd om differentieel tot expressie gebrachte RBP's te bevestigen in RA fibroblastische synoviocyten (FLSS) en OA-FLS, evenals in collageen-geïnduceerde artritis (CIA) muizen en controlemuizen. Bovendien werden de bulk-RNA-seq-gegevens verzameld en werden RBP alternatieve splicing events (ASE) co-expressieanalyses uitgevoerd om de potentiële regulerende rol van RA-gerelateerde RBP's met ASS aan het licht te brengen. Significante variaties in de relatieve verhoudingen van celsubtypen werden aangetoond tussen RA en OA, waarbij de RBP's in elk celtype werden gedownreguleerd, de RBP's overreguleerd en een hoge specificiteit voor bepaalde subsets vertoonde. Honderdvijf opwaarts gereguleerde en 133 neerwaarts gereguleerde RBP's werden geïdentificeerd in fibroblasten. Y-box-bindend eiwit 3 (YBX3) en splitsingsfactor 3B-subeenheid 6 (SF3B6) bleken te zijn opgereguleerd in RA-FLS en CIA-muizen) werden gedownreguleerd in RA-FLS. De RA-groep vertoonde sterkere interacties met celtypen vergeleken met de OA-groep met verbeterde signaalroutes zoals: B. Fibronectine 1 cluster van differentiatie 44 (FN1-CD44) en CXC-motief chemokine ligand 12-CXC motief chemokine receptor 4 (CXCL12-CXCR4).

Bovendien werden drie opgereguleerde genen (spectrineherhaling met nucleair envelopeiwit 2, met eiwit 2 [SYNE2]S100 calciumbindend eiwit A9 [S100A9] en door interferon geïnduceerd eiwit met tetratricopeptideherhalingen 3 [IFIT3]) en vier gedownreguleerde genen (ribonuclease 1 [RNASE1]granuline [GRN]Fn1 en sorbine en SH3-domein met 2 [SORBS2]). tot expressie gebracht in RA-geassocieerde RBP's en ASES.
Deze resultaten suggereren dat ontregeling van RBP's kan bijdragen aan de ontwikkeling van RA en potentiële doelwitten kan bieden voor therapeutische interventies.

Bronnen: