Suche
Mein Konto
Dysregulering av RNA-bindende proteiner ved revmatoid artritt og slitasjegikt
Kunngjør en ny publikasjon for magasinet Acta Materia Medica. Enkeltcelle RNA-sekvenseringsdata (SCRNA-Seq) fra publiserte datasett ble innhentet for å undersøke uttrykket og dysreguleringen av RNA-bindende proteiner (RBPS), som er kritiske for alternativ mRNA-spleising og translasjonskontroll ved revmatoid artritt (RA). Hvordan RBP-regulering skiller seg mellom RA og slitasjegikt (OA) ble undersøkt ved bruk av RBP for cellesubklustering. Kvantitative polymerasekjedereaksjoner (PCR) ble utført for å bekrefte differensielt uttrykte RBP i RA fibroblastiske synoviocytter (FLSS) og OA-FLS, så vel som i kollagenindusert artritt (CIA) mus og kontrollmus. I tillegg ble bulk-RNA-seq-dataene samlet inn og RBP alternative spleisingshendelser (ASE) co-ekspresjonsanalyser ble utført for å ...
Dysregulering av RNA-bindende proteiner ved revmatoid artritt og slitasjegikt
Kunngjør en ny utgivelse forActa Materia MedicaMagasin. Enkeltcelle RNA-sekvenseringsdata (SCRNA-Seq) fra publiserte datasett ble innhentet for å undersøke uttrykket og dysreguleringen av RNA-bindende proteiner (RBPS), som er kritiske for alternativ mRNA-spleising og translasjonskontroll ved revmatoid artritt (RA). Hvordan RBP-regulering skiller seg mellom RA og slitasjegikt (OA) ble undersøkt ved bruk av RBP for cellesubklustering.
Kvantitative polymerasekjedereaksjoner (PCR) ble utført for å bekrefte differensielt uttrykte RBP i RA fibroblastiske synoviocytter (FLSS) og OA-FLS, så vel som i kollagenindusert artritt (CIA) mus og kontrollmus. I tillegg ble bulk-RNA-seq-dataene samlet inn og RBP alternative spleisingshendelser (ASE) co-ekspresjonsanalyser ble utført for å avsløre den potensielle regulatoriske rollen til RA-relaterte RBPer med ASD. Signifikante variasjoner i de relative proporsjonene av celleundertyper ble demonstrert mellom RA og OA med RBP nedregulert, RBP overregulert i hver celletype og viser høy spesifisitet for visse undergrupper. Hundre fem oppregulerte og 133 nedregulerte RBPer ble identifisert i fibroblaster. Y-boksbindende protein 3 (YBX3) og spleisingsfaktor 3B underenhet 6 (SF3B6) ble funnet å være oppregulert i RA-FLS og CIA mus) ble nedregulert i RA-FLS. RA-gruppen viste sterkere interaksjoner med celletyper sammenlignet med OA-gruppen med forbedrede signalveier som: B. Fibronectin 1 cluster of differentiation 44 (FN1-CD44) og CXC motiv chemokine ligand 12-CXC motiv chemokine receptor 4 (CXCL12-CXCR).
I tillegg tre oppregulerte gener (spektrinrepetisjon inneholdende kjernekappeprotein 2, inneholdende protein 2 [SYNE2]S100 kalsiumbindende protein A9 [S100A9] og interferonindusert protein inneholdende tetratricopeptidrepetisjoner 3 [IFIT3]) og fire nedregulerte gener (ribonuklease [ribonuklease] og sorbinRNASEGR1N 1 [granF1nRNASEGR1]1 [ SH3-domene som inneholder 2 [SORBS2]) ble samuttrykt i RA-assosierte RBP-er og ASES.
Disse resultatene tyder på at dysregulering av RBP kan bidra til utviklingen av RA og gi potensielle mål for terapeutiske intervensjoner.
Kilder:
Luo, H.,et al. (2025). Dechiffrere de regulatoriske programmene for RNA-bindende proteiner i revmatoid artritt gjennom enkeltcellet transkriptomanalyse. Acta Materia Medica. doi.org/10.15212/amm-2024-0034.